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Le séquençage du génome entier peut améliorer le diagnostic et la demande de règlement des patients présentant des maladies rares

Un programme de recherche frayant un chemin l'utilisation du séquençage du génome entier dans les NHS a diagnostiqué des centaines de patients et a découvert des origines génétiques neuves de la maladie. Le séquençage du génome entier est la technologie employée par les 100.000 génomes projettent, un service installé par le gouvernement qui vise à introduire le test diagnostique génétique courant dans les NHS.

La présente étude, aboutie par des chercheurs à l'institut national pour la recherche BioResource de santé avec l'Angleterre génomique, explique cela qui ordonnance les génomes entiers d'un grand nombre de personnes d'une voie normalisée peut améliorer le diagnostic et la demande de règlement des patients présentant des maladies rares.

Les chercheurs ont étudié les génomes des groupes de patients présentant les sympt40mes assimilés, affectant différents tissus, tels que le cerveau, des yeux, le sang ou le système immunitaire. Ils ont recensé un diagnostic génétique pour 60% de personnes dans un groupe de patients présentant la première perte de visibilité.

Le programme, les résultats dont étaient aujourd'hui publié en deux articles dans la nature de tourillon, offerts l'entier-génome ordonnançant comme tests diagnostique aux patients présentant des maladies rares en travers d'un système de santé intégré, un monde d'abord dans la génomique clinique. L'intégration de la recherche génétique avec les systèmes diagnostiques de NHS augmente la probabilité qu'un patient recevra un diagnostic et l'occasion qu'un diagnostic sera fourni dans des semaines plutôt que des mois.

Environ 40.000 enfants sont nés tous les ans avec une maladie héritée rare seul au R-U. Tristement, cela prend plus de deux ans, en moyenne, pour qu'ils soient diagnostiqués. Nous nous sommes sentis qu'il était indispensable de diminuer cette odyssée pour des patients et des parents. Cette recherche prouve qu'un diagnostic génétique plus rapide et meilleur sera possible à plus de patients de NHS. »

Willem Ouwehand, professeur d'hématologie expérimentale à l'université de Cambridge, l'institut national pour l'investigateur principal de recherches BioResource de santé et de sang et de greffe de NHS

Dans l'étude, financée principalement par l'institut national pour la recherche de santé, les génomes entiers de presque 10.000 patients de NHS présentant des maladies rares ont été ordonnancés et recherchés des origines génétiques de leurs conditions. Des différences génétiques précédemment inaperçues entraînant les maladies rares connues ont été recensées, en plus des différences génétiques entraînant les maladies génétiques complet neuves.

L'équipe a recensé plus de 172 millions de différences génétiques dans les génomes des patients, on dont étaient précédemment inconnus. La plupart de ces différences génétiques n'exercent aucun effet sur la santé des personnes, ainsi les chercheurs ont utilisé des méthodes statistiques neuves et des superordinateurs puissants pour rechercher les différences qui entraînent la maladie - quelques cents « pointeaux dans la meule de foin ».

Dans une étude du programme, publié comme article autonome en nature, chercheurs a examiné 886 patients présentant l'immunodéficience primaire - une condition qui affecte la capacité du système immunitaire de combattre des infections par des microbes - et le roman quatre recensé a associé des gènes.

« Fournissant à la meilleure demande de règlement et aux la plupart les soins appropriés pour des patients des troubles immunitaires hérités dépendent absolument d'un diagnostic moléculaire concluant, » dit professeur Adrian Thrasher de l'institut grand de rue d'UCL Ormond des santés de l'enfant (maladie des points blancs) à Londres. « Notre étude explique la valeur du l'entier-génome ordonnançant dans ce contexte et fournit une suite des outils de diagnostic neufs, certains dont ont déjà mené aux soins aux patients améliorés. »

Suivre une méthode neuve d'analyse développée particulièrement pour le projet, l'équipe a recensé 95 gènes en lesquels les différences génétiques rares sont statistiquement très pour être la cause des maladies rares. Des différences génétiques dans au moins 79 de ces gènes ont été montrées définitivement pour entraîner la maladie.

L'équipe a recherché des différences génétiques rares dans presque toutes les 3,2 milliards de lettres d'ADN qui composent le génome de chaque patient. Ceci diffère des tests génomiques cliniques actuels, qui examinent habituellement une petite part de lettres, où des différences génétiques sont pensées très probablement pour entraîner la maladie. En recherchant les chercheurs entiers de génome pouvaient explorer les « contacts et les régulateurs d'éclairage » du génome - les facteurs de régulation dans l'ADN qui règlent l'activité des milliers de gènes.

L'équipe a prouvé que des différences rares dans ces contacts et régulateurs d'éclairage, plutôt que perturbant le gène lui-même, affect si ou non le gène peut être branché à l'intensité correcte. Recensant des altérations génétiques dans les facteurs de régulation qui entraînent la maladie rare n'est pas possible avec les tests génomiques cliniques actuel employés par des services de santé mondiaux. Il est seulement possible si la totalité de code génétique s'analyse pour chaque patient.

« Nous avons prouvé que l'ordonnancement des génomes entiers des patients présentant des maladies rares par habitude dans un système de santé fournit un service diagnostique plus rapide et plus sensible aux patients que l'approche fragmentaire précédente, et, simultanément, il améliore la recherche en matière de génétique pour le futur avantage des patients attendant toujours un diagnostic, » indique M. Ernest Turro de l'université de Cambridge et du NIHR BioResource.

« Grâce aux cotisations des centaines de médecins et chercheurs en travers du R-U et à l'étranger, nous pouvions étudier des patients dans des nombres suffisants pour recenser les causes même très des maladies rares. »

Bien que les différentes maladies rares affectent très une petite partie de la population, là existent des milliers de maladies rares et, ensemble, elles affectent plus de trois millions de personnes au R-U. Pour aborder ce défi, le NIHR BioResource a produit un réseau de 57 hôpitaux de NHS qui se concentrent sur les soins des patients présentant des maladies rares. Presque 1000 médecins et infirmières travaillant à ces hôpitaux ont rendu le projet possible en demandant à leurs patients et, dans certains cas, aux parents des enfants affectés de joindre le NIHR BioResource.

« En installant le projet de NIHR BioResource, nous prenions des mesures inexplorées dans un effort déterminé pour améliorer le diagnostic et la demande de règlement pour des patients dans les NHS et plus très loin » indique M. Louise Wood, directeur de la Science, de recherche et de preuve au ministère de la santé et aux soins sociaux et qui avec le professeur Chris Whitty de médecin-chef a la responsabilité générale de l'institut national pour la recherche de santé.

« Les chercheurs financés par NIHR sur cet état scientifique faisaient partie de ces discussions les plus tôt car nous avons recherché à nous assurer que nous pourrions fournir la science et la transformer en pratique clinique en travers des NHS. Cette recherche a expliqué que les patients, leurs familles et le service de santé peuvent tout tirer bénéfice de mettre l'ordonnancement génomique au premier rang des soins cliniques dans les réglages appropriés.

« Le travail pilote entrepris par les NHS en partenariat avec l'Angleterre génomique et les chercheurs scolaires en travers du R-U a jeté les fondements pour appliquer le même test de génome aux patients avec COVID-19, avec l'espoir de trouver des indices pourquoi quelques patients remarquent une forme si sévère de cette maladie neuve. »

Basé sur les caractéristiques apparaissantes du NIHR actuel BioResource étudiez et d'autres études par l'Angleterre génomique, le gouvernement BRITANNIQUE ont annoncé en octobre 2018 que les NHS offriront l'entier-génome ordonnançant l'analyse pour tous sérieusement des enfants malades avec une affection génétique soupçonnée, y compris ceux avec le cancer. L'ordonnancement des génomes entiers augmentera à un million de génomes par an d'ici 2024.

l'ordonnancement d'Entier-génome sera mis en phase dedans nationalement pour le diagnostic des maladies rares comme « niveau de soins », assurant des soins équivalents en travers du pays.

Les avantages comprennent un diagnostic accéléré pour des patients, coûts réduits pour les services de santé, compréhension améliorée des raisons qu'ils souffrent de la maladie pour des patients et leurs soignants et de la prestation de la demande de règlement améliorée.

Source:
Journal reference:

Turro, E., et al. (2020) Whole-genome sequencing of patients with rare diseases in a national health system. Nature. doi.org/10.1038/s41586-020-2434-2.