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Le génome viral de V, E, B modifie l'horizontal épigénétique d'hôte pour piloter le cancer de l'estomac

Le virus d'Epstein-Barr (EBV), un des virus humains les plus courants, est associé à environ 8-10 pour cent d'estomac -- ou gastrique -- cancers, la troisième principale cause de décès par cancer mondial. Les chercheurs de l'université de Chiba le Japon, le Duc-NUS Faculté de Médecine, au Singapour, et l'agence institut de génome pour de la Science, de technologie et de recherches (A*STAR) 's de Singapour (GIS) ont indiqué un paradigme nouveau dans le cancer gastrique V, E, B-associé, par lequel le génome viral de V, E, B modifie directement l'horizontal épigénétique d'hôte pour introduire l'activation des proto-oncogènes (gènes impliqués dans la croissance des cellules normale qui peut subir une mutation dans le cancérigène des gènes) et de la tumorigenèse.

Le génome humain est l'ensemble complet d'information génétique humaine, et l'epigenome décrit les modifications au génome qui déterminent si des gènes sont tournés mise en marche/arrêt quand et où ils sont nécessaires. À la différence de l'information génétique, l'epigenome est dynamique et sensible aux stimulus externes ; certains stimulus externes peuvent entraîner les modifications anormales d'ADN qui, consécutivement, peuvent perturber l'expression du gène normale et contribuer au développement du cancer.

L'organisme de recherche, abouti par le sénior et les auteurs Co-correspondants, M. Atsushi Kaneda, professeur au troisième cycle d'université du médicament, de l'université de Chiba, et du M. Patrick TAN, professeur au programme dans la biologie de cancer et de cellule souche, Duc-NUS Faculté de Médecine, et directeur exécutif des GIS, a réalisé une analyse globale des structures génomiques en trois dimensions en cellules humaines. Celles-ci se sont échelonnées des lignées cellulaires de cancer gastrique, des échantillons patients, des cellules épithéliales gastriques normales, et du cancer gastrique V, E, B-associé. Combiné avec des analyses d'infection par un virus, les chercheurs trouvés anormalement ont activé des régions génomique spécifiques au cancer de l'estomac V, E, B-positif. L'infection expérimentale de V, E, B des cellules cultivées d'estomac a reproduit les phénomènes du V, E, B grippant à ces régions génomique inactives et fermées et à leur activation anormale.

Les cellules mettent les repères actifs sur des régions génomique nécessaires pour leurs comportements et utilisent eux, et les repères inactifs sur les régions génomique inutiles qui sont fortement fermées et ne pas être utilisé. Nous avons effectué l'observation saisissante que des repères inactifs intenses ont été détruits dans les régions génomique spécifiques quand nous les cellules infectées d'estomac avec le V, E, B. »

M. Atsushi Kaneda, professeur au troisième cycle d'université du médicament, université de Chiba

Les chercheurs encore constaté que les amplificateurs génétiques (les pièces courtes d'ADN qui aident à encourager des gènes à effectuer des protéines) « amortis » dans les régions fermées ont été activés par le virus aux gènes liés au cancer avoisinants d'upregulate, menant à la prolifération des cellules cancéreuses. Ce modèle « d'infestation d'amplificateur », comme les chercheurs l'ont nommé, indique un mécanisme nouveau de la tumorigenèse qui n'exige pas des altérations génétiques, et fonctionne au lieu à côté de reprogrammer l'horizontal épigénétique des cellules humaines pour convertir les amplificateurs latents de l'amorti en condition active.

Prof. Patrick TAN, qui est également un membre du consortium de cancer gastrique de Singapour, a marqué à nouveau, « dans tous les cellules de cancer de l'estomac V, E, B-positives et échantillons primaires de patient de cancer de l'estomac étudiés, V, E, B ADN lié en grande partie aux mêmes régions génomique qui ont également montré l'activation anormale. Ces mêmes régions ont également changé d'inactif en conditions actives par l'infection expérimentale de V, E, B. »

Ce mécanisme de « infestation d'amplificateur » a mené à l'activation des proto-oncogènes voisins en cellules humaines et il est susceptible de contribuer à l'oncogénèse V, E, B-associée dans des types de cellules de cancer multiple. Notamment, les chercheurs ont également constaté que, même après éliminer des génomes de V, E, B, les modifications épigénétiques qui étaient prolongées induit à persister, proposant un mécanisme de « accident avec délit de fuite » en lequel, une fois qu'un épisome de V, E, B modifie la topologie de chromatine des cellules humaines, ces topologies modifiées sont stables et persistent même après le démontage de l'épisome de V, E, B.

Prof. Kaneda répété, « tandis que 8-10 pour cent de cancer de l'estomac sont associés au V, E, B, nous croyons que notre modèle d'infestation d'amplificateur fournit un mécanisme neuf de cancer comportant l'altération et le viral infection epigenomic qui peuvent être appropriés à un choix plus large de cancers et de maladies associées. »

On estime que prof. TAN ajouté, des « infections par V, E, B entraîne plus de 200.000 cancers par an mondiaux, y compris certains cancers de l'estomac. Notre étude met en valeur les objectifs potentiels neufs de médicament dans des malignités V, E, B-positives, indiquées par epigenetics et précédemment invisible utilisant un ordonnancement génétique plus conventionnel étudie. »

Source:
Journal reference:

Okabe, A., et al. (2020) Cross species chromatin interactions drive transcriptional rewiring in Epstein Barr virus positive gastric adenocarcinoma. Nature Genetics. doi.org/10.1038/s41588-020-0665-7.