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La nueva base de datos podía apresurar el revelado de las terapias gen-apuntadas para el cáncer de pecho

Todos los medicamentos para el cáncer actuales del pecho primero fueron probados en variedades de células. Cada variedad de células comenzó como cáncer en un paciente. Como tal, cada variedad de células es un sustituto para la enfermedad de ese paciente. Una nueva base de datos de 40 variedades de células del cáncer de pecho, desarrollada por la universidad médica de los investigadores de Carolina del Sur, ayudará a investigadores a profundizar su comprensión de estas variedades de células y apresurará el revelado de nuevas terapias gen-apuntadas.

Las variedades de células son la línea de frente para la investigación del cáncer de pecho porque se derivan de pacientes reales y exhiben las características de la enfermedad que ese paciente experimentó.”

Stephen P. Ethier, Ph.D., profesor en el departamento de la patología y remedio del laboratorio en el cáncer de MUSC y de MUSC Hollings centra al investigador

Las variedades de células representan el cáncer para cuál es, dijeron a Ethier -- una enfermedad polifacética del genoma. El retrato amplio del cáncer como enfermedad compleja, sin embargo, se sobrepasa a menudo en la investigación al laser-foco sobre solamente uno o dos cambios del gen. Ethier cree esto -- la manera actual de hacer la investigación -- es demasiado estrecho y eso las mejores terapias que se convierten requerirá la evaluación de la firma genomic entera.

En un artículo publicado recientemente en cáncer de pecho del npj, Ethier y sus personas describen la puesta en vigor de un nuevo recurso para los investigadores del cáncer. La base de conocimiento de la variedad de células del cáncer de pecho de la SUMA, o SLKBase, activará el campo adelante ofreciendo fácilmente información genomic, proteomic y la otra “omic” navegable en un total de 40 SUMAS y otras variedades de células paciente-derivadas. La base de datos podía contribuir eventual a la identificación, al revelado y a la puesta en vigor de las terapias gen-apuntadas verdad personalizadas para los pacientes con el cáncer de pecho.

El Dr. Stephen Ethier y su esperanza de las personas que su base de datos se desplegará eventual para incluir variedades de células del cáncer de todos los tipos de cáncer.

Los seres humanos tienen aproximadamente 24.000 genes, colectivamente llamados el genoma. Escrito en el lenguaje de la DNA, los genes actúan como instrucciones para cómo las células son crecer, vivir y replegar.

Los desvíos en las instrucciones de la DNA dentro de una célula pueden cambiar final cómo la célula crece, las réplicas y responden a las señales naturales que actúan normalmente como freno a estas funciones. Estos cambios hacen la célula llegar a ser cacerígena.

Las terapias personalizadas o apuntadas, sobre la base de cambios únicos del gen en el cáncer de cada paciente, han sido una meta a largo plazo en la investigación de la oncología y remedio, y se ha hecho el progreso importante. Sin embargo, la ejecución de estrategias terapéuticas verdad personalizadas ha sido lenta.

Un obstáculo tiene sido dificultad que determina y que apunta los cambios del gen que tienen una función en causar enfermedad.

Varios cientos de genes pudieron haber desarrollado desvíos en una célula cancerosa, según Ethier. “La mayor parte de los genes que se cambian, sin embargo, no están desempeñando ningún papel cualesquiera en la biología de la enfermedad,” él explicaron.

¿Cómo pueden los investigadores determinar que de esas mutaciones de gen importan y valen el apuntar?

Con el financiamiento de una concesión clínica y de translación de Carolina del Sur de investigación del instituto del piloto, Ethier y sus personas construyeron las herramientas especializadas para que SLKBase ayude en la contestación de esta misma pregunta.

“Tan la manera de conseguir a partir de 500 cambios del gen a dos o a tres que estén desempeñando un papel esencial en la biología de la enfermedad es hacer qué se llaman los experimentos del golpe de gracia o de la precipitación de la genoma-escala,” Ethier explicó.

En los experimentos de la precipitación, Ethier y sus personas realizaron una serie de pruebas en las cuales cada gen en el genoma fue apagado uno por uno y evaluado para sus efectos sobre el incremento o la supervivencia de la célula cancerosa. Si la célula cancerosa murió o paró el duplicarse, ese gen era juzgado para ser esencial para la supervivencia. Si ese gen también tenía un desvío, significó el gen era no sólo esencial pero también realizó una función que hizo que la célula se comporta como cáncer.

Cada variedad de células del cáncer tiene una “firma funcional única del gen,” Ethier explicado.

Las terapias que apuntan estos genes funcionales que impulsen incremento del cáncer son probables ser las más efectivas. De una biblioteca de más de 800 medicaciones experimentales apuntadas, “la herramienta de la firma de Druggable” determina los que sean probables ser efectivos contra las células cancerosas porque apuntan los genes esenciales.

El Web site de SLKBase está abierto a cualquier persona que quiera conocer más sobre variedades de células del cáncer de pecho o llega hasta la base de conocimiento genomic y proteomic inmensa de la investigación.

Sin embargo, el cáncer de pecho es apenas el principio. Hay más de 500 variedades de células del cáncer derivadas de pacientes con virtualmente cada tipo de cáncer, y Ethier espera eventual incluirlos todos en SLKBase.

Para Ethier, el gen cambia impulsar la materia del cáncer más que el tejido en el cual ocurren. Los cánceres son una enfermedad del genoma, ninguna materia en la cual la parte de la carrocería ellos ocurra. Por lo tanto, se preveía que cualquier cáncer respondiera a la terapia apuntada a su firma genomic.

“En algún momento, tenemos que parar el preocuparnos de si es cáncer de pecho, cáncer o cáncer de colon de pulmón,” dijimos a Ethier. “Debemos poner más énfasis en las características genomic de ese cáncer porque el cáncer es una enfermedad del genoma.”

Ethier firmó recientemente un acuerdo de opción con el asiento de MUSC para el revelado de la investigación que permitirá a su lanzamiento, LLC de la oncología del sextante, continuar ascender el uso de las variedades de células del cáncer y de sus derivados funcionales. La misión de la oncología del sextante es desarrollar las estrategias para la ingeniería reversa de las variedades de células individuales que serán final útiles para hacer las predicciones apuntadas del tratamiento de la droga para los pacientes.

Source:
Journal reference:

Ethier, S.P., et al. (2020) Development and implementation of the SUM breast cancer cell line functional genomics knowledge base. npj Breast Cancer. doi.org/10.1038/s41523-020-0173-z.