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Un “filete corto” de los péptidos de la firma para rastrear el virus SARS-CoV-2

Los investigadores de SPI (Marcoule) utilizaron proteomics para determinar los péptidos de la firma del virus SARS-CoV-2 expresado in vitro. Un “filete corto” de 14 determinados y de péptidos caracterizados permite considerar progresos en espectrometría de masa apuntada, haciendo esta aproximación en grande directa y rápida, implantable en los hospitales, una herramienta potencial de la opción en la detección del virus responsable de Covid-19.

Un “filete corto” de los péptidos de la firma para rastrear el virus SARS-CoV-2
Proyecte representando las proteínas estructurales principales de S (pico), de M (proteína de la membrana) y de N (nucleoproteína) de SARS-CoV-2, del cual se han determinado y se han caracterizado 14 péptidos. Haber de imagen: Jean Armengaud/CEA

Extracto

La detección del coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática es una herramienta crucial para luchar el pandémico COVID-19. Este escrito del grupo de datos presenta la exploración de un grupo de datos del proteomics de la escopeta detectado en las células infectadas SARS-CoV-2 de Vero. Las proteínas de muestras desactivadas del virus fueron extraídas, digerido con tripsina, y los péptidos resultantes fueron determinados por espectrometría de masa dato-relacionada del tándem de la adquisición.

Los 101 péptidos que denunciaban para seis proteínas virales eran analizados específicamente en términos de sus características analíticas, especificidad y protección de la especie, y su propensión a las modificaciones estructurales. De acuerdo con estos resultados, una lista restringida de 14 péptidos de las proteínas estructurales principales de N, de S, y de M que se podrían utilizar para el revelado apuntado del método de la espectrometría de masa y el diagnóstico del nuevo SARS-CoV-2 se propone y de los mejores candidatos se comenta.

Source:
Journal reference:

Gouveia, D., et al. (2020) Shortlisting SARS‐CoV‐2 Peptides for Targeted Studies from Experimental Data‐Dependent Acquisition Tandem Mass Spectrometry Data. Proteomicsdoi.org/10.1002/pmic.202000107.