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O protocolo aperfeiçoado novo permite a identificação rápida de interacções da proteína-proteína

Uma equipa de investigação da universidade de Helsínquia introduz um protocolo aperfeiçoado e integrado novo do proteomics da interacção que combine dois métodos avançados para permitir a identificação rápida de interacções e de mais da proteína-proteína.

As proteínas em pilhas humanas não funcionam no isolamento e suas interacções com outras proteínas definem suas funções celulares. Conseqüentemente, a compreensão detalhada de interacções da proteína-proteína (PPIs) é a chave para o regulamento de decifração de redes e de caminhos celulares, na saúde e na doença.

Em um estudo publicado no da edição de setembro (em linha 10 avançadosth de agosto) de protocolos da natureza, uma equipa de investigação conduzida pelo director de investigação Markku Varjosalo do instituto da biotecnologia & HiLIFE, universidade de Helsínquia, introduzem um protocolo aperfeiçoado e integrado do proteomics da interacção (nomeado tecnologia da Mac-etiqueta).

O protocolo combina a purificação avançada da afinidade de dois métodos - espectrometria em massa (AP-MS) e identificação proximidade-dependente da biotina (BioID para permitir a identificação rápida de interacções e de mais da proteína-proteína.

A tecnologia da Mac-etiqueta permite uma forma facil sondar a localização nivelada molecular da proteína do interesse (um recurso em linha de acompanhamento da microscopia do MS está disponível em www.proteomics.fi).

A Mac-etiqueta desenvolvida e a aproximação integrada autorizarão, não somente a comunidade do proteomics da interacção, mas igualmente pilha/biólogos moleculars/estruturais, com uns trabalhos integrados experimental provados para traçar em detalhe as interacções físicas e funcionais e o contexto molecular das proteínas.

A tecnologia da Mac-etiqueta provem dos esforços a longo prazo em desenvolver ferramentas novas da biologia de sistemas para sistematicamente estudar as interacções moleculars das proteínas. A identificação de interacções da proteína-proteína e de suas mudanças em ajustes da doença, tais como o cancro, provou em nossas mãos uma ferramenta poderosa e permitiu que nós encontrem mecanismos moleculars exactos ser a base destas doenças. Em princípio, nosso protocolo pode ser usado em tão muitas maneiras diferentes que nós provavelmente nem sequer previmos a metade delas.”

Markku Varjosalo, director de investigação, instituto da biotecnologia & HiLIFE, universidade de Helsínquia

A tecnologia da Mac-etiqueta é actualmente em uso pelo Dr. Varjosalo e seus consórcios dos virologists, de químicos medicinais e de outros pesquisadores do “omics” na busca para proteínas druggable novas do anfitrião como alvos terapêuticos inibir a infecção SARS-CoV-2 e conseqüentemente lutar Covid-19.

Source:
Journal reference:

Liu, X., et al. (2020) Combined proximity labeling and affinity purification−mass spectrometry workflow for mapping and visualizing protein interaction networks. Nature Protocols. doi.org/10.1038/s41596-020-0365-x.