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Les méthodes neuves peuvent contribuer au futur modèle basé sur structure de médicament

Beaucoup de pharmaceutiques fonctionnent à côté de viser ce qui sont connus en tant que « récepteurs G-protéine-accouplés ». Dans une étude neuve, les scientifiques de l'université d'Upsal décrivent comment ils ont pu prévoir comment les molécules spéciales qui peuvent être employées dans l'immunothérapie neuve contre le grippage de cancer à ces récepteurs.

Les méthodes du calcul des chercheurs, présentées dans le tourillon Angewandte Chemie sont une cotisation indispensable au futur modèle basé sur structure de médicament.

les récepteurs G-protéine-accouplés (GPCRs) sont parmi les groupes cibles de protéine d'importance la plus grande pour le développement de médicament. Ces récepteurs réagissent à, par exemple, la lumière, des saveurs, des odeurs, l'adrénaline, l'histamine, la dopamine et une longue liste d'autres molécules en transmettant encore d'autres signes biochimiques à l'intérieur des cellules.

Les chercheurs qui ont effectué l'étude de GPCRs ont été récompensés avec le prix Nobel en chimie en 2012.

Aujourd'hui, approximativement 30 pour cent de tous les médicaments sur le marché ont GPCRs en tant que leurs protéines cibles. Quelques molécules de médicament, telles que la morphine, activent les récepteurs (agonistes) tandis que d'autres, tel que de bêtas inhibiteurs, les inactivent (des antagonistes).

Un GPCR important est le récepteur de l'adénosine A2A. Ses antagonistes peuvent être employés dans l'immunothérapie neuve contre le cancer. En commun avec la compagnie biopharmaceutical Sosei-Heptares, les chercheurs Willem Jespers, Johan Åqvist et Hugo Gutiérrez-De-Terán d'université d'Upsal ont réussi à montrer comment une suite d'antagonistes d'A2A grippe au récepteur et l'inactive.

Avec des simulations dynamiques moléculaires et le calcul des énergies de liaison, il est devenu possible de prévoir comment les molécules de la société pharmaceutique gripperaient aux récepteurs et comment fortement elles font ainsi.

Ensuite, des antagonistes neufs ont été conçus, et synthétisés par des pharmaciens d'université de Saint-Jacques-de-Compostelle, l'Espagne. Des structures en trois dimensions des composés qui forment entre ces molécules et le récepteur ont été alors déterminées expérimental avec la cristallographie de rayon X.

Capable prouvé de calculs d'ordinateur de prévoir la structure et la force obligatoire dans les composés avec la haute précision.

C'est un pas en avant solide, et nous sommes parvenus à prévoir avec la précision grande comment cette famille des molécules grippent le récepteur d'A2A. Nos méthodes de calcul ont maintenant une découverte importante dans le modèle basé sur structure de médicament. »

Hugo Gutiérrez-De-Terán, tête de projet, université d'Upsal

Source:
Journal reference:

Jespers, W., et al. (2020) X-Ray Crystallography and Free Energy Calculations Reveal the Binding Mechanism of A2A Adenosine Receptor Antagonists. Angewadte Chemie. International Edition. doi.org/10.1002/anie.202003788.