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La base de données neuve a pu accélérer le développement des traitements gène-visés pour le cancer du sein

Tous les traitements du cancer du sein actuels ont été vérifiés la première fois dans les lignées cellulaires. Chaque lignée cellulaire a commencé comme cancer dans un patient. En soi, chaque lignée cellulaire est un substitut de la maladie de ce patient. Une base de données neuve de 40 lignées cellulaires de cancer du sein, élaborée par l'université médicale des chercheurs de la Caroline du Sud, aidera des chercheurs à approfondir leur compréhension de ces lignées cellulaires et accélérera le développement des traitements gène-visés neufs.

Les lignées cellulaires sont la ligne de front pour la recherche sur le cancer de cancer du sein parce qu'elles sont dérivées des patients réels et montrent les caractéristiques de la maladie que ce patient a remarquée. »

Stephen P. Ethier, Ph.D., professeur en médicament de Service de Pathologie et de laboratoire chercheur de MUSC et de MUSC Hollings à centre de lutte contre le cancer

Les lignées cellulaires représentent le cancer pour ce qu'est il, ont dit Ethier -- une maladie à facettes multiples du génome. L'illustration grande du cancer comme maladie complexe, cependant, est souvent dérivée dans la recherche à la laser-orientation sur seulement un ou deux modifications de gène. Ethier croit ceci -- la voie actuelle de faire la recherche -- est trop étroit et cela de meilleurs traitements se développants exigera le bilan de la signature génomique entière.

Dans un article récent publié dans le cancer du sein de npj, Ethier et son équipe décrivent la mise en place d'un moyen neuf pour des chercheurs de cancer. La base de connaissances de lignée cellulaire de cancer du sein de MONTANT, ou SLKBase, poussera l'inducteur en avant en fournissant facilement information génomique, proteomic et autre « omic » navigable sur un total de 40 MONTANTS et d'autres lignées cellulaires patient-dérivées. La base de données a pu éventuellement contribuer à l'identification, développement et réalisation des traitements gène-visés vraiment personnalisés pour des patients présentant le cancer du sein.

M. Stephen Ethier et son espoir d'équipe que leur base de données augmentera éventuellement pour comprendre des lignées cellulaires de cancer de tous les types de cancer.

Les êtres humains ont approximativement 24.000 gènes, collectivement appelés le génome. Écrit dans le langage de l'ADN, les gènes agissent en tant que directives pour la façon dont les cellules doivent se développer, vivre et reproduire.

Les erreurs dans les directives d'ADN dans une cellule peuvent éventuel changer comment la cellule se développe, des répliques et répondent aux signes naturels qui agissent normalement en tant que frein à ces fonctionnements. Ces modifications font devenir la cellule cancéreuse.

Les traitements personnalisés ou visés, basés sur de seuls changements de gène du cancer de chaque patient, ont été un objectif à long terme dans la recherche en matière d'oncologie et médicament, et le progrès important a été accompli. Cependant, la mise en oeuvre des stratégies thérapeutiques vraiment personnalisées a été lente.

Un obstacle a été difficulté recensant et visant les modifications de gène qui ont un fonctionnement en entraînant la maladie.

Plusieurs centaines de gènes pourraient avoir développé des erreurs dans une cellule cancéreuse, selon Ethier. « La plupart des gènes qui sont changés, cependant, ne jouent aucun rôle quelque dans la biologie de la maladie, » il ont expliqué.

Comment les chercheurs peuvent-ils recenser qui de ces mutations géniques importent et valent la désignation d'objectifs ?

Avec le financement d'une concession clinique et de translation de la Caroline du Sud d'institut de recherches de pilote, Ethier et son équipe ont établi les outils spécialisés pour que SLKBase facilite en répondant à cette question même.

« Ainsi la voie d'obtenir de 500 modifications de gène à deux ou à trois qui jouent un rôle essentiel dans la biologie de la maladie est de faire ce qui sont des expériences appelées de coup de grâce ou de précipitation de génome-écaille, » Ethier a expliqué.

Dans les expériences de précipitation, Ethier et son équipe ont exécuté une série de tests dans laquelle chaque gène dans le génome a été arrêté un et évalué pour ses effets sur l'accroissement ou la survie de la cellule cancéreuse. Si la cellule cancéreuse mourait en ou cessait se reproduisant, ce gène a été considéré pour être essentiel pour la survie. Si ce gène avait également une erreur, il a signifié que le gène était non seulement essentiel mais a également rempli un fonctionnement qui a incité la cellule à se comporter comme le cancer.

Chaque lignée cellulaire de cancer a une seule « signature fonctionnelle de gène, » Ethier expliqué.

Les traitements qui visent ces gènes fonctionnels qui pilotent l'accroissement de cancer sont susceptibles d'être les plus efficaces. D'une bibliothèque de plus de 800 médicaments expérimentaux visés, « l'outil de signature de Druggable » recense ceux qui sont susceptibles d'être efficaces contre les cellules cancéreuses parce qu'elles visent les gènes essentiels.

Le site Web de SLKBase est ouvert à n'importe qui qui veut connaître plus au sujet des lignées cellulaires de cancer du sein ou atteint l'immense base de connaissances génomique et proteomic de recherches.

Cependant, le cancer du sein est juste le début. Il y a plus de 500 lignées cellulaires de cancer dérivées des patients avec pratiquement chaque type de cancer, et Ethier espère éventuellement les comprendre tous dans SLKBase.

Pour Ethier, le gène change piloter la question de cancer davantage que le tissu en lequel ils se produisent. Les cancers sont une maladie du génome, aucune question dans laquelle une partie du fuselage ils se produisent. Par conséquent, on s'attendrait à ce que n'importe quel cancer réponde au traitement visé à sa signature génomique.

« À une certaine remarque, nous devons nous arrêter nous inquiéter de si ce soit cancer du sein, cancer ou cancer du côlon de poumon, » avons dit Ethier. « Nous devrions mettre plus d'accent sur les caractéristiques génomiques de ce cancer parce que le cancer est une maladie du génome. »

Ethier a récent signé un accord d'option avec la fondation de MUSC pour le développement de recherches qui permettra à sa mise en train, LLC d'oncologie de sextant, de continuer à introduire l'utilisation des lignées cellulaires de cancer et de leurs dérivés fonctionnels. La mission de l'oncologie de sextant est de développer des stratégies pour la décompilation des différentes lignées cellulaires qui seront éventuel utiles pour effectuer des prévisions visées de traitement médicamenteux pour des patients.

Source:
Journal reference:

Ethier, S.P., et al. (2020) Development and implementation of the SUM breast cancer cell line functional genomics knowledge base. npj Breast Cancer. doi.org/10.1038/s41523-020-0173-z.