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L'étude indique des caractéristiques multiples des cellules de HIV-1-producing in vivo

Pour l'éradication de l'infection HIV-1, il est important d'élucider les caractéristiques et l'hétérogénéité détaillées des cellules de HIV-1-infected in vivo. Dans cette étude, un modèle humanisé cellule-transplanté de souris de cheminée hématopoïétique infecté avec un HIV-1 gène-modifié a été employé pour indiquer des caractéristiques multiples des cellules de HIV-1-producing in vivo.

Un organisme de recherche à l'institut des sciences médicales, l'université de Tokyo (IMSUT) utilisant des cellules de HIV-1-infected a exécuté les analyses de « multiomics », qui sont des technologies développées récemment pour vérifier largement les caractéristiques des échantillons biologiques.

Nos découvertes décrivent des caractéristiques multiples des cellules de HIV-1-producing in vivo, qui pourraient fournir des indices pour le développement d'un remède HIV-1. »

Kei Sato, scientifique de fil d'étude et professeur agrégé (investigateur principal), Division de la virologie de systèmes, service du contrôle de maladie infectieuse, institut des sciences médicales, l'université de Tokyo

Les résultats de cette recherche étaient publiés dans des états de cellules le 14 juillet 2020.

Étude pour « le remède HIV-1 »

Pour l'éradication de l'infection HIV-1, il est important de gagner une compréhension en profondeur des caractéristiques étendues des cellules de HIV-1-infected in vivo.

Analyses développées récemment de « omics » (*1) peut être un puissant outil pour recenser les caractéristiques des cellules de HIV-1-infected. Cependant, il convient noter qu'une grande majorité des cellules de T de CD4+ (*2) dans les personnes infectées soyez non infecté, et pour cette raison, les profils transcriptionnels des cellules de T de CD4+ « en vrac » in vivo ne réfléchissent pas ceux des cellules « pures » de HIV-1-producing.

Analyse de Multiomics pour indiquer largement les caractéristiques des cellules de HIV-1-infected in vivo

Dans cette étude, l'organisme de recherche avait l'habitude un modèle humanisé cellule-transplanté de souris de cheminée hématopoïétique humaine qui met à jour le leukopoiesis humain dans des conditions immunologiques relativement stables in vivo et un journaliste réplication-compétent HIV-1, et utilisé quatre techniques développées récemment pour vérifier la génomique et le transcriptomics viraux.

Selon l'organisme de recherche, cette étude a compris les quatre analyses suivantes :

D'abord, l'ACP digital de gouttelette a indiqué la présence des réservoirs potentiels chez les souris humanisées infectées. En second lieu, l'ACP assisté de ligature a montré que la préférence de HIV-1 intégrait dans des régions ouvertes de chromatine, comme proposé par l'association des modifications épigénétiques des sites d'intégration avec la production virale.

Troisièmement, l'ARN-ordonnancement digital a mesuré le nombre de copie absolu de transcriptions virales dans les cellules de HIV-1-producing in vivo et davantage a recensé différentiel les gènes exprimés entre les cellules infectées par le virus et non infectées. En conclusion, l'ARN-ordonnancement unicellulaire a indiqué et a caractérisé l'hétérogénéité des cellules de HIV-1-producing in vivo.

Le professeur agrégé Sato mis l'accent sur « à notre connaissance, cette étude est la première enquête pour décrire des aspects multiples des cellules de HIV-1-producing et également la première enquête complète sur les caractéristiques des cellules de HIV-1-infected in vivo ».

Source:
Journal reference:

Aso, H., et al. (2020) Multiomics Investigation Revealing the Characteristics of HIV-1-Infected Cells In Vivo. Cell Reports. doi.org/10.1016/j.celrep.2020.107887.