Avertissement : Cette page est une traduction automatique de cette page à l'origine en anglais. Veuillez noter puisque les traductions sont générées par des machines, pas tous les traduction sera parfaite. Ce site Web et ses pages Web sont destinés à être lus en anglais. Toute traduction de ce site et de ses pages Web peut être imprécis et inexacte, en tout ou en partie. Cette traduction est fournie dans une pratique.

Les réseaux d'expression du gène marquent les objectifs thérapeutiques potentiels pour SARS-CoV-2

Une équipe de recherche internationale du Canada, d'Australie, des Pays-Bas, et des Etats-Unis a recensé des douzaines de gènes qui pourraient contribuer à la pathologie de la maladie 2019 (COVID-19) de coronavirus et servir d'objectifs thérapeutiques potentiels.

Les gènes Co-sont exprimés avec deux protéines que le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère emploie pour gagner l'entrée de cellule hôte. Plusieurs de ces gènes pourraient potentiellement être visés avec des médicaments qui sont déjà procurables.

Molécule de protéase principale du coronavirus SARS-CoV-2, illustration 3D. Crédit d
Molécule de protéase principale du coronavirus SARS-CoV-2, illustration 3D. Crédit d'image : Kateryna Kon/Shutterstock

Utilisant des bases de données de bio-informatique, Ana Hernandez Cordero (université de Colombie-Britannique) et les collègues ont étudié la biologie des gènes. Ils ont recensé les interactions de médicament-gène qui pourraient être explorées pour aider la promotion accélérée le développement de la thérapeutique COVID-19.

L'équipe dit les expositions d'étude comment in silico les approches de calcul peuvent aider à recenser rapidement les médicaments potentiels qui pourraient repurposed en tant que demandes de règlement COVID-19.

« Vu l'écart exponentiel de COVID-19 en travers du globe et l'augmentation sans précédent dans les morts, une telle rapidité est nécessaire pour notre combat actuel contre la pandémie, » écrivent les auteurs.

Une version de prétirage du papier est procurable sur le bioRxiv* de serveur, alors que l'article subit l'inspection professionnelle.

Niveau de corrélation et annotation des gènes de TMPRSS2-correlated. Chaque barre représente un gène unique (tout avec le druggability raye la rangée 1-3 12), et le coefficient de corrélation de Pearson (r) entre le gène et TMPRSS2 dans le module est montré sur l
Niveau de corrélation et annotation des gènes de TMPRSS2-correlated. Chaque barre représente un gène unique (tout avec le druggability raye la rangée 1-3 12), et le coefficient de corrélation de Pearson (r) entre le gène et TMPRSS2 dans le module est montré sur l'axe des y. Les couleurs des barres représentent l'information biologique combinée : le vert (groupe A1) représente des gènes liés aux maladies humaines a basé l'hérédité mendélienne en ligne dans des bases de données (OMIM) de l'homme et de ClinVar ; l'orange (groupe A2) sont des gènes liés aux maladies humaines, qui ont également l'information phénotypique sur des modèles de précipitation ou de souris de coup de grâce basés sur la base de données d'informatique de génome (MGI) de souris ; le pourpre (groupe A3) représente des gènes liés aux maladies humaines et aux variants génétiques associés aux traits 14 de fonction pulmonaire ; le rose (groupe A4) représente des gènes liés à la maladie humaine, avec l'information phénotypique sur la précipitation ou la souris de coup de grâce, et les variants génétiques liés à la fonction pulmonaire.

Accélération de l'identification des objectifs potentiels de médicament

Depuis les personnes SARS-CoV-2 premier infectées à Wuhan, la Chine, tard l'année dernière, il a rapidement écarté en travers du globe infectant des millions et détruisant des centaines de milliers.

Les chercheurs mondiaux avaient emballé pour développer des traitements efficaces, en particulier pour la maladie sévère. Cependant, elle peut prendre des mois ou des années et des milliards de dollars d'investissement pour développer des demandes de règlement et un vaccin, qui peuvent éventuel pour être efficaces.

« Bioinformatic s'approche, cependant, pouvez recenser rapidement les interactions appropriées de gène-médicament qui peuvent contribuer à la compréhension des mécanismes du viral infection et ramener le temps à trouver les objectifs potentiels de médicament et les médicaments existants qui pourraient repurposed pour ce signe, » écrivez Cordero et collègues.

Pour que SARs-CoV-2 gagne l'entrée virale, sa protéine de pointe doit gripper l'enzyme de conversion de l'angiotensine 2 (ACE2) et subir l'amorçage suivant par la protéase de transmembrane, la sérine 2 (TMPRSS2).

Vu que la disponibilité de ces protéines est une opération régime-limiteuse dans le procédé d'infection, une compréhension détaillée d'ACE2 et la biologie TMPRSS2 pourrait aider à recenser les objectifs thérapeutiques potentiels.

Maintenant, utilisant les 1.038 prélèvements de tissu de poumon, Cordero, et collègues ont effectué une analyse réseau d'expression du gène pour recenser et vérifier la Co-expression d'ACE2 et de TMPRSS2.

Que les auteurs ont-ils trouvé ?

Les réseaux du gène ACE2 et TMPRSS2 qui ont été établis ont contenu les gènes qui pourraient contribuer à la pathophysiologie de COVID-19.

Douze gènes marqués par ACE-2 ont été déjà connus pour agir l'un sur l'autre avec des médicaments existants. Un exemple était DPP4, qui code la dipeptidyl-peptidase 4. de glycoprotéine. Cette protéine joue une fonction clé dans le métabolisme de glucose et d'insuline et est associée au diabète, qui est maintenant un facteur de risque réputé pour la maladie sévère et la mortalité dans COVID-19.

DPP-4 est également le récepteur employé par le coronavirus respiratoire de syndrome (MERS) de Moyen-Orient pour gagner l'entrée de cellule hôte, et les chercheurs ont étudié son interaction avec des douzaines de composés existants.

« À cause des similitudes entre MERS et SARS-Cov-2, ceci est un objectif potentiel intéressant, en particulier pour des patients présentant le diabète, » a dit Cordero et collègues.

Un autre gène d'ACE2-correlated qui pourrait être un objectif passionnant était IL13RA2, qui code la sous-unité alpha-2 du récepteur interleukin-13 (IL-13). L'IL-13 est un effecteur réputé du procédé de remodelage des voies aériennes dans l'asthme et est également impliqué dans la bronchopneumopathie chronique obstructive et la Fibrose pulmonaire idiopathique.

« IL-13 258 et les voies DPP-4 ont pu être des possibilités intrigantes pour la thérapeutique COVID-19 nouvelle, » écrit l'équipe.  

Que diriez-vous de TMPRSS2 ?

Les chercheurs ont constaté que 53 des gènes de TMPRSS2-correlated ont été déjà connus pour agir l'un sur l'autre avec des médicaments existants. Un exemple était CD55, qui code pour un inhibiteur de l'activation de complément.

Le système complémentaire peut déclencher une condition hyperinflammatory en réponse au viral infection, et CD55 empêche la formation de la composante 3 (C3) de complément.

Les chercheurs ont prouvé que les souris déficientes en C3 ont des niveaux plus bas des cytokines inflammatoires dans leurs poumons et moins de dysfonctionnement respiratoire.

« Ainsi, il est possible que la prévention de la formation de C3 par l'intermédiaire de CD55 pourrait être avantageuse dans COVID-19, » disent les auteurs. De nouveau, les composés qui sont connus pour viser particulièrement CD55 existent déjà, ils ajoutent.

Rapide-rail du développement de la thérapeutique COVID-19

Cordero et collègues indiquent que les douzaines de gènes Co-exprimant ACE2 et TMPRSS2 ont des associations plausibles avec la pathophysiologie de COVID-19, et bon nombre d'entre eux pourraient potentiellement être visés avec des médicaments existants, aidant de ce fait la « promotion accélérée le développement de la thérapeutique COVID-19. »

En outre, « in silico les approches de calcul peuvent mener à l'identification rapide des médicaments potentiels, qui pourraient repurposed comme demandes de règlement contre COVID-19, » elles concluent.  

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally first developed an interest in medical communications when she took on the role of Journal Development Editor for BioMed Central (BMC), after having graduated with a degree in biomedical science from Greenwich University.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Robertson, Sally. (2020, July 07). Les réseaux d'expression du gène marquent les objectifs thérapeutiques potentiels pour SARS-CoV-2. News-Medical. Retrieved on October 21, 2021 from https://www.news-medical.net/news/20200707/Gene-expression-networks-flag-potential-therapeutic-targets-for-SARS-CoV-2.aspx.

  • MLA

    Robertson, Sally. "Les réseaux d'expression du gène marquent les objectifs thérapeutiques potentiels pour SARS-CoV-2". News-Medical. 21 October 2021. <https://www.news-medical.net/news/20200707/Gene-expression-networks-flag-potential-therapeutic-targets-for-SARS-CoV-2.aspx>.

  • Chicago

    Robertson, Sally. "Les réseaux d'expression du gène marquent les objectifs thérapeutiques potentiels pour SARS-CoV-2". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20200707/Gene-expression-networks-flag-potential-therapeutic-targets-for-SARS-CoV-2.aspx. (accessed October 21, 2021).

  • Harvard

    Robertson, Sally. 2020. Les réseaux d'expression du gène marquent les objectifs thérapeutiques potentiels pour SARS-CoV-2. News-Medical, viewed 21 October 2021, https://www.news-medical.net/news/20200707/Gene-expression-networks-flag-potential-therapeutic-targets-for-SARS-CoV-2.aspx.