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Le protocole optimisé neuf permet l'identification rapide des interactions protéine-protéine

Une équipe de recherche d'université de Helsinki introduit un protocole optimisé et intégré neuf de protéomique d'interaction qui combine deux méthodes de pointe pour permettre l'identification rapide des interactions protéine-protéine et de plus.

Les protéines en cellules humaines ne fonctionnent pas en isolation et leurs interactions avec d'autres protéines définissent leurs fonctions cellulaires. Par conséquent, la compréhension détaillée des interactions protéine-protéine (PPIs) est la clavette pour le règlement de déchiffrement des réseaux cellulaires et des voies, dans la santé et la maladie.

Dans une étude publiée dans de l'édition de septembre (en ligne 10 avancésth d'août) des protocoles de nature, une équipe de recherche aboutie par le directeur de recherche Markku Varjosalo à partir de l'institut de la biotechnologie et HiLIFE, université de Helsinki, introduit un protocole optimisé et intégré de protéomique d'interaction (nommé technologie de Mac-balise).

Le protocole combine la purification de pointe d'affinité de deux méthodes - la spectrométrie de masse (AP-MS) et l'identification proximité-dépendante de biotine (BioID pour permettre l'identification rapide des interactions protéine-protéine et de plus.

La technologie de Mac-balise permet une manière simple de sonder la localisation de niveau moléculaire de la protéine d'intérêt (un moyen en ligne de accompagnement de microscopie de milliseconde est procurable chez www.proteomics.fi).

La Mac-balise développée et l'approche intégrée autoriseront, non seulement la communauté de protéomique d'interaction, mais également cellule/biologistes moléculaires/structurels, avec un flux de travail intégré expérimental prouvé pour tracer en détail les interactions matérielles et fonctionnelles et le contexte moléculaire des protéines.

La technologie de Mac-balise provient des efforts à long terme sur développer les outils neufs de biologie de systèmes pour étudier systématiquement les interactions moléculaires des protéines. L'identification des interactions protéine-protéine et de leurs changements des réglages de la maladie, tels que le cancer, a prouvé dans des nos mains un puissant outil et nous a permise de trouver les mécanismes moléculaires exacts être à la base de ces maladies. En principe, notre protocole peut être employé de tant de différentes voies que nous n'avons pas même envisagé probablement la moitié de elles. »

Markku Varjosalo, directeur de recherche, institut de la biotechnologie et HiLIFE, université de Helsinki

La technologie de Mac-balise est actuel en service par le M. Varjosalo et ses consortiums des virologues, des pharmaciens médicinaux et d'autres chercheurs de « omics » dans la recherche des protéines druggable nouvelles d'hôte en tant qu'objectifs thérapeutiques pour empêcher l'infection SARS-CoV-2 et pour cette raison pour combattre Covid-19.

Source:
Journal reference:

Liu, X., et al. (2020) Combined proximity labeling and affinity purification−mass spectrometry workflow for mapping and visualizing protein interaction networks. Nature Protocols. doi.org/10.1038/s41596-020-0365-x.