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L'analyse génomique de la tension spécifique d'Escherichia coli peut aider à développer les vaccins potentiels

Les agents pathogènes d'origine alimentaire sont très courants et habituellement bénins, mais certaines tensions virulentes des agents pathogènes peuvent avoir comme conséquence la maladie sévère et même la mort. Discerner des tensions spécifiques des agents pathogènes peut aider des scientifiques mieux à les comprendre et à développer des biomarqueurs pour aider à les trouver dans les patients, accélérant le diagnostic et la demande de règlement.

L'université aux chercheurs de Buffalo ont maintenant complété l'analyse génomique d'une tension spécifique de Shiga-toxine Escherichia coli (STEC) qui peut entraîner des manifestations de maladie sévère et est de plus en plus courante. La recherche a pu jouer un rôle en augmentant la compréhension des infections de STEC et, potentiellement, dans les vaccins se développants contre eux.

Selon le centres pour le contrôle et la prévention des maladies, on estime qu'entraînent plus de 265.000 infections par an aux États-Unis, et est associé STEC à plus de 3.600 hospitalisations et aux approximativement 30 morts.

Publié dans le mois dernier génomique de BMC, l'article décrit l'analyse génomique complétée sur une seule tension de STEC d'isolement dans un enfant an autrement en bonne santé de 2 ½ habitant dans le comté de Davidson, Tennessee.

L'agent pathogène a entraîné la maladie grave, y compris le syndrome hémolytique et urémique, une condition qui détruit des hématies, abaisse des plaquettes et bloque des vaisseaux sanguins en reins, ayant pour résultat les dégâts d'anémie et de rein.

L'enfant a survécu mais a été hospitalisé pendant un mois et a supporté des complications sévères affectant les systèmes multiples d'organe, y compris ses poumons, coeur, rein, cerveau, appareil circulatoire et tractus gastro-intestinal.

Une préoccupation croissante de santé publique

La Shiga-toxine produisant Escherichia coli qu'il était infecté avec est un non-0157 STEC. Tandis que les agents pathogènes classifiés en tant que 0157 infections de STEC généralement sont plus courants et ont comme conséquence plus de maladie sévère, le numéro d'apparaître, agents pathogènes de non-0157 STEC a été en augmentation. Certains mènent à la maladie sévère, produisant une préoccupation croissante de santé publique, selon les chercheurs d'UB.

Le papier déclare qu'il y a plus de 400 de ces tensions de non-0157 STEC, et plus qu'un quart sont rapportés pour entraîner la maladie gastro-intestinale, présentant souvent d'abord comme diarrhée sanglante avec le syndrome hémolytique et urémique et si non traités, dans de rares cas, la mort.

L'agent pathogène spécifique que l'enfant était infecté avec était un STEC 0145 : H25. « Puisque les études génomiques sur non-0157 apparaissant STEC sont limitées, nos études sont significatives parce qu'elles indiquent le renivellement génétique de STEC émergent 0145 : H25 en comparaison d'autres tensions de STEC. »

Oscar G. Gómez-Duarte, DM, PhD, auteur correspondant d'étude et professeur agrégé, service de pédiatrie, université à Buffalo

Gómez-Duarte est également le responsable de la Division des maladies infectieuses pédiatriques dans l'École de Médecine de Jacobs et les sciences biomédicales à UB et d'un pédiatre avec la pédiatrie d'UBMD.

« Les découvertes indiquent comment ce STEC apparaissant entraîne la maladie sévère et celui il peut être comme virulent, ou même plus virulent, que des tensions plus courantes de STEC, menant à sévère et même à la maladie mortelle dans des hôtes susceptibles, » il a dit. « Il fournit également des informations sur la façon dont cette infection potentiellement évitable continue à affecter les personnes vulnérables. »

Gènes de virulence

Une recherche de clés de l'étude était, dit-il, que ces 0145 : Le sérotype H25 mène à l'infection particulièrement sévère. D'ailleurs, en plus des gènes transportants de virulence actuels dans 0157 STEC, il a les gènes complémentaires et les gènes potentiels neufs de virulence par rapport à d'autres tensions non-0157 qui ont été étudiées. « Ces découvertes méritent l'analyse approfondie pour comprendre la pathogénie de ces infections émergentes de STEC, » a dit Gómez-Duarte.

Source:
Journal reference:

Guerra, J. A., et al. (2020) Comparative genomic analysis of a Shiga toxin-producing Escherichia coli (STEC) O145:H25 associated with a severe pediatric case of hemolytic uremic syndrome in Davidson County, Tennessee, US. BMC Genomics. doi.org/10.1186/s12864-020-06967-3.