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Les chercheurs ont jeté la lumière sur l'événement superspreading du SARS-CoV-2 de Boston

Les chercheurs aux Etats-Unis ont prouvé que la défaillance d'éviter l'importation du coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère dans le Massachusetts a mené à superspreading cela a rigoureusement modifié le cours de l'épidémie et a amplifié la manifestation dans cette zone urbaine principale.

Les découvertes montrent comment le virus peut facilement écarter entre les groupes de personnes apparemment disconnected et mettre en valeur l'importance de donner la priorité à la prévention, au dépistage, et aux mesures d'atténuation en tant qu'élément des efforts pour protéger la santé publique pendant la pandémie de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19).

Les résultats supportent également l'utilisation de l'épidémiologie génomique en temps réel pour aviser le traçage de contact et dans l'aide pour discerner des manifestations locales de ceux qui résultent de l'importation.

Bronwyn MacInnis (institut grand de Harvard et de MIT) et collègues indiquent que l'approche de séquençage du génome utilisée ici pourrait devenir importante dans l'aide pour aborder les défis relevés comme début d'écoles et de lieux de travail pour rouvrir car les mesures de lockdown sont décontractées.

Une version de prétirage du papier est procurable sur le serveur de medRxiv*, alors que l'article subit l'inspection professionnelle.

Choc de la pandémie particulièrement sévère dans le Massachusetts

Puisque les premiers cas de COVID-19 ont été recensés la première fois à Wuhan, Chine, tard l'année dernière, l'agent causal que SARS-CoV-2 a maintenant infecté plus de 24 millions de personnes et ont entraîné les plus de 822.000 morts.

Le choc de la manifestation a été particulièrement sévère dans la condition du Massachusetts, où plus de 126.000 cas ont été maintenant confirmés et où presque 9.000 personnes sont mortes.  

Le premier cas COVID-19 dans le Massachusetts a été recensé le 1er février 2020st. Les comptes de cas alors rapidement ont augmenté jusqu'à début mars et ont fait une pointe pendant la troisième semaine d'avril.

La région de Boston, qui est à la maison environ à 70% de la population du Massachusetts, a représenté les la plupart (environ 80%) des infections et les morts qui se sont produites jusqu'à présent dans la condition.

La pandémie a disproportionnel affecté les populations vulnérables, particulièrement dans les environnements rassemblés tels que des foyers pour sans-abris, des maisons de soins, et des prisons.

Superspreading a joué un rôle important

Comme avec des manifestations précédentes de coronavirus, une caractéristique proéminente de la pandémie COVID-19 superspreading des événements, où une personne infectée transmet le virus à un numéro de gens exceptionnellement grand qui deviennent alors des cas secondaires.  

Cependant, seuls des comptes de cas ne peuvent pas être employés pour déterminer sûrement le point auquel un événement a pu avoir contribué à la boîte de vitesses générale, ni peuvent ils différencier entre types superspreading et autres de boîte de vitesses locale et forte.

« Pourtant la compréhension comment le virus écarte réellement est critique pour donner la priorité à des interventions de santé publique : la propagation boîtier boîtier peut être contrôlée avec des restrictions plus limitées que les mesures de population exigées pour limiter la boîte de vitesses à caractère communautaire, » écrivent MacInnis et équipe. « Les caractéristiques génomiques peuvent indiquer des liens entre les cas qui ne peuvent pas être trouvés par seule l'épidémiologie conventionnelle, y compris la preuve directe de superspreading basée sur des séquences virales partagées. »

Que les chercheurs ont-ils fait ?

L'équipe a exécuté l'ordonnancement génomique et l'analyse phylogénétique de 772 génomes SARS-CoV-2 complets acquis des échantillons nasopharyngaux rassemblés entre le 29 janvierth et du 9 maith à Boston.

MacInnis et collègues ont recensé plus de 80 importations dans la région de Boston, principalement ailleurs dedans des Etats-Unis et de l'Europe, et ont indiqué le rôle superspreading tôt des événements avaient joué en pilotant la boîte de vitesses de communauté.

Les chercheurs ont étudié deux événements superspreading dans lesquels a eu des chocs très différents dû aux différences quand ils se sont produits et les populations qui étaient impliquées.

Que l'étude a-t-elle trouvé ?

Un événement a eu comme conséquence le rapid écarté parmi une population vulnérable mais mené à peu écartez en avant. L'autre événement sensiblement contribué à l'écart actuel de communauté, comprenant parmi les gens sans abri, et mené à la boîte de vitesses entre d'autres endroits domestiques et internationaux. Cet événement impliqué un grand boîtier des cas a associé à une conférence d'affaires qui a eu lieu à Boston fin février.

« Éventuel, plus de 90 caisses ont été diagnostiquées dans les gens liés à cette conférence ou leurs contacts, soulevant le soupçon qu'un événement superspreading s'était produit là, » a dit MacInnis et équipe.

Les chercheurs disent que leur analyse a en effet indiqué une signature de superspreading parmi les cas conférence-associés.

Vingt-huit génomes formés ont comporté un polymorphisme unique particulier de nucléotide, la lignée de parent dont eu largement distribué en Europe pendant janvier et février.

Les chercheurs disent qu'une introduction unique a exercé un effet de dimension hors-série sur la boîte de vitesses suivante due à superspreading dans une population hautement mobile très dès l'abord pendant la pandémie quand beaucoup de mesures d'atténuation encore n'avaient pas été mises en place.

En revanche, un autre événement superspreading qui s'est produit dans une installation de soins qualifiée, a exercé peu d'effet sur la boîte de vitesses en avant, puisqu'il s'est produit plus tard et affecté une population plus d'isolement.

Épidémiologie de SARS-CoV-2 dans le Massachusetts et des génomes viraux ordonnancés. A. Les formes confirmées et présumées cumulatives rapportées dans tout l
Épidémiologie de SARS-CoV-2 dans le Massachusetts et des génomes viraux ordonnancés. A. Les formes confirmées et présumées cumulatives rapportées dans tout l'État dans les MAMANS (7) du 1er mars au 1er mai 2020, et le nombre de ces caisses qui ont été traitées (orange) et avec succès ont fourni des génomes complets avec la couverture de >98% (vert) dans cette étude. B. La proportion cumulative de toutes les MAMANS a confirmé des cas positifs avec des séquences de génome complet des seules personnes qui font partie de cet ensemble de données au fil du temps. C. Cas rapportés quotidiens en travers des MAMANS du 1er mars au 15 juin à l'échelle nationale (bleu) et à MGH (orange). D. Nombre total des cas comparés aux cas selon 100.000 personnes pour des villes en travers des MAMANS. Des villes dans le bleu sont hautement représentées dans l'ensemble de données de génome. E. Distribution des cas de MAMANS avec les génomes viraux ordonnancés par le comté. F. Comme E mais en montrant des comtés seulement de Middlesex et du Suffolk, les deux comtés avec le nombre le plus élevé d'échantillons ordonnancés, par code postal. Des cas liés aux environnements rassemblés ont été exclus des plans dans E et F.

L'épidémiologie génomique en temps réel peut être de plus en plus précieuse

Les chercheurs disent que leur analyse leur a permise de rassurer le personnel hospitalier que ce n'était pas un contrôle faible d'infection qui avait mené à superspreading, puisqu'il a montré cela en dépit de nombreuses introductions dans l'installation, seulement on était responsable de 90% de cas.

« Nos résultats mettent en valeur l'échec des mesures d'éviter l'importation dans des MAMANS tôt dans la manifestation, souligner le rôle de superspreading en amplifiant une manifestation dans une zone urbaine importante, et jeter des fondements pour la découverte de contact avisés par des caractéristiques génétiques, » écrit l'équipe.

Les auteurs proposent que « l'épidémiologie génomique en temps réel puisse être de plus en plus précieuse pendant que les écoles et les lieux de travail dirigent les défis de la réouverture, pendant qu'elle peut aider à distinguer les manifestations locales au sein des institutions et les introductions de l'extérieur. »

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally has a Bachelor's Degree in Biomedical Sciences (B.Sc.). She is a specialist in reviewing and summarising the latest findings across all areas of medicine covered in major, high-impact, world-leading international medical journals, international press conferences and bulletins from governmental agencies and regulatory bodies. At News-Medical, Sally generates daily news features, life science articles and interview coverage.

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