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El estudio muestra cómo el pandémico reveló a través del mundo

Un nuevo estudio combina genómica evolutiva de muestras del coronavirus con epidemias computador-simuladas y archivos detallados del viaje para reconstruir la extensión del coronavirus a través del mundo en detalle sin precedente.

Publicado en la ciencia del gorrón, los resultados sugieren un período extendido de la oportunidad perdida cuando la prueba y el trazado intensivos del contacto pudieron haber evitado que SARS-CoV-2 establecimiento en Norteamérica y Europa.

El papel también desafía las sugerencias que conectaron los casos sabidos más tempranos de COVID-19 en cada continente en enero a los brotes descubrieron semanas más adelante, y ofrece los discernimientos valiosos que podrían informar a la reacción de la salud pública y ayudar con la anticipación y la prevención de los brotes futuros de COVID-19 y de otras enfermedades zoonóticas.

Nuestra aspiración era desarrollar y aplicar nueva tecnología potente para conducto un análisis definitivo de cómo el pandémico reveló en espacio y tiempo, a través del globo. Antes, había lotes de posibilidades que conectaban alrededor en un mish-puré de la ciencia, de ambientes sociales y de un número sin precedente de publicaciones de la prueba preliminar todavía que aguardaban la revisión paritaria.”

Michael Worobey, investigador, Universidad de Arizona

Worobey también llevó a personas interdisciplinarias de científicos a partir de 13 instituciones de investigación en los E.E.U.U., Bélgica, Canadá y el Reino Unido.

Las personas basaron su análisis en resultados del genoma viral que ordenaba los esfuerzos, que comenzaron inmediatamente después que el virus fue determinado. Estos esfuerzos crecieron rápidamente en un esfuerzo mundial sin precedente en escala y paso y han rendido decenas de miles de series del genoma, público - disponible en bases de datos.

El contrario a las narrativas dispersas, las primeras documentó llegadas de los individuos infectados que viajaban de China a los E.E.U.U. y Europa no se agravó en los brotes continentales, los investigadores encontrados.

En lugar, las dimensiones rápidas y decisivas tuvieron como objetivo el trazar y conteniendo esas incursiones iniciales del virus eran acertado y debe servir como reacciones modelo que dirigían las acciones futuras y los planes de acción por gobiernos y dependencias de la salud pública, los autores del estudio concluyen.

Cómo el virus llegó en los E.E.U.U. y la Europa

Un vuelo nacional chino en Seattle de Wuhan, China sintió bien el 15 de enero al primer paciente en los E.E.U.U. mostrados para ser infectado con el coronavirus nuevo y el primer para hacer un genoma SARS-CoV-2 ordenar. Señalaron a este paciente “WA1.” No era hasta seis semanas más adelante que varios casos adicionales fueron descubiertos en el estado de Washington.

¿“Y mientras que todo a que va el tiempo más allá, todo el mundo consiste en la oscuridad y preguntarse, “qué está suceso? “” Worobey dijo. “Esperamos seamos ACEPTABLES, esperamos que no haya otros casos, y entonces se pone de manifiesto, de un programa de muestreo viral de la comunidad notable en Seattle, que hay más casos en Washington y son genético muy similares al virus de WA1.”

Worobey y sus colaboradores probaron la hipótesis que prevalecía que sugerían que el paciente WA1 había establecido un atado de la transmisión que iba desapercibido por seis semanas.

Aunque los genomas muestrearan en febrero y marzo semejanzas de la parte con WA1, son bastante diferentes que la idea de WA1 que establece el brote de seguimiento es muy inverosímil, ellos determinaron. Las conclusión de los investigadores indican que ocurrió el salto de China a los E.E.U.U. probablemente conectado o hacia el 1 de febrero en lugar de otro.

Los resultados también ponen para descansar la especulación que este brote, el atado sustancial más temprano de la transmisión de los E.E.U.U., se pudo haber iniciado indirectamente por la dispersión del virus de China a la Columbia Británica, Canadá, apenas al norte del estado de Washington, y después se extendió de Canadá a los E.E.U.U.

Los genomas múltiples SARS-CoV-2 publicados por el Centro de control de enfermedades de la Columbia Británica aparecían ser ancestrales a las variantes virales muestreadas en el estado de Washington, sugiriendo fuertemente un origen canadiense de la epidemia de los E.E.U.U. Sin embargo, el actual estudio reveló desvíos de secuencia en esos genomas, así eliminando este decorado.

En lugar, el nuevo estudio implica una fuente del brote de los E.E.U.U., la derecha de directo-de-China alrededor del tiempo que la administración de los E.E.U.U. ejecutó una prohibición de viaje para las hojas de ruta (traveler) de China a principios de febrero.

La nacionalidad del “caso del índice” del brote de los E.E.U.U. no puede ser sabida con certeza porque decenas de miles de ciudadanos de los E.E.U.U. y de casquillos de la visa viajaron de China a los E.E.U.U. incluso después la prohibición tomó efecto.

Un decorado similar marca la primera introducción sabida de coronavirus en Europa. El 20 de enero, un empleado de una compañía automotor del abastecimiento en Baviera, Alemania, voló hacia adentro para una reunión de negocios de Shangai, China, llevando unknowingly el virus, llevando final a la infección de 16 compañeros de trabajo.

En ese caso, también, una reacción impresionante de la prueba rápida y el aislamiento evitaron que el brote se extendiera más lejos, el estudio concluye. El contrario a la especulación, este brote alemán no era la fuente del brote en Italia septentrional que se extendió eventual extensamente a través de Europa y eventual a New York City y al descanso de los E.E.U.U.

Los autores también muestran que esta ruta de la dispersión los China-a-Italia-E.E.U.U. encendió atados de la transmisión en la costa este ligeramente más adelante en febrero que el movimiento los China-a-E.E.U.U. del virus que estableció el brote del estado de Washington. El atado de la transmisión de Washington también precedió los pequeños atados de la transmisión de la comunidad en febrero en California, haciéndole el más temprano dondequiera de Norteamérica.

Trabajos tempranos de la contención

Los autores dicen las intervenciones intensivas, implicando la prueba, trazado del contacto, dimensiones del aislamiento y un alto nivel de concordancia de los individuos infectados, que denunciaron sus síntomas a las autoridades sanitarias y uno mismo-los aislaron a tiempo, Alemania ayudada y el área de Seattle contiene esos brotes en enero.

“Creemos que esas dimensiones dieron lugar a una situación donde las primeras chispas podrían ser estampadas con éxito fuera, previniendo la extensión adicional en la comunidad,” Worobey dijo.

“Qué esto nos informa es que las dimensiones admitidas esos casos son altamente efectivas y deben servir como heliografía para las reacciones futuras a las enfermedades emergentes que tienen el potencial de intensificar en pandémicos mundiales.”

Para reconstruir el despliegue del pandémico, los científicos se ejecutaron los programas de computadora que simularon cuidadosamente la epidemiología y la evolución del virus, es decir cómo SARS-CoV-2 extendido y transformado en un cierto plazo.

“Esto permitió que volviéramos a efectuar la cinta de cómo la epidemia reveló, una y otra vez, y entonces verifica los decorados que emergen en las simulaciones contra las configuraciones que vemos en realidad,” Worobey dijo.

¿“En el caso de Washington, podemos pedir, “qué si ese paciente WA1 que llegó en los E.E.U.U. el 15 de enero comenzó realmente ese brote? ¿“Bien, si él lo hizo, y usted vuelve a efectuar esa epidemia repetidamente y encima, y después muestrea a pacientes infectados de esa epidemia y desarrolla el virus de esa manera, usted consigue una configuración que parezca lo que vemos en realidad? Y la respuesta era ninguna,” él dijo.

¿“Si usted siembra ese brote italiano temprano con el que está en Alemania, usted ve la configuración que usted consigue en los datos evolutivos? Y la respuesta, es otra vez ninguna,” él dijo.

“Volviendo a efectuar la introducción de SARS-CoV-2 en los E.E.U.U. y la Europa con simulaciones, mostramos que era muy inverosímil que las introducciones virales primero documentadas en estas escenas llevaron a los atados productivos de la transmisión,” dijo al co-autor Joel Wertheim de la Universidad de California, San Diego.

Los “análisis epidemiológicos moleculares son increíblemente potentes para las configuraciones de las transmisiones que revelan de SARS-CoV-2.”

Otros métodos entonces fueron combinados con los datos de las epidemias virtuales, rindiendo los resultados excepcionalmente detallados y cuantitativos.

El “fundamental a los soportes de este trabajo el nuestro combinar de la nueva herramienta detalló la información de la historia del viaje y el phylogenetics, que produce una clase “de árbol de familia” de cómo los diversos genomas del virus muestreados de individuos infectados se relacionan el uno al otro,” dijo al co-autor Marc Suchard de la Universidad de California, Los Ángeles.

“Las reconstrucciones evolutivas más exactas de estas herramientas ofrecen un paso crítico para entender cómo SARS-CoV-2 se extendió global en tal breve periodo de tiempo.”

“Tenemos que tener presente que hemos estudiado solamente la evolución a corto plazo de este virus, así que no ha tenido mucho tiempo para acumular muchas mutaciones,” dijo al co-autor Felipe Lemey de la universidad de Lovaina, Bélgica.

“Agregue a ése el muestreo irregular de genomas de diversas partes del mundo, y se pone de manifiesto que hay ventajas enormes que se ganarán de integrar las diversas fuentes de información, combinando reconstrucciones genomic con aproximaciones complementarias como archivos del vuelo y el número total de los casos COVID-19 en diversas regiones globales en enero y febrero.”

“Nuestra investigación muestra que cuando usted hace la intervención y la detección tempranas bien, puede tener un impacto masivo, en la prevención de pandémicos y controlándolos una vez que progresan,” Worobey dijo.

“Mientras que la epidemia deslizada eventual a través, allí era las victorias tempranas que nos muestran la manera adelante: La prueba y la identificación completas del caso son armas potentes.”

Source:
Journal reference:

`Worobey, M., et al. (2020) The emergence of SARS-CoV-2 in Europe and North America. Science. doi.org/10.1126/science.abc8169.