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Il nuovo database ha potuto accelerare lo sviluppo delle terapie gene-mirate a per cancro al seno

Tutte le droghe di cancro al seno correnti in primo luogo sono state provate nelle linee cellulari. Ogni linea cellulare ha cominciato come cancro in un paziente. Come tale, ogni linea cellulare è un sostituto per la malattia di quel paziente. Un nuovo database di 40 linee cellulari del cancro al seno, elaborato dall'università medica di ricercatori di Carolina del Sud, aiuterà i ricercatori ad approfondire la loro comprensione di queste linee cellulari ed accelererà lo sviluppo di nuove terapie gene-mirate a.

Le linee cellulari sono il fronte per la ricerca del cancro al seno perché sono derivate dai pazienti reali ed esibiscono le caratteristiche della malattia che quel paziente ha avvertito.„

Stephen P. Ethier, Ph.D., il professor nel dipartimento di patologia e medicina del laboratorio al Cancro di MUSC e di MUSC Hollings si concentra il ricercatore

Le linee cellulari rappresentano il cancro per cui è, hanno detto Ethier -- una malattia complessa del genoma. La vasta maschera di cancro come malattia complessa, tuttavia, è oltrepassata spesso nella ricerca al laser-fuoco su soltanto uno o due cambiamento del gene. Ethier crede questo -- il modo corrente di effettuare ricerca -- è troppo stretto e quello terapie migliori di sviluppo richiederà la valutazione di intera impronta genomica.

In un articolo recentemente pubblicato nel cancro al seno del npj, Ethier ed il suo gruppo descrivono l'entrata in vigore di nuova risorsa per i ricercatori del cancro. La linea cellulare Knowledge Base del cancro al seno di SOMMA, o SLKBase, farà avanzare il campo fornendo facilmente informazioni genomiche, proteomic ed altre “omic„ navigabili su complessivamente 40 SOMME ed altre linee cellulari paziente-derivate. Il database ha potuto finalmente contribuire all'identificazione, allo sviluppo ed all'entrata in vigore delle terapie gene-mirate a vero personali per i pazienti con cancro al seno.

Dott. Stephen Ethier e la sua speranza che del gruppo il loro database finalmente si espanderà per comprendere le linee cellulari del cancro da tutti i tipi di cancri.

Gli esseri umani hanno circa 24.000 geni, collettivamente chiamati il genoma. Scritto nel linguaggio di DNA, i geni fungono da istruzioni per come le celle devono svilupparsi, vivere e ripiegare.

Gli errori nelle istruzioni del DNA all'interno di una cella possono infine cambiare come la cella si sviluppa, repliche e risponde ai segnali naturali che fungono normalmente da freno a queste funzioni. Questi cambiamenti inducono la cella a diventare cancerogena.

Le terapie personali o mirate a, in base ai cambiamenti unici del gene nel cancro di ogni paziente, sono state uno scopo a lungo termine nella ricerca nell'oncologia e medicina ed i progressi significativi sono stati realizzati. Tuttavia, applicare le strategie terapeutiche vero personali è stato lento.

Un ostacolo ha stato la difficoltà che identifica e che mira ai cambiamenti del gene che hanno una funzione nel causare la malattia.

Diverse centinaia geni potrebbero sviluppare gli errori in una cellula tumorale, secondo Ethier. “La maggior parte dei geni che sono cambiati, tuttavia, non stanno svolgendo ruolo qualunque nella biologia della malattia,„ lui hanno spiegato.

Come possono i ricercatori identificare che di quelle mutazioni genetiche importano e valgono la pena di mirare?

Con il finanziamento da una concessione clinica & di traduzione di Carolina del Sud dell'istituto di ricerca del pilota, Ethier ed il suo gruppo hanno costruito gli strumenti specializzati affinchè SLKBase aiutino nel rispondere a questo problema stesso.

“Così il modo ottenere da 500 cambiamenti del gene a due o a tre che stanno svolgendo un ruolo essenziale nella biologia della malattia è di fare che cosa sono chiamati esperimenti di espulsione o di colpo del genoma-disgaggio,„ Ethier ha spiegato.

Negli esperimenti di colpo, Ethier ed il suo gruppo hanno eseguito una serie di prove in cui ogni gene nel genoma è stato spento uno per uno ed è stato valutato per i sui effetti sulla crescita o sulla sopravvivenza della cellula tumorale. Se la cellula tumorale morisse o smettesse duplicarsi, quel gene è stato reputato per essere essenziale per la sopravvivenza. Se quel gene egualmente avesse un errore, ha significato che il gene era non solo essenziale ma egualmente ha eseguito una funzione che ha incitato la cella a comportarsi come cancro.

Ogni linea cellulare del cancro ha “un'impronta funzionale unica del gene,„ Ethier spiegato.

Le terapie che mirano a questi geni funzionali che determinano la crescita del cancro sono probabili essere più efficaci. Da una libreria di più di 800 farmaci sperimentali mirati a, “lo strumento dell'impronta di Druggable„ identifica quelli che sono probabili essere efficaci contro le cellule tumorali perché mirano ai geni essenziali.

Il sito Web di SLKBase è aperto a chiunque che voglia conoscere più circa le linee cellulari del cancro al seno o accede alla base di conoscenza genomica e proteomic immensa della ricerca.

Tuttavia, il cancro al seno è appena l'inizio. Ci sono più di 500 linee cellulari del cancro derivate dai pazienti con virtualmente ogni tipo di cancro e Ethier spera finalmente di includerli tutti in SLKBase.

Per Ethier, il gene cambia determinare la materia del cancro più del tessuto in cui si presentano. I Cancri sono una malattia del genoma, nessuna materia in quale parte del corpo accadono. Di conseguenza, tutto il cancro si penserebbe che risponda alla terapia mirata a alla sua impronta genomica.

“Ad un certo punto, dobbiamo smettere di preoccuparci per se sia cancro al seno, cancro polmonare o tumore del colon,„ abbiamo detto Ethier. “Dovremmo mettere più enfasi sulle funzionalità genomiche di quel cancro perché il cancro è una malattia del genoma.„

Ethier recentemente ha firmato un accordo di opzione con le fondamenta di MUSC per lo sviluppo della ricerca che permetterà al suo avvio, LLC dell'oncologia della sestante, di continuare a promuovere l'uso delle linee cellulari del cancro e dei loro derivati funzionali. La missione dell'oncologia della sestante è di sviluppare le strategie per la reingegnerizzazione di diverse linee cellulari che infine saranno utili per la fabbricazione delle previsioni mirate a del trattamento della droga per i pazienti.

Source:
Journal reference:

Ethier, S.P., et al. (2020) Development and implementation of the SUM breast cancer cell line functional genomics knowledge base. npj Breast Cancer. doi.org/10.1038/s41523-020-0173-z.