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Las co-infecciones virales y bacterianas son penetrantes en los pacientes severos COVID-19

Un grupo grande de investigadores de China caracterizó co-infecciones microbianas en las vías respiratorias de los pacientes hospitalizados de la enfermedad del coronavirus (COVID-19) y demostró recientemente una alta incidencia de co-infecciones virales y bacterianas - determinado en los individuos que presentaban con enfermedad severa. Sus conclusión están actualmente disponibles en el servidor de la prueba preliminar del medRxiv* y pueden servir perfeccionar regímenes de tratamiento empíricos.

El pandémico en curso COVID-19, causado por el coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática, plantea una amenaza severa para la salud pública y la economía global. A principios de julio de 2020, había más de 11 millones de casos confirmados y más de 500 mil muertes por todo el mundo.

Micrográfo de electrón nuevo de la exploración de Coronavirus SARS-CoV-2 Colorized de una célula infectada pesado con las partículas del virus SARS-CoV-2 (amarillo), aisladas de una muestra paciente. La imagen capturada en el NIAID integró el centro de investigación en el fuerte Detrick, Maryland. Haber: NIAID
Micrográfo de electrón nuevo de la exploración de Coronavirus SARS-CoV-2 Colorized de una célula infectada pesado con las partículas del virus SARS-CoV-2 (amarillo), aisladas de una muestra paciente. Imagen capturada en el centro de investigación integrado de NIAID (IRF) en el fuerte Detrick, Maryland. Haber: NIAID

COVID-19 afecta sobre todo a las vías respiratorias y causa la pulmonía viral que puede progresar al síndrome de señal de socorro respiratoria agudo. Sin embargo, la infección es acompañada con frecuencia por síntomas gastrointestinales tales como dolor, diarrea, o vomitar abdominal. Recientemente, fue probado que SARS-CoV-2 auténtico infecta el aparato gastrointestinal humano.

Pero la pregunta sigue siendo si SARS-CoV-2 es solamente responsable de todos los escenarios de la severidad y las manifestaciones de COVID-19 o de las co-infecciones microbianas pueden tener cierto efecto sobre el resultado clínico de los individuos de SARS-CoV-2-infected.

Por lo tanto, simultáneamente aplicando las culturas, análisis colorimétricos, y secuencia metatranscriptomic, un grupo grande de investigadores chinos evaluó co-infecciones microbianas en una cohorte de 23 pacientes hospitalizados COVID-19 de Guangdong (una provincia en la parte más situada más al sur de China).

Perfiles virales del ARN en los especímenes clínicos de pacientes hospitalizados con COVID-19
Perfiles virales del ARN en los especímenes clínicos de pacientes hospitalizados con COVID-19

De métodos cultura-basados clásicos a la tecnología avanzada

En 2020, entre el 27 de enero y 26 de febrero (poco después del brote comenzado), los especímenes clínicos seriales - sobre todo paso y lampazos nasales, esputo y lampazos anales - cerco a partir del 8 suavemente y de 15 seriamente enfermos, pacientes hospitalizados COVID-19. Todos necesitaron la ventilación mecánica y fueron admitidos a la Unidad de Cuidados Intensivos.

Después de extraer el ácido ribonucleico total (ARN), la secuencia metatranscriptomic ultra-profunda fue realizada conjuntamente con diversos análisis del diagnóstico del laboratorio. Determinaron a la abundancia de comunidades y de regímenes microbianos diversos de la co-infección en la cohorte antedicha de los pacientes COVID-19.

Antes de determinar especificidades del virome y del microbiota, el software especializado fue empleado para filtrar el ARN ribosomal microbiano de datos metatranscriptomic no humanos. Además, para comparar la expresión nivela entre diversos genes, normalización de los niveles de la expresión génica del objetivo fue realizada entre todos los genes descubiertos de la virulencia.

Acciones recíprocas entre el ordenador principal, el SARS-CoV-2 y el microbiota

En pocas palabras, este estudio encontró co-infecciones microbianas respiratorias en 84,6% increíbles de los pacientes seriamente enfermos, donde las co-infecciones bacterianas y virales fueron descubiertas por la aproximación de secuencia ya mencionada en 69,2% y 30,8% de los pacientes, respectivamente.

Además, en 23,1% de los pacientes, las co-infecciones bacterianas con el complejo del cepacia de Burkholderia y la epidermitis del estafilococo fueron confirmadas usando cultura bacteriana clásica. Un paciente seriamente enfermo también demostró una infección secundaria, dependiente del tiempo con el cenocepacia del B. que abrigaba una panoplia de genes de la virulencia, que se pueden conectar al deterioro y a la muerte de la enfermedad un mes después de la admisión de hospital.

El bacteri de la epidermitis del estafilococo. Haber de imagen: royaltystockphoto.com/Shutterstock
El bacteri de la epidermitis del estafilococo. Haber de imagen: royaltystockphoto.com/Shutterstock

La “detección y la búsqueda de las infecciones nosocomiales complejo-asociadas del cepacia de Burkholderia se recomiendan para perfeccionar el régimen de tratamiento con derecho preferente y reducir resultados fatales de los pacientes hospitalizados infectados con SARS-CoV-2”, más futuro acentúa a autores del estudio.

Por otra parte, los investigadores observaron niveles extremadamente altos de la expresión de especies bacterianas del orale del micoplasma en dos pacientes seriamente enfermos con retén prolongado en la Unidad de Cuidados Intensivos (es decir, más de 30 días). Estos resultados apuntan a la posibilidad de la co-infección Micoplasma-asociada en los pacientes COVID-19 con la enfermedad severa, que autoriza nuestra atención creciente.

“Las transcripciones dominantes de Proteobacteria en la tripa de los casos suaves COVID-19 del naïve antibiótico del tratamiento en esto estudio, así como los cambios microbianos de la tripa marcada durante infecciones virales respiratorias en los prediabetes denunciados en un estudio multi-omics longitudinal reciente, ambos soportan las acciones recíprocas entre el ordenador principal, virus respiratorios y el microbiota comensal”, agrega a autores del estudio, corroborando el eslabón entre COVID-19 y los síntomas gastrointestinales.

Configuraciones de las decisiones de información del tratamiento de la co-infección

Este estudio ambicioso e intrigante manejó determinar configuraciones distintas y bastante interesantes de co-infecciones. Más concretamente, no sólo SARS-CoV-2 fue encontrado con frecuencia en la correlación con una miríada de microbios patógenos respiratorios en los pacientes hospitalizados COVID-19, pero él podría también ser conectado a la severidad de la enfermedad.

Por otra parte, las conclusión demuestran el valor de usar el metatranscriptomics para la co-detección imparcial de patógeno respiratorios, así como de ofrecer la información oportuna y útil para vigilar y manejar co-infecciones bacterianas en los pacientes seriamente enfermos COVID-19.

Sin embargo, sin tener especímenes del tratamiento previo, es desafiador comprobar en qué medida las diferencias encontradas en las configuraciones microbianas respiratorias (asociadas a las infecciones SARS-CoV-2) reflejan real la enfermedad o el tratamiento antimicrobiano - o ambos.

“Aún, nuestros resultados sugieren que las comunidades bacterianas distintas descubiertas en el aparato respiratorio y gastrointestinal de los pacientes seriamente enfermos pudieran relacionarse con la desorganización importante del microbiota humano normal causado por el tratamiento con los antibióticos, permitiendo la colonización por las bacterias resistentes a los antibióticos patógenas,” dijeron a autores del estudio en su papel del medRxiv.

En todo caso, la atención de la comunidad científica global y del público se debe dirigir hacia amenazas futuras potenciales de un depósito que brota de los microorganismos antimicrobiano-resistentes y de los genes asociados que seguirán indudablemente el pandémico COVID-19.

Advertencia *Important

el medRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

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Dr. Tomislav Meštrović

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Dr. Tomislav Meštrović

Dr. Tomislav Meštrović is a medical doctor (MD) with a Ph.D. in biomedical and health sciences, specialist in the field of clinical microbiology, and an Assistant Professor at Croatia's youngest university - University North. In addition to his interest in clinical, research and lecturing activities, his immense passion for medical writing and scientific communication goes back to his student days. He enjoys contributing back to the community. In his spare time, Tomislav is a movie buff and an avid traveler.

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