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Capacidad reunida de la prueba de los aumentos COVID-19 de la prueba de la saliva

A medida que el pandémico COVID-19 en los E.E.U.U. continúa extenderse agresivamente, la prueba sigue siendo algo disfuncional y no coordinada. Esto la ha hecho que desafiaba para probar para el coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática y para obtener resultados para la acción que se tomará para contener la extensión del virus. Ahora, un nuevo estudio por los investigadores en la Facultad de Medicina de Yale y la escuela de Yale de la salud pública y publicada en el medRxiv* del servidor de la prueba preliminar muestra en septiembre de 2020 que las muestras reunidas de la saliva pueden salvar recursos y aumentar la capacidad de la prueba, diferenciando importante en la administración del pandémico.

Prueba del centro común

La restricción más importante de parar el virus ha sido la disponibilidad limitada de los laboratorios de las pruebas y de la prueba de los estuches, de los reactivos, y. Sin embargo, la prueba es crucial no sólo diagnosticar pero también revisar para la enfermedad y vigilar y predecir brotes. Para aumentar la capacidad de la prueba en todos los lugares donde están necesarias las reuniones de la gente para el retrono a la vida casi normal, tal como escuelas y lugares de trabajo, las muestras reunidas se han convertido en la manera de ir.

La prueba por lote también llamada, la reunión de las muestras de la prueba permite que prueben junta a la gente múltiple para descubrir la presencia del virus en uno o más de las muestras. Si el resultado es negativo, denuncian todos los individuos para ser negativos, mientras que si el positivo, cada muestra debe entonces ser reexaminado individualmente.

Hasta ahora, las muestras reunidas han utilizado la reacción en cadena reversa de la transcriptase-polimerasa (RT-PCR) para descubrir el ARN viral, después primero de extraerlo de muestras individuales. Sin embargo, la prueba reunida puede ser iniciada después de mezclar las muestras y de extraer el ARN reunido del mismo modo que.  Estudios anteriores han mostrado que estas aproximaciones salvan recursos, pero los datos del laboratorio son todavía necesarios sostener las modificaciones futuras.

Pues la talla de centro común aumenta, más muestras serían clasificadas como negativa con respecto a las muestras probadas individualmente (unpooled). Cada punto representa una de las muestras de la saliva del IMPACTO de Yale que generaron la señal cuando eran probadas por el RT-qPCR para SARS-CoV-2 N1. De éstos, 135 bajaron abajo del umbral del ciclo de 38 y fueron clasificados como positivo para el virus. El coeficiente de regresión (que representaba contaba con aumento del Ct) para cada uno de las tallas de centro común fue agregado al valor del Ct generado de la muestra no diluida (mostrada en negro) para determinar el nivel relativo de sensibilidad para cada talla de centro común.
Pues la talla de centro común aumenta, más muestras serían clasificadas como negativa con respecto a las muestras probadas individualmente (unpooled). Cada punto representa una de las muestras de la saliva del IMPACTO de Yale que generaron la señal cuando eran probadas por el RT-qPCR para SARS-CoV-2 N1. De éstos, 135 bajaron abajo del umbral del ciclo (Ct) de 38 y fueron clasificados como positivo para el virus. El coeficiente de regresión (que representaba contaba con aumento del Ct) para cada uno de las tallas de centro común fue agregado al valor del Ct generado de la muestra no diluida (mostrada en negro) para determinar el nivel relativo de sensibilidad para cada talla de centro común.

Saliva para la detección viral del ARN

Recientemente, la saliva ha sido mostrada por las personas actuales de investigadores para ser una opción eficiente para la detección viral del ARN. No sólo es fácil uno mismo-cerco, pero no requiere almacenadores intermedios que se estabilizan o mantenimiento de la cadena fría durante transporte.

Diversas tallas de centro común

El estudio actual se centra en la reunión de 5, 10, y 20 muestras de la saliva para un flujo de trabajo de la prueba de la alto-producción. Las muestras vinieron de los hospitalizado COVID-19 y de los profesionales de la atención sanitaria. Las muestras que contenían el virus fueron combinadas para todos los valores de umbral del ciclo abajo de 38 Ct con saliva negativa. Posteriormente, realizaron la extracción del ARN y la detección.

Todo muestrea incluido en el centro común había sido probado ya individualmente. La comparación entre los resultados de la prueba del centro común y el último muestra que con el aumento de la talla de centro común, sensibilidad de la prueba disminuida por ~2, 3, y 3,6 Ct con un centro común de 5, 10, y 15, respectivamente. Este efecto no varía con el valor del Ct para la muestra no diluida, y por lo tanto no causará una disminución en sensibilidad en diversos valores del Ct. Es decir sigue siendo igualmente sensible en las diversas cargas virales.

Estos resultados están de acuerdo con conclusión reunidas anteriores de la investigación de la prueba del lampazo. Sin embargo, el volumen creciente también usado actual de la extracción del estudio, a partir del μL el 300 al μL 400, pero sin el cambio del volumen de elución, para aumentar sensibilidad a un nivel comparable a ése para las muestras no diluidas.

Una vez más el efecto de reunir las muestras después de la extracción del ARN, y de usar patrones reunidos del ARN de muestras no diluidas de la saliva, en equipos de 5 y 10, mostró la disminución de la sensibilidad para ser similar a ése obtenido con la reunión de la preextracción. Sin embargo, con estes último, la variación de muestra individual era más pequeña.

El análisis de los valores del Ct para todas las muestras positivas de su estudio anterior mostró eso con un centro común de 5, 10, y 20 muestras, el cerca de 93%, el 90% y el 85% de muestras serían descubiertas correctamente, respectivamente, con respecto a la detección individual de las muestras. Es decir la sensibilidad reduce por 12-15% con la prueba individual en relación con reunida de la prueba.

La rentabilidad de la prueba reunida de la saliva

Una técnica de prueba amplia debe también ser barata para lograr su objetivo de determinar a gente infecciosa para aislarla de la población. La rentabilidad de esta estrategia, por lo tanto, fue comparada a la prueba individual de la muestra. Los investigadores modelaron el número de pruebas requeridas para una población de 10.000 en los niveles de variación de incidencia, usando centros comunes de 5, 10, o 20.

Esto mostró que el número de centros comunes positivos aumentaría con la incidencia de levantamiento, que significa que pruebas más individuales serán requeridas para confirmar la presencia de la infección en individuos.

Número reducido de pruebas

Cuando la incidencia es el 3% o más, por lo tanto, centros comunes más pequeños de 5 darán lugar al número óptimo de pruebas en conjunto. Pero con una incidencia más inferior, tallas de centro común más grandes de 10 o 20 reducirán el número de pruebas requeridas, salvando en abastecimientos costado y de la prueba. Por ejemplo, con una incidencia de 0,8%, una talla de centro común de 20 sería ideal de asegurarse que esa vigilancia en curso de la población e identificación con anticipación de nuevos brotes es posible.

Generalmente una vez que la población probada tiene una incidencia del 30% o menos, las muestras reunidas reducirían el número de pruebas necesarias. Más allá de esta incidencia, las tallas reunidas no fueron probadas. Sin embargo, a incidencia reducida, el ahorro en costes se asoció a aumentos reunidos de la prueba.

Para ilustrar esto, los investigadores encontraron eso con una incidencia de 0,5%, apenas sobre 1.300 pruebas serían suficientes para revestir una población de 10.000 personas. Esto significaría salvar sobre $260.000 por la prueba reunida comparado con la prueba individual, dado que las pruebas costaron típicamente $30 por cada uno, mientras que todavía determina 43-50 infecciones.

Frecuencia de prueba creciente

Una ventaja incluso mayor es que la frecuencia de prueba creciente está permitida, que significa que determinan y que están aislados a individuos más infecciosos, previniendo la extensión viral. Así, incluso en áreas de la incidencia inferior, la prueba reunida todavía tiene ventajas económicas importantes, ascendiendo vigilancia continuada.

Los investigadores comentan, “nuestro modelo demuestran que como fluctúan los brotes locales, la variación de tallas de centro común en la reacción tendrá ventajas de los recurso-ahorros. Tomada junta, la prueba reunida del tipo no invasor y de poco costo de la muestra de la saliva facilita la duración y la anchura extendidas de las estrategias de la prueba de cribado.”

Investigación para la vigilancia, no diagnosis para el tratamiento

La estrategia de prueba reunida aprobada por los E.E.U.U. Food and Drug Administration (FDA) estará del valor más grande en una población con una alta incidencia de la infección. Sin embargo, desde las caídas de la sensibilidad por ~12-15% con los centros comunes de 10 o 20 muestras, la autorización del FDA puede ocurrir solamente si ésta se reconoce para ser una estrategia de la investigación bastante que una herramienta diagnóstica, y si la capacidad para ofrecer una prueba más frecuente y relanzada también se considera.

Una vez más dicen, “la probabilidad de un falso negativo no se debe considerar por prueba, sino bastante para un régimen de prueba dado durante un periodo de tiempo especificado.” También consideran el número real de pruebas probablemente todavía requeridas para ser más bajo, pues hay probable ser más de un resultado positivo en un único centro común. Los protocolos de la prueba se pueden también pellizcar para rendir el número más importante de positivos verdaderos reduciendo el efecto de la dilución de la muestra. Por ejemplo, el volumen de muestra se podría aumentar al máximo, o al volumen de elución del ARN reducido, mientras que un orden de magnitud aumenta el umbral de la positividad del Ct. El paso de la extracción del ARN puede también ser omitido hasta después de la reunión.

El estudio concluye, “así como la facilidad de la colección de la saliva, esta estrategia se debe considerar como estrategia efectiva de la prueba para desplegar la anchura de la prueba y de la vigilancia continuada durante el pandémico en curso COVID-19.”

Advertencia *Important

el medRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

Journal reference:
Dr. Liji Thomas

Written by

Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

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