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GHGA pour satisfaire le besoin d'accès aux caractéristiques génomiques et phenomic

En Allemagne, il y a actuel un manque d'infrastructure à traiter des caractéristiques biologiques et biomédicales à fort débit, telles que des caractéristiques trouvées dans les dossiers médicaux.

Deux types de données importants sont des caractéristiques génomiques, qui contiennent l'information sur code génétique d'une personne, et des caractéristiques phenomic, qui sont au sujet des traits observables d'une personne, résultant des interactions entre leurs gènes et l'environnement.

Les deux types de données sont déjà produits à grande échelle en travers de l'Allemagne, mais permissible, éthique, et des problèmes techniques limitez l'accès à et la réutilisation de telles caractéristiques pour des recherches.

Les archives humaines allemandes de Génome-Phenome (GHGA), qui a juste reçu un engagement du financement de la fondation allemande DFG de recherches, satisferont le besoin d'accès aux caractéristiques génomiques et phenomic dans un cadre éthique et juridique.

En déterminant une plate-forme allemande d'archives et d'analytique de caractéristiques, les scientifiques allemands auront augmenté des opportunités de participer aux réseaux internationaux principaux de recherches.

La recherche de génome joue un rôle central dans la recherche moderne de santé et contribue déjà à de meilleurs soins aux patients. Dans la cancérologie, par exemple, l'analyse de différents génomes de tumeur peut indiquer des altérations génétiques afin de les traiter avec des traitements visés. Des analyses génomiques sont également de plus en plus employées pour déchiffrer les origines génétiques des maladies rares.

En déterminant une infrastructure normalisée pour traiter le grand volume de données, la communauté de la recherche en Allemagne tirera bénéfice des procédés plus profilés et de la nature centralisée des caractéristiques.

Les archives fourniront des opportunités plus grandes de stimuler le partage des informations responsable dans toute la combinaison de l'Allemagne et de l'Europe. Elles nous permettront également d'améliorer le train le prochain rétablissement des scientifiques dans l'utilisation efficace et responsable des caractéristiques et management des caractéristiques biologiques et biomédicales dans la recherche. »

Janv. Korbel, chef de groupe, laboratoire de biologie moléculaire européen

Korbel est également l'un des directeurs du GHGA. Le consortium, abouti par le DKFZ, rassemble des compétences de l'autre côté de l'Allemagne et de l'Europe, y compris l'EMBL. Il établit en circuit et étend les infrastructures fiables et sécurisées de exister de calcul haute performance pour former un réseau des moyeux de caractéristiques que les scientifiques allemands pourront atteindre.

Cette infrastructure nationale sera branchée aux instituts produisant des caractéristiques dans l'ensemble de l'Allemagne, et rendra les caractéristiques accessibles d'une façon sans joint.

« Nous sommes fiers que l'EMBL fasse partie de ce consortium, » dit Oliver Stegle, un autre directeur du GHGA, lié au DKFZ et à l'EMBL. « Nous portons nos compétences à la table en traitant de grands ensembles de données génomiques des institutions multiples.

Pendant des décennies, l'EMBL a été un défenseur grand de l'archivage et de l'échange, et nous sommes très heureux que nous avons maintenant l'opportunité de contribuer à une meilleure diffusion des caractéristiques génomiques en Allemagne. »

« Le GHGA agira l'un sur l'autre attentivement avec les archives européennes de Génome-Phenome à EMBL-EBI, et participe comme noeud dans le réseau de fédération de l'EGA de contrat à terme. Cette structure nouvelle activera un échange plus rapide des caractéristiques génomiques humaines de recherches d'Allemagne avec les communautés internationales, » dit Korbel.

Le consortium de GHGA travaillera attentivement avec éthique et des experts juridiques pour assurer les niveaux les plus élevés du traitement de données et de la protection des données. Les archives amplifieront la recherche de génome en Allemagne, permettant à des compétences allemandes de recherches d'avancer des efforts de recherche plus larges en travers de l'Europe.