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Une méthode rapide et économique pour trouver le virus SARS-CoV-2 en eaux usées non traitées

Un groupe de chercheurs ont expliqué que, de sept méthodes utilisées généralement pour déterminer des virus en eaux usées non traitées, une technique d'adsorption-extraction peut le plus efficacement trouver SARS-CoV-2. Ceci nous donne un autre outil pour trouver la présence et l'écart de la pandémie COVID-19.

Le rail de l'écart de la pandémie COVID-19 est actuel conduit en vérifiant les écouvillons ou les échantillons nasaux de salive. Les techniques et outil pour suivre l'écart de la pandémie par des autres moyens seraient très avantageuses ; la surveillance d'eaux usées est une méthode qui nous permettrait de surveiller l'écart de la pandémie à une échelle beaucoup plus grande. Ce n'est pas une technique neuve, et a été employée pour trouver les virus non-enveloppés, mais une méthode conventionnelle pour les virus enveloppés tels que SARS-CoV-2 n'avait pas été développée.

Dans actuel travail, Co-écrit par le professeur adjoint Masaaki Kitajima du laboratoire de bureau d'études de contrôle qualité de l'eau à l'université du Hokkaido, les scientifiques enregistrent une méthode rapide et économique pour concentrer le coronavirus en eaux usées non traitées. Le virus de la hépatite murin (MHV), un type de virus enveloppé, est étroitement lié à SARS-CoV-2 mais n'affecte pas des êtres humains, et est ainsi sûr pour employer pour vérifier la faisabilité de la méthode. L'étude était publiée en la Science de tout le environnement.

Les scientifiques ont obtenu MHV des fèces de souris et l'ont introduit dans des échantillons d'eaux usées non traitées rassemblés de Brisbane, Australie. Ils ont essayé de récupérer et concentrer le MHV de ces échantillons par sept méthodes différentes qui sont utilisées généralement pour déterminer les virus non-enveloppés. La quantité de MHV récupéré a été déterminée par un ACP transcription-quantitatif inverse appelé de méthode, où l'ARN du virus extrait, converti en ADN, l'ADN est à plusieurs reprises reproduit, et l'augmentation de la quantité d'ADN est mesurée dans tout le procédé.

La guérison était la plus élevée dans la méthode qui impliqué traitant l'échantillon avec du chlorure de magnésium et puis filtrant à l'extérieur le virus sur une membrane négatif-chargée ; la deuxième guérison la plus élevée était par une méthode assimilée sans chlorure de magnésium. Les avantages de ces méthodes comprennent un premier temps de traitement de 1 heure au-dessous de et le besoin seulement de bon marché, largement - matériel et réactifs procurables. Il y a également des inconvénients, tels qu'encrasser des filtres qui peuvent augmenter le temps de traitement. Cependant, jusqu'à présent, le besoin de transcription-qPCR inverse pour le dépistage du virus est inévitable.

La prochaine opération serait de vérifier cette méthode dans les échantillons rassemblés des endroits où la pandémie est répandue. Il y a deux objectifs : on est de prouver que la technique peut être employée pour SARS-CoV-2, et l'autre est de prouver que le test peut être employé sur des échantillons de l'extérieur du laboratoire.

J'espère que cette recherche contribue à l'établissement d'un protocole normal pour le dépistage de SARS-CoV-2 en eaux usées, » indique le professeur adjoint Kitajima, « et ceci, consécutivement, accélère des investigations pour améliorer notre compréhension de l'épidémiologie COVID-19 par le contrôle d'eaux usées. »

Masaaki Kitajima, professeur adjoint, laboratoire de bureau d'études de contrôle qualité de l'eau à l'université du Hokkaido

Il est actuel impliqué dans un certain nombre d'études liées à s'appliquer l'épidémiologie basée sur eaux usées à suivre l'écart de la pandémie COVID-19, et a collaboré avec un certain nombre de scientifiques et d'organismes de recherche en travers du monde dans cet effort.

Source:
Journal reference:

Ahmed, W., et al. (2020) Comparison of virus concentration methods for the RT-qPCR-based recovery of murine hepatitis virus, a surrogate for SARS-CoV-2 from untreated wastewater. Science of the Total Environment. doi.org/10.1016/j.scitotenv.2020.139960.