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Outil neuf pour augmenter l'accessibilité pour le contrôle COVID-19

Un organisme de recherche de l'Université de Californie Santa Barbara a récent expliqué de méthode rentable, simple, et beaucoup moins toxique pour isoler l'hôte et les acides nucléiques et les protéines d'agent pathogène afin de profiler le dépistage de l'ADN et des virus ARN - comprenant le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère. Leurs découvertes sont actuellement disponibles sur le serveur de prétirage de bioRxiv*.

La crise de santé appuyante de la pandémie actuelle de la maladie de coronavirus (COVID-19), provoquée par SARS-CoV-2, a eu non seulement en morbidité globale significative et mortalité mais également comme conséquence des conséquences économiques et sociales sévères.

L'arme primaire dans notre combat contre cette pandémie est une approche répandue et possible de contrôle pour surveiller le fardeau SARS-CoV-2 et l'écart, qui est nécessaire pour aviser par la suite des mesures adéquates d'endiguement et d'atténuation.

Cependant, le contrôle mondial écaillé est toujours un besoin brûlant et imprévisible de santé publique ; de plus, beaucoup de tentatives de répondre à cette demande ont mené aux pénuries d'alimentations et réactifs qui sont nécessaires pour l'échantillon traitant, extraction d'ARN, et, consécutivement, obtenir rapidement des résultats de test.

En d'autres termes, les nécessaires d'extraction sont devenus un moyen limiteur pour le contrôle SARS-CoV-2, qui a incité l'augmentation de techniques et de protocoles alternatifs d'isolement de l'ARN SARS-CoV-2 qui évitent entièrement l'opération d'extraction d'ARN.

Pour s'adresser en outre à cette édition, aux chercheurs de l'Université de Californie Santa Barbara développé récemment une méthode plutôt simple pour isoler les acides nucléiques et les protéines des cellules et des virus connus sous le nom de PERLE (c.-à-d., un acronyme pour la recherche améliorée d'analyte de précipitation).

Comment des travaux de PERLE et comment a-t-elle été évaluée ?

En un mot, la PERLE utilise une solution détergent détergent non ionique de lysis pour les membranes cellulaires de perturbation et les enveloppes virales, fournissant en même temps révise favorable pour la précipitation à base d'alcool et la recherche de l'ADN, de l'ARN, et des protéines.

Par conséquent, la PERLE peut être vue comme petit prix et approche fléau fléau pour isoler les acides nucléiques et les protéines à l'aide seulement des réactifs de laboratoire courants. Mais des méthodes simplifiées doivent fournir la fiabilité assimilée afin de pour être reçues universellement.

Pour évaluer leur méthode proposée, les chercheurs ont extrait l'ARN des échantillons De-recensés positifs pour SARS-CoV-2 à l'aide de les deux développent neuf l'approche de PERLE et un nécessaire normal utilisé et spécifique d'extraction d'ARN.

Leur prochaine opération était d'utiliser l'ARN d'isolement pour étudier les niveaux du gène de la nucléoprotéine SARS-CoV-2, ainsi que le matériel génétique de la ribonucléase P d'hôte dans les échantillons. Le test transcription-quantitatif inverse en une étape de référence d'amplification en chaîne par polymérase pour COVID-19 (recommandé par la CDC des USA) a été alors appliqué.

Après contrôle de différents échantillons aux rapports de Perle-lysis-solution, les chercheurs ont observé que la PERLE a exigé plutôt d'une petite augmentation dans l'entrée de premier prélèvement (1.25-fold) d'atteindre la sensibilité apparentée au nécessaire commercial d'extraction d'ARN utilisé dans cette étude.

Synthèse de PERLE. B) Analyse Droite-qPCR comparative des niveaux du nucleocapsid SARS-CoV-2 et séquences d
Synthèse de PERLE. B) Analyse Droite-qPCR comparative des niveaux du nucleocapsid SARS-CoV-2 (N1) et séquences d'ARN de RNaseP dans quatre échantillons SARS-CoV-2 positifs De-recensés après extraction d'ARN utilisant la PERLE ou un nécessaire spécifique d'extraction d'ARN (QIAamp mini éluent le nécessaire de rotation de virus). Les échantillons correspondants sont de code à couleurs. Les lignes noires indiquent la médiane. P = 0,72 (N1), P = 0,56 (RNaseP), t-test.

Une technique évolutive, rapide et fiable

« Nos résultats indiquent que la PERLE facilite le dépistage des transcriptions SARS-CoV-2 dans les échantillons positifs de l'écouvillon COVID-19 avec la sensibilité comparable à cela accordée par les nécessaires disponibles dans le commerce d'extraction d'ARN », disent des auteurs d'étude en leur papier de bioRxiv.

Ces résultats particuliers mettent l'accent sur la plausibilité d'employer la PERLE comme alternative faisable pour faciliter et avancer le dépistage sensible de SARS-CoV-2 dans les échantillons de patients respiratoires avec COVID-19.

Un avantage complémentaire de PERLE par rapport aux méthodes disponibles dans le commerce fléau fléau d'extraction d'ARN est la possibilité de récupérer des protéines à côté des acides nucléiques. Naturellement, ceci élargit les possibilités d'application potentielles de ce puissant outil pour trouver beaucoup de divers virus.

Par conséquent, ni le matériel spécialisé ni le personnel fortement qualifié n'est justifié, alors que les conditions traitantes minimales rendent la PERLE très évolutive - qui est en effet désirable pour des fonctionnements de contrôle à fort débit grandement nécessaires dans cette pandémie.

Barrages de route potentiels sur la route à la mise en place de courant principal

Bien que la recherche pour desserrer ces réclamations soit solide, certaines oppositions doivent être tenues compte. Par exemple, il y a une possibilité que le support de ramassage utilisé pour le stockage d'échantillon avant de traiter peut considérablement influencer le rendement de la PERLE.

En outre, la polarisation d'extraction introduite par la PERLE ne peut pas être exclue, car sous peu RNAs - comprenant le transport, le petit RNAs nucléolaire et et micro - soyez beaucoup plus encombrant pour précipiter par rapport à un plus long ADN et à des molécules d'ARN.

Par conséquent, les améliorations complémentaires peuvent être nécessaires pour mettre en application entièrement la PERLE comme outil d'isolement d'acide nucléique et de protéine de courant principal pour trouver d'autres virus d'autres sources (puisque le type témoin peut de manière significative influencer la performance globale).

Mais prenant en considération tout, il est bien évident que la PERLE puisse offrir une alternative accessible pour profiler diagnostique dans les situations géographiques qui manquent de la capacité professionnelle de laboratoire et atteignent même aux réactifs spécialisés.

Ceci signifie que la barre élevée « du contrôle de luxe » peut finalement être abaissée à beaucoup de différentes parties du monde. Et rien n'est nécessaire plus dans les temps où la pandémie COVID-19 semble toujours comme un combat ascendant.

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Dr. Tomislav Meštrović

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Dr. Tomislav Meštrović

Dr. Tomislav Meštrović is a medical doctor (MD) with a Ph.D. in biomedical and health sciences, specialist in the field of clinical microbiology, and an Assistant Professor at Croatia's youngest university - University North. In addition to his interest in clinical, research and lecturing activities, his immense passion for medical writing and scientific communication goes back to his student days. He enjoys contributing back to the community. In his spare time, Tomislav is a movie buff and an avid traveler.

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