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Base de données de génome humain d'utilisation de chercheurs pour étudier des cellules cancéreuses

Le professeur d'Université de l'état de Floride des sciences biologiques David Gilbert emploie les dernières informations sur le génome humain comme guide pour comprendre mieux le cancer.

Gilbert et ses collègues de FSU faisaient partie d'une équipe que la cellule cancéreuse différente comparée tape à une base de données des cellules humaines normales suivre une méthode neuve qu'il a développée qui peut recenser le type de cellules dont les cancers dérivent. En comparant les cellules cancéreuses variées au ramassage de cellules normales, elles pouvaient dire quels cancers le plus attentivement ont apparié différents types de cellules.

Les « cellules cancéreuses viennent d'une cellule dans votre fuselage, mais elles ont changé, » Gilbert a dit. « Sachant ce que le type de cellules qu'elles sont venues de est particulièrement important en évaluant si une tumeur neuve dans un patient rechuté est dérivée de la tumeur originelle ou est le cancer neuf totalement. »

Leur travail, publié dans des transmissions de nature, est un ?uvre littéraire complémentaire à une grande suite de publications résultant d'un effort international pour comprendre comment les travaux de génome humain, financée par les instituts de la santé nationaux, appelés l'encyclopédie des éléments d'ADN (CODEZ). Puisque seulement 1 pour cent d'indicatifs humains d'ADN pour toutes les protéines connues, comprenant le fonctionnement du reste de notre génome a été un défi énorme.

Gilbert et ses collègues sont également des contributeurs au plus grand CODENT la publication, publiée en nature, récapitulant les efforts du dernier cycle du financement ENCODE. Le point culminant de cette étude est le mappage de presque un million d'éléments dans le génome humain, revêtement 8 pour cent du génome, qui règlent les gènes. C'est-à-dire, ils déterminent combien et en quel tissu cellulaire un gène sera exprimé.

La complexité dans un organisme n'est pas dans le nombre de gènes de protéine-codage qu'il a. Elle est dedans dans la combinaison de ces gènes. Nous avons presque le même nombre de gènes que des vis sans fin et des mouches, mais nous les exprimons en combinaisons plus complexes. »

David Gilbert, professeur, service des sciences biologiques, Université de l'état de Floride

Son laboratoire ajoute la réplication - ; le procédé de l'ADN tirant une copie de lui-même - ; à l'illustration.

Les « gens ne pensent pas souvent à la réplication en tant que quelque chose qui serait réglée différemment dans différents types de cellules parce que l'ADN est le même en toutes les cellules, » il a dit.

« Cependant, ce n'est pas simplement l'ADN qui reproduit. En revanche, toutes les composantes des chromosomes qui règlent l'ADN sont complet démontées et rassemblées quand des répliques d'ADN. Nous avons prouvé que la commande dans laquelle la réplique de segments d'ADN est seule à chaque type de cellules et aussi différent en cellules malades. Elle peut même être seule au cancer spécifique d'un patient. »

Source:
Journal reference:

Zhang, J., et al. (2020) An integrative ENCODE resource for cancer genomics. Nature Communications. doi.org/10.1038/s41467-020-14743-w.