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Os pesquisadores usam a base de dados do genoma humano para estudar células cancerosas

O professor de universidade estadual de Florida da ciência biológica David Gilbert está usando a informação a mais atrasada sobre o genoma humano como guia para compreender melhor o cancro.

Gilbert e seus colegas de FSU eram parte de uma equipe que comparasse tipos diferentes da célula cancerosa a uma base de dados de pilhas humanas normais usando um método que novo desenvolveu que pode identificar o tipo da pilha de que os cancros se derivam. Comparando várias células cancerosas à coleção de pilhas normais, podiam dizer que cancros combinaram o mais pròxima tipos diferentes da pilha.

As “células cancerosas vêm de uma pilha em seu corpo, mas mudaram,” Gilbert disse. “Saber que tipo da pilha vieram é particularmente importante ao avaliar se um tumor novo em um paciente tido uma recaída está derivado do tumor original ou é o cancro novo completamente.”

Seu trabalho, publicado em comunicações da natureza, é uma parte de companheiro a uma grande série de publicações resultando de um esforço internacional para compreender como o genoma humano trabalha, financiada pelos institutos de saúde nacionais, chamados a enciclopédia de elementos do ADN (CODIFIQUE). Porque somente 1 por cento dos códigos humanos do ADN para todas as proteínas conhecidas, compreendendo a função do resto de nosso genoma foi um desafio enorme.

Gilbert e seus colegas igualmente são contribuinte ao maior CODIFICAM a publicação, publicada na natureza, resumindo os esforços do ciclo o mais atrasado do financiamento ENCODE. O destaque deste estudo é o traço de quase um milhão de elementos no genoma humano, cobrindo 8 por cento do genoma, que regula os genes. Isto é, determinam quanto e em que tecido do corpo um gene será expressado.

A complexidade em um organismo não está no número de genes que da proteína-codificação tem. Está dentro na combinação daqueles genes. Nós temos quase o mesmo número de genes que sem-fins e moscas, mas nós expressamo-los em umas combinações mais complexas.”

David Gilbert, professor, departamento da ciência biológica, universidade estadual de Florida

Seu laboratório adiciona a réplica -; o processo de ADN que faz uma cópia dse -; à imagem.

Os “povos não pensam frequentemente da réplica como algo que seria regulado diferentemente em tipos diferentes da pilha porque o ADN está o mesmo em todas as pilhas,” ele disse.

“Contudo, não é apenas o ADN que replicates. Um pouco, todos os componentes dos cromossomas que regulam o ADN completamente são desmontados e remontados quando replicates do ADN. Nós mostramos que o pedido em que os segmentos do replicate do ADN são originais a cada tipo da pilha e também diferente em pilhas doentes. Pode mesmo ser original ao cancro de um paciente específico.”

Source:
Journal reference:

Zhang, J., et al. (2020) An integrative ENCODE resource for cancer genomics. Nature Communications. doi.org/10.1038/s41467-020-14743-w.