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Fiscalização genomic rápida de SARS-CoV-2 cuidados médicos-associado

O coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2) que essa doença das causas COVID-19 contaminou sobre 13,7 milhão indivíduos e tomou mais de 589.000 vidas em todo o mundo. O vírus novo foi detectado primeiramente ao fim de dezembro no ano passado em Wuhan China e tem desde então tornado dos grandes desafios da saúde pública na memória recente. Um dos impactos os mais significativos desta pandemia é aos sistemas de saúde. A natureza altamente infecciosa do vírus causou a propagação rápida da infecção entre as comunidades em quase todos os países, e com os milhares que obtêm a hospitalização, cuidados intensivos, e a ventilação de exigência severamente doentes, os sistemas de saúde são oprimidos em nações desenvolvidas assim como tornando-se. Agora, os pesquisadores vieram acima com um teste arranjando em seqüência genomic rápido identificar e estratificar infecções cuidados médicos-associadas.

Os pesquisadores da universidade de Cambridge, Cambridge Reino Unido publicaram seus resultados em um estudo intitulado, “aplicação rápida de SARS-CoV-2 que arranja em seqüência para investigar casos de COVID-19 cuidados médicos-associado: um estudo genomic em perspectiva da fiscalização,” na introdução a mais atrasada de doenças infecciosas de The Lancet. Este estudo na genómica COVID-19 no Reino Unido foi financiado pelo departamento do cuidado de saúde e social, pesquisa e inovação BRITÂNICA, e o instituto de Wellcome Sanger.

Micrografia de elétron nova da exploração de Coronavirus SARS-CoV-2 Colorized de uma pilha contaminada pesadamente com as partículas do vírus SARS-CoV-2 (amarelo), isoladas de uma amostra paciente. A área preta na imagem é espaço extracelular entre as pilhas. A imagem capturada no NIAID integrou a instalação de investigação no forte Detrick, Maryland. Crédito: NIAID
Micrografia de elétron nova da exploração de Coronavirus SARS-CoV-2 Colorized de uma pilha contaminada pesadamente com as partículas do vírus SARS-CoV-2 (amarelo), isoladas de uma amostra paciente. A área preta na imagem é espaço extracelular entre as pilhas. A imagem capturada no NIAID integrou a instalação de investigação (IRF) no forte Detrick, Maryland. Crédito: NIAID

Arranjando em seqüência as tensões virais - por que é necessário?

SARS-CoV-2 é um vírus e ràpida replicates do RNA quando contamina um anfitrião. Enquanto replicates nos seres humanos, transforma-se, e as tensões tornam-se diversas com o passar do tempo. Presentemente, escreveu os pesquisadores, a taxa de mutação do vírus SARS-CoV-2 é “aproximadamente 2·5 nucleotides pelo mês”.

Os pesquisadores explicaram que os genomas destas tensões virais precisam de ser arranjados em seqüência para obter a informação sobre a infectividade e a biologia a fim desenvolver drogas e vacinas contra ela. Arranjar em seqüência Genomic pode igualmente revelar as tensões das linhagens dos vírus que estão circulando nas populações humanas em todo o mundo e de seu impacto no resultado dos pacientes. As mudanças no genoma SARS-CoV-2 igualmente mostram o sucesso das medidas de controle e como o vírus está respondendo às intervenções e às medidas de controle.

infecções Cuidados médicos-associadas

as infecções Cuidados médicos-associadas são aquelas que podem afectar os pessoais assim como os pacientes de cuidados médicos. Entre pacientes, podem afectar a morbosidade ou a doença e igualmente a taxa de mortes, e entre os trabalhadores dos cuidados médicos igualmente, podem igualmente afectar do “a doença e a moral pessoal.” De qualquer maneira, as infecções cuidados médicos-adquiridas podem ser prejudiciais ao assistência ao paciente escrevem os pesquisadores. Assim a detecção de cuidados médicos adquire infecções no mais adiantado é vital, elas escreveu. Até agora, sobre 22.000 trabalhadores dos cuidados médicos foram contaminados por tensões infecciosas cuidados médicos-adquiridas, e a Organização Mundial de Saúde (WHO) acredita estes números para ser um underestimate bruto.

Que foi feito?

Os estudos na fiscalização do genoma de SARS-COV-2 foram ordenados acima de até o 11 de maio de 2020th . A finalidade deste estudo era usar SARS-CoV-2 rápido que arranja em seqüência na epidemiologia destas infecções cuidados médicos-associadas e definir medidas de controle necessárias da infecção.

Este era um estudo em perspectiva onde a equipe usasse “o nanopore SARS-CoV-2 rápido que arranja em seqüência” das amostras do vírus obtidas daquelas que eram positivos na reacção em cadeia reversa da transcrição-polimerase (RT-PCR). As amostras eram dos hospitais no leste de Inglaterra. Arranjar em seqüência foi terminado dentro de 24 horas de receber as amostras. Cada semana uma revisão dos relatórios foi estabelecida, e o epidemiológico, assim como os dados genomic, foram compartilhados para olhar nos casos COVID-19 cuidados médicos-associados e nas tensões associados com eles.

Que foi encontrado?

O estudo foi conduzido entre o 13 de marçoth e o 24 de abril de 2020th , e um total de 5.613 amostras pacientes foi obtido durante este tempo. Destes, 1.000 amostras foram arranjadas em seqüência, e os dados genomic de alta qualidade foram obtidos de 747 amostras. Os dados epidemiológicos e genomic foram combinados em 299 pacientes do hospital do anfitrião.

A equipe encontrou que havia 35 conjuntos de vírus que eram idênticos. Estes foram obtidos de 159 pacientes. Notaram mais esse 58 por cento ou 92 dos 159 pacientes tiveram a evidência epidemiológica de correlacionamento forte, quando 20 por cento ou 32 pacientes tiveram as relações epidemiológicas possíveis.

Como o passo seguinte, os pesquisadores forneceram seus dados às autoridades de controle da infecção e às equipas directivas clínicas do hospital. As políticas no controle da infecção foram alteradas assim, e o relatório paciente da segurança foi alterado igualmente em conformidade.

Conclusões e implicações

Os autores estabeleceram com sucesso a fiscalização genomic do tempo real do vírus e igualmente correlacionaram-na com os resultados epidemiológicos. Isto poderia ajudar a compreender as infecções que cuidados médicos-associadas escreveram e igualmente “identifique oportunidades de visar intervenções do infecção-controle para reduzir mais infecções cuidados médicos-associadas.” A equipe assinada fora, “nossos resultados tem implicações importantes para a política sanitária pública nacional enquanto permitem o seguimento do rapid e a investigação das infecções em ajustes do hospital e da comunidade.”

Journal reference:
Dr. Ananya Mandal

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Dr. Ananya Mandal

Dr. Ananya Mandal is a doctor by profession, lecturer by vocation and a medical writer by passion. She specialized in Clinical Pharmacology after her bachelor's (MBBS). For her, health communication is not just writing complicated reviews for professionals but making medical knowledge understandable and available to the general public as well.

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