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Os pesquisadores derramaram a luz no evento superspreading do SARS-CoV-2 de Boston

Os pesquisadores nos Estados Unidos mostraram que a falha impedir a importação do coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2) em Massachusetts conduziu a superspreading isso alterou dràstica o curso da epidemia e amplificou a manifestação nesta área urbana principal.

Os resultados mostram como o vírus pode facilmente espalhar entre grupos de pessoas convenientemente desligado e destacar a importância de dar a prioridade a prevenção, a detecção, e as medidas da mitigação como parte dos esforços para proteger a saúde pública durante a pandemia da doença 2019 do coronavirus (COVID-19).

Os resultados igualmente apoiam o uso da epidemiologia genomic do tempo real para informar o traçado do contacto e na ajuda distinguir manifestações locais daquelas que resultam da importação.

Bronwyn MacInnis (instituto largo de Harvard e de MIT) e colegas diz que o genoma que arranja em seqüência a aproximação usada aqui poderia se tornar importante na ajuda abordar os desafios enfrentados como o começo das escolas e dos locais de trabalho para reabrir porque as medidas do lockdown são relaxado.

Uma versão da pré-impressão do papel está disponível no server do medRxiv*, quando o artigo se submeter à revisão paritária.

Impacto da pandemia particularmente severa em Massachusetts

Desde que os primeiros exemplos de COVID-19 foram identificados primeiramente em Wuhan, China, tarde no ano passado, o agente causal SARS-CoV-2 tem contaminado mais de 24 milhões de pessoas e tem causado agora mais de 822.000 mortes.

O impacto da manifestação foi particularmente severo no estado de Massachusetts, onde mais de 126.000 casos têm sido confirmados agora e onde quase 9.000 povos morreram.  

O primeiro caso COVID-19 em Massachusetts foi identificado o 1º de fevereiro de 2020st. As contagens do caso então aumentaram rapidamente até o princípio de março e repicaram durante a terceira semana de abril.

A área de Boston, que é home a aproximadamente 70% da população de Massachusetts, esclareceram a maioria (ao redor 80%) das infecções e as mortes que ocorreram no estado até agora.

A pandemia afectou desproporcional populações vulneráveis, especialmente em ambientes vivos reunidos tais como abrigos desabrigados, HOME do cuidado, e prisões.

Superspreading jogou um maior protagonismo

Como com manifestações precedentes do coronavirus, uma característica proeminente da pandemia COVID-19 superspreading os eventos, onde um indivíduo contaminado transmite o vírus a um número de pessoas raramente grande que se transformam então casos secundários.  

Contudo, as contagens do caso apenas não podem ser usadas para determinar confiantemente a extensão a que um evento pode ter contribuído à transmissão total, nem podem diferenciar-se entre tipos superspreading e outros de transmissão local e intensa.

“Contudo compreender como o vírus está espalhando realmente é crítica para dar a prioridade a intervenções da saúde pública: a propagação conjunto-baseada pode ser controlada com limitações mais limitadas do que as medidas da população exigidas limitar a transmissão comunidade-baseada,” escrevem MacInnis e equipe. “Os dados Genomic podem revelar conexões entre os casos que não podem ser detectados com a epidemiologia convencional sozinha, incluindo a evidência directa de superspreading baseada em seqüências virais compartilhadas.”

Que os pesquisadores fizeram?

A equipe executou arranjar em seqüência genomic e análise filogenética de 772 genomas SARS-CoV-2 completos adquiridos das amostras nasopharyngeal recolhidas entre o 29 de janeiroth e o 9 de maioth em Boston.

MacInnis e os colegas identificaram mais de 80 importações na área de Boston, principalmente em outra parte dentro dos Estados Unidos e de Europa, e revelaram o papel que superspreading cedo eventos tinham jogado em conduzir a transmissão da comunidade.

Os pesquisadores estudaram dois eventos superspreading em que teve impactos muito diferentes devido às diferenças quando ocorreram e as populações que eram involvidas.

Que o estudo encontrou?

Um evento conduziu ao rapid espalhado entre uma população vulnerável mas conduzido a pouco espalhe avante. O outro evento contribuído significativamente a propagação em curso da comunidade, incluindo entre o os sem-abrigo, e conduzido à transmissão entre outras áreas domésticas e internacionais. Este evento envolveu um grande conjunto de casos relativos a uma conferência de negócio que ocorresse em Boston ao fim de fevereiro.

“Finalmente, mais de 90 caixas foram diagnosticadas nos povos associados com esta conferência ou seus contactos, levantando a suspeita que um evento superspreading tinha ocorrido lá,” disse MacInnis e equipe.

Os pesquisadores dizem que sua análise revelou certamente uma assinatura de superspreading entre os casos conferência-associados.

Vinte e oito genomas formados caracterizaram um único polimorfismo particular do nucleotide, a linhagem do pai de que tido distribuído extensamente em Europa durante janeiro e fevereiro.

Os pesquisadores dizem que uma única introdução teve um efeito do tamanho extragrande na transmissão subseqüente devido a superspreading em uma população altamente móvel muito cedo sobre durante a pandemia quando muitas medidas da mitigação não tinham sido postas ainda no lugar.

Pelo contraste, um outro evento superspreading que ocorresse em uma facilidade de cuidados especializada, teve pouco efeito na transmissão para a frente, desde que ocorreu mais atrasado e afetado uma população mais isolada.

Epidemiologia de SARS-CoV-2 em Massachusetts e de genomas virais arranjados em seqüência. A. Os casos confirmados e presumidos cumulativos relatados por todo o estado no miliampère (7) do 1º de março ao 1º de maio de 2020, e o número destas caixas que foram processadas (laranja) e com sucesso renderam genomas completos com cobertura de/>98% (verde) neste estudo. B.A proporção cumulativa de todo o miliampère confirmou casos positivos com seqüências completas do genoma dos indivíduos originais que são parte deste conjunto de dados ao longo do tempo. C. Casos do 1º de março ao 15 de junho diariamente relatados através do miliampère por todo o estado (azul) e em MGH (alaranjado). D. Número total de casos comparados aos casos por 100.000 povos para cidades através do miliampère. As cidades no azul são representadas altamente no conjunto de dados do genoma. E. Distribuição de casos do miliampère com genomas virais arranjados em seqüência pelo condado. F. Como em E mas em mostrar condados somente de Middlesex e de Suffolk, os dois condados com o número o mais alto de amostras arranjadas em seqüência, pelo código postal. Os casos associados com os ambientes vivos reunidos foram excluídos dos mapas em E e em F.
Epidemiologia de SARS-CoV-2 em Massachusetts e de genomas virais arranjados em seqüência. A. Os casos confirmados e presumidos cumulativos relatados por todo o estado no miliampère (7) do 1º de março ao 1º de maio de 2020, e o número destas caixas que foram processadas (laranja) e com sucesso renderam genomas completos com cobertura de >98% (verde) neste estudo. B.A proporção cumulativa de todo o miliampère confirmou casos positivos com seqüências completas do genoma dos indivíduos originais que são parte deste conjunto de dados ao longo do tempo. C. Casos do 1º de março ao 15 de junho diariamente relatados através do miliampère por todo o estado (azul) e em MGH (alaranjado). D. Número total de casos comparados aos casos por 100.000 povos para cidades através do miliampère. As cidades no azul são representadas altamente no conjunto de dados do genoma. E. Distribuição de casos do miliampère com genomas virais arranjados em seqüência pelo condado. F. Como em E mas em mostrar condados somente de Middlesex e de Suffolk, os dois condados com o número o mais alto de amostras arranjadas em seqüência, pelo código postal. Os casos associados com os ambientes vivos reunidos foram excluídos dos mapas em E e em F.

A epidemiologia genomic do tempo real pode ser cada vez mais valiosa

Os pesquisadores dizem que sua análise os permitiu de tranquilizar o pessoal hospitalar que não era o controle deficiente da infecção que tinha conduzido ao superspreading, desde que mostrou aquele apesar das introduções numerosas na facilidade, simplesmente um era responsável para 90% dos casos.

“Nossos resultados destacam a falha das medidas impedir a importação no miliampère cedo na manifestação, relevo o papel de superspreading em amplificar uma manifestação em uma área urbana principal, e colocam uma fundação para o seguimento do contacto informado por dados genéticos,” escrevem a equipe.

Os autores sugerem que do “a epidemiologia genomic tempo real possa ser cada vez mais valiosa enquanto as escolas e os locais de trabalho navegam os desafios da reabertura, enquanto pode ajudar a distinguir entre manifestações locais dentro das instituições e introduções da parte externa.”

Observação *Important

o medRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Journal reference:
Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally has a Bachelor's Degree in Biomedical Sciences (B.Sc.). She is a specialist in reviewing and summarising the latest findings across all areas of medicine covered in major, high-impact, world-leading international medical journals, international press conferences and bulletins from governmental agencies and regulatory bodies. At News-Medical, Sally generates daily news features, life science articles and interview coverage.

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