Aviso: Esta página é uma tradução automática da página original em inglês. Por favor note uma vez que as traduções são geradas por máquinas, não tradução tudo será perfeita. Este site e suas páginas da Web destinam-se a ler em inglês. Qualquer tradução deste site e suas páginas da Web pode ser imprecisas e imprecisos no todo ou em parte. Esta tradução é fornecida como uma conveniência.

A base de dados nova podia apressar a revelação de terapias gene-visadas para o cancro da mama

Todas as drogas de cancro da mama actuais foram testadas primeiramente nas linha celular. Cada linha celular começou como o cancro em um paciente. Como tal, cada linha celular é um substituto para a doença desse paciente. Uma base de dados nova de 40 linha celular do cancro da mama, desenvolvida pela universidade médica de investigador de South Carolina, ajudará pesquisadores a aprofundar sua compreensão destas linha celular e apressará a revelação de terapias gene-visadas novas.

As linha celular são a linha da frente para a pesquisa de cancro da mama porque são derivadas dos pacientes reais e exibem as características da doença que esse paciente experimentou.”

Stephen P. Ethier, Ph.D., professor no departamento da patologia e medicina do laboratório no cancro de MUSC e de MUSC Hollings centra o pesquisador

As linha celular representam o cancro para o que é, disseram Ethier -- uma doença diferenciada do genoma. A imagem larga do cancro como uma doença complexa, contudo, é contorneada frequentemente na pesquisa ao laser-foco sobre somente uma ou dois mudanças do gene. Ethier acredita este -- a maneira actual de fazer a pesquisa -- é demasiado estreito e isso melhores terapias tornando-se exigirá a avaliação da assinatura genomic inteira.

Em um artigo publicado recentemente no cancro da mama do npj, Ethier e sua equipe descrevem a aplicação de um recurso novo para pesquisadores do cancro. A base de conhecimento da linha celular do cancro da mama da SOMA, ou SLKBase, empurrarão o campo para a frente fornecendo facilmente informação genomic, proteomic e outra “omic” navegável em um total de 40 SOMAS e de outras linha celular paciente-derivadas. A base de dados podia eventualmente contribuir à identificação, à revelação e à aplicação de terapias gene-visadas verdadeiramente personalizadas para pacientes com cancro da mama.

Dr. Stephen Ethier e sua esperança que da equipe sua base de dados expandirá eventualmente para incluir linha celular do cancro de todos os tipos de cancro.

Os seres humanos têm aproximadamente 24.000 genes, chamados colectivamente o genoma. Escrito na língua do ADN, os genes actuam como instruções para como as pilhas são crescer, viver e replicate.

Os erros nas instruções do ADN dentro de uma pilha podem finalmente mudar como a pilha cresce, replicates e respondem aos sinais naturais que actuam normalmente como um freio a estas funções. Estas mudanças fazem com que a pilha torne-se cancerígeno.

As terapias personalizadas ou visadas, com base em mudanças originais do gene no cancro de cada paciente, foram um objetivo a longo prazo na pesquisa da oncologia e medicina, e o progresso significativo foi feito. Contudo, executar estratégias terapêuticas verdadeiramente personalizadas foi lenta.

Um obstáculo tem sido dificuldade que identifica e que visa as mudanças do gene que têm uma função em causar a doença.

Várias centenas genes puderam ter desenvolvido erros em uma célula cancerosa, de acordo com Ethier. “A maioria dos genes que são mudados, contudo, não estão jogando nenhum papel qualquer na biologia da doença,” ele explicaram.

Como podem os pesquisadores identificar que daquelas mutações genéticas importam e valem a pena visar?

Com financiamento de uma concessão clínica & Translational de South Carolina do instituto de investigação do piloto, Ethier e sua equipe construíram ferramentas especializadas para que SLKBase ajude em responder esta pergunta mesma.

“Assim a maneira de obter de 500 mudanças do gene a dois ou a três que estão jogando um papel essencial na biologia da doença é fazer o que são chamadas experiências do nocaute ou da batida-para baixo da genoma-escala,” Ethier explicou.

Nas experiências da batida-para baixo, Ethier e sua equipe executaram uma série de testes em que cada gene no genoma foi desligado um por um e avaliado para seus efeitos no crescimento ou na sobrevivência da célula cancerosa. Se a célula cancerosa morreu ou parou de se duplicar, esse gene foi julgado para ser essencial para a sobrevivência. Se esse gene igualmente teve um erro, significou que o gene era não somente essencial mas igualmente executava uma função que fizesse a pilha se comportar como o cancro.

Cada linha celular do cancro tem “uma assinatura funcional original do gene,” Ethier explicado.

As terapias que visam estes genes funcionais que conduzem o crescimento do cancro são prováveis ser as mais eficazes. De uma biblioteca de mais de 800 medicamentações experimentais visadas, de “a ferramenta da assinatura Druggable” identifica aquelas que são prováveis ser eficazes contra as células cancerosas porque visam os genes essenciais.

O Web site de SLKBase está aberto a qualquer um que quer conhecer mais sobre linha celular do cancro da mama ou alcança a base de conhecimento genomic e proteomic imensa da pesquisa.

Contudo, o cancro da mama é apenas o começo. Há mais de 500 linha celular do cancro derivadas dos pacientes com virtualmente cada tipo de cancro, e Ethier espera eventualmente inclui-los todos em SLKBase.

Para Ethier, o gene muda a condução da matéria do cancro mais do que o tecido em que ocorrem. Os cancros são uma doença do genoma, nenhuma matéria em que a parte do corpo eles ocorre. Conseqüentemente, todo o cancro seria esperado responder à terapia visada a sua assinatura genomic.

“Em algum momento, nós temos que parar de preocupar-se sobre se é cancro da mama, câncer pulmonar ou cancro do cólon,” dissemos Ethier. “Nós devemos pôr mais ênfase nas características genomic desse cancro porque o cancro é uma doença do genoma.”

Ethier assinou recentemente um acordo de opção com a fundação de MUSC para a revelação da pesquisa que permitirá sua partida, LLC da oncologia do sextante, de continuar a promover o uso de linha celular do cancro e de seus derivados funcionais. A missão da oncologia do sextante é desenvolver estratégias para a engenharia reversa das linha celular individuais que serão finalmente úteis para fazer previsões visadas do tratamento da droga para pacientes.

Source:
Journal reference:

Ethier, S.P., et al. (2020) Development and implementation of the SUM breast cancer cell line functional genomics knowledge base. npj Breast Cancer. doi.org/10.1038/s41523-020-0173-z.