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Lo studio rivela le caratteristiche multiple delle celle di HIV-1-producing in vivo

Per l'estirpazione dell'infezione di HIV-1, è importante delucidare le funzionalità e l'eterogeneità dettagliate delle celle di HIV-1-infected in vivo. In questo studio, un gambo ematopoietico modello umanizzato cella-trapiantato del mouse infettato con un HIV-1 gene-modificato è stato usato per rivelare le caratteristiche multiple delle celle di HIV-1-producing in vivo.

Un gruppo di ricerca all'istituto di scienza medica, l'università di Tokyo (IMSUT) facendo uso delle celle di HIV-1-infected ha eseguito le analisi “di multiomics„, che sono le tecnologie sviluppate di recente studiare completamente le funzionalità dei campioni biologici.

I nostri risultati descrivono le caratteristiche multiple delle celle di HIV-1-producing in vivo, in grado di fornire le bugne per lo sviluppo di una maturazione di HIV-1.„

Kei Sato, scienziato del cavo di studio e professore associato (ricercatore principale), divisione di virologia dei sistemi, dipartimento di controllo di malattia infettiva, istituto di scienza medica, l'università di Tokyo

I risultati di questa ricerca sono stati pubblicati nei rapporti delle cellule il 14 luglio 2020.

Studio per “la maturazione di HIV-1„

Per l'estirpazione dell'infezione di HIV-1, è importante guadagnare una comprensione approfondita di vaste caratteristiche delle celle di HIV-1-infected in vivo.

Analisi sviluppate di recente “di omics„ (*1) può essere uno strumento potente per identificare le caratteristiche delle celle di HIV-1-infected. Tuttavia, dovrebbe essere notato che una grande maggioranza delle celle di T di CD4+ (*2) in persone infettate sia non infetto e quindi, i profili trascrizionali delle celle di T di CD4+ “alla rinfusa„ in vivo non riflettono quelli delle celle “pure„ di HIV-1-producing.

Analisi di Multiomics per rivelare completamente le funzionalità delle celle di HIV-1-infected in vivo

In questo studio, il gruppo di ricerca ha usato un modello umanizzato del mouse cella-trapiantato gambo ematopoietico umano che mantiene il leukopoiesis umano sotto le circostanze immunologiche relativamente stabili in vivo e un HIV-1 replica-competente del reporter ed usato quattro tecniche sviluppate di recente per studiare la genomica e il transcriptomics virali.

Secondo il gruppo di ricerca, questo studio ha consistito delle quattro analisi seguenti:

In primo luogo, la PCR digitale della gocciolina ha rivelato la presenza di bacini idrici potenziali in mouse umanizzati infettati. In secondo luogo, la PCR mediata legatura ha mostrato la preferenza del HIV-1 per integrare nelle regioni aperte della cromatina, come suggerito dall'associazione delle modifiche epigenetiche dei siti di integrazione con produzione virale.

In terzo luogo, l'RNA-ordinamento digitale ha quantificato il numero di copia assoluto delle trascrizioni virali nelle celle di HIV-1-producing in vivo e più ulteriormente ha identificato i geni differenziale espressi fra le celle infettate da virus e non infette. Per concludere, l'RNA-ordinamento unicellulare ha rivelato e caratterizzato l'eterogeneità delle celle di HIV-1-producing in vivo.

Il professore associato Sato sottolineato “a nostra conoscenza, questo studio è la prima ricerca per descrivere gli aspetti multipli delle celle di HIV-1-producing ed anche la prima indagine completa sulle caratteristiche delle celle di HIV-1-infected in vivo„.

Source:
Journal reference:

Aso, H., et al. (2020) Multiomics Investigation Revealing the Characteristics of HIV-1-Infected Cells In Vivo. Cell Reports. doi.org/10.1016/j.celrep.2020.107887.