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Contrôle génomique rapide de SARS-CoV-2 santé-associé

Le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère cette maladie des causes COVID-19 a infecté plus de 13,7 millions de personnes et pris plus de 589.000 durées autour du monde. Le virus nouveau a été la première fois trouvé fin décembre l'année dernière à Wuhan Chine et a depuis lors été des défis les plus grands de santé publique dans la mémoire récente. Un des la plupart des impacts importants de cette pandémie est aux systèmes de santé. La nature hautement infectieuse du virus a entraîné la propagation rapide de l'infection parmi des communautés dans presque tous les pays, et avec des milliers obtenant l'hospitalisation, les soins intensifs, et la ventilation de exigence sévèrement mauvais, les systèmes de santé sont accablés dans des pays développés ainsi qu'en voie de développement. Maintenant, les chercheurs ont fourni un test de ordonnancement génomique rapide pour recenser et stratifier des infections santé-associées.

Les chercheurs de l'université de Cambridge, Cambridge Royaume-Uni ont publié leurs découvertes dans une étude intitulée, « mise en place rapide de SARS-CoV-2 ordonnançant pour vérifier des cas de COVID-19 santé-associé : une étude génomique estimative de contrôle, » dans la dernière question des maladies infectieuses de The Lancet. Cette étude sur la génomique COVID-19 au R-U a été financée par le ministère de la santé et les soins sociaux, la recherche et l'innovation BRITANNIQUE, et l'institut de Wellcome Sanger.

Micrographe électronique nouveau de lecture du coronavirus SARS-CoV-2 Colorized d
Micrographe électronique nouveau de lecture du coronavirus SARS-CoV-2 Colorized d'une cellule fortement infectée avec des particules du virus SARS-CoV-2 (jaune), d'isolement dans un échantillon patient. L'endroit noir dans l'image est l'espace extracellulaire entre les cellules. L'image saisie au NIAID a intégré l'installation de recherches (IRF) dans le fort Detrick, le Maryland. Crédit : NIAID

Ordonnançant les souches virales - pourquoi est-il nécessaire ?

SARS-CoV-2 est un virus ARN et rapidement des répliques quand il infecte un hôte. Pendant qu'il reproduit chez l'homme, il subit une mutation, et les tensions deviennent diverses avec le temps. Actuellement, a écrit les chercheurs, le régime de la mutation du virus SARS-CoV-2 est « approximativement 2·5 nucléotides par mois ».

Les chercheurs ont expliqué que les génomes de ces souches virales doivent être ordonnancés pour obtenir des informations sur le pouvoir infectant et la biologie afin de développer des médicaments et des vaccins contre elle. L'ordonnancement génomique peut également indiquer les tensions des lignées des virus qui diffusent dans les populations humaines autour du monde et leur choc sur les résultats des patients. Les changements du génome SARS-CoV-2 montrent également la réussite des mesures de contrôle et comment le virus répond aux interventions et aux mesures de contrôle.

infections Santé-associées

les infections Santé-associées sont ceux qui peuvent affecter le personnel ainsi que les patients de santé. Parmi des patients, elle peut affecter la morbidité ou la maladie et également le régime des morts, et parmi les professionnels de la santé également, elle peut également affecter la « maladie et moral de personnel. » L'un ou l'autre de voie, les infections santé-acquises peut porter préjudice aux soins aux patients écrivent les chercheurs. Ainsi le dépistage de la santé acquièrent des infections au plus tôt est indispensable, ils a écrit. Jusqu'à présent, plus de 22.000 professionnels de la santé ont été infectés par des tensions infectieuses santé-acquises, et l'Organisation Mondiale de la Santé (WHO) pense ces numéros pour être un underestimate brut.

Qu'a été fait ?

Des études sur le contrôle de génome de SARS-COV-2 ont été assemblées vers le haut du jusqu'au 11 mai 2020th . Le but de cette étude était d'employer SARS-CoV-2 rapide ordonnançant en épidémiologie de ces infections santé-associées et de définir des mesures de contrôle nécessaires d'infection.

C'était une étude prospective où l'équipe a employé « le nanopore SARS-CoV-2 rapide ordonnançant » des échantillons de virus obtenus à partir de ceux qui étaient positifs sur la réaction en chaîne inverse de transcription-polymérase (RT-PCR). Les échantillons étaient des hôpitaux dans l'est de l'Angleterre. L'ordonnancement a été complété dans un délai de 24 heures de recevoir les échantillons. Chaque semaine un examen des états a été déterminé, et l'épidémiologique, ainsi que la caractéristique génomique, a été partagée pour examiner les cas COVID-19 santé-associés et les tensions liés à eux.

Qu'a été trouvé ?

L'étude a été entreprise entre le 13 marsth et le 24 avril 2020th , et un total de 5.613 échantillons patients ont été obtenus pendant ce temps. De ces derniers, 1.000 échantillons ont été ordonnancés, et des caractéristiques génomiques de haute qualité ont été obtenues à partir de 747 échantillons. La caractéristique épidémiologique et génomique a été combinée dans 299 patients de l'hôpital d'hôte.

L'équipe a constaté qu'il y avait 35 boîtiers des virus qui étaient identiques. Ceux-ci ont été obtenus à partir de 159 patients. Ils ont davantage noté ce 58 pour cent ou 92 des 159 patients ont eu la preuve épidémiologique marquante intense, alors que 20 pour cent ou 32 patients avaient des tiges épidémiologiques possibles.

Comme prochaine opération, les chercheurs ont fourni leurs caractéristiques aux autorités de contrôle d'infection et aux équipes d'administration cliniques d'hôpital. Des polices sur le contrôle d'infection ont été ainsi modifiées, et l'enregistrement patient de sécurité a été également amendé en conséquence.

Conclusions et implications

Les auteurs ont avec succès déterminé le contrôle génomique en temps réel du virus et l'ont également marqué avec les découvertes épidémiologiques. Ceci pourrait aider à comprendre les infections santé-associées qu'ils ont écrites et également « recensez les opportunités de viser des interventions de prévention de l'infection pour réduire des infections santé-associées davantage. » L'équipe déconnectée, « nos découvertes ont des implications importantes pour la politique sanitaire publique nationale pendant qu'elles activent le rail de rapid et l'enquête sur les infections dans des réglages d'hôpital et de communauté. »

Journal reference:
Dr. Ananya Mandal

Written by

Dr. Ananya Mandal

Dr. Ananya Mandal is a doctor by profession, lecturer by vocation and a medical writer by passion. She specialized in Clinical Pharmacology after her bachelor's (MBBS). For her, health communication is not just writing complicated reviews for professionals but making medical knowledge understandable and available to the general public as well.

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