Avertissement : Cette page est une traduction automatique de cette page à l'origine en anglais. Veuillez noter puisque les traductions sont générées par des machines, pas tous les traduction sera parfaite. Ce site Web et ses pages Web sont destinés à être lus en anglais. Toute traduction de ce site et de ses pages Web peut être imprécis et inexacte, en tout ou en partie. Cette traduction est fournie dans une pratique.

La structure de coronavirus de "bat" et de pangolin jette la lumière sur l'évolution SARS-CoV-2

Les chercheurs à l'université de Tsinghua, Pékin, ont entrepris une étude fournissant des analyses neuves possibles dans l'évolution et la boîte de vitesses hétérospécifique du coronavirus 2 (SARS-CoV-2), l'agent de syndrôme respiratoire aigu sévère responsable de la pandémie actuelle de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19).

L'analyse de l'équipe des protéines virales de pointe trouvées sur SARS-CoV-2 et deux coronaviruses étroitement liés a indiqué des différences dans leur capacité de gripper et infecter les cellules hôte qui pourraient expliquer pourquoi SARS-CoV-2 a évolué une capacité si élevée d'infection.  

L'équipe a recensé les résidus importants dans les domaines récepteur-grippants de pointe (RBDs) de SARS-CoV-2, le coronavirus RaTG13 de "bat", et le coronavirus PCoV_GX de pangolin au lequel soyez à la base des différences dans les activités de ces protéines de pointe et de leur capacité de gripper et d'infecter des cellules hôte.

Crédit d
Crédit d'image : 2630ben/Shutterstock

Xinquan Wang et collègues proposent que cinq résidus, en particulier, soient critiques à l'évolution SARS-CoV-2 de la pointe RBD, en raison du rôle qu'ils jouent en activant le grippement serré à l'enzyme de conversion de l'angiotensine humaine 2 (hACE2) de récepteur de cellule hôte.

« Ces résultats indiquent collectivement que le grippement RBD-ACE2 intense et l'échantillonnage conformationnel efficace de RBD sont exigés pour l'évolution de SARS-CoV-2 pour gagner l'infection très efficace, » écrit l'équipe.

Une version de prétirage du papier est procurable sur le bioRxiv* de service, alors que l'article subit l'inspection professionnelle.

Boîte de vitesses hétérospécifique des coronaviruses un danger actuel

Animal-à-humain (boîte de vitesses zoonotique) des coronaviruses représente un danger significatif à la santé des personnes mondial, comme démontré par l'émergence coronavirus respiratoire de SARS-CoV-1, de Moyen-Orient de syndrome (MERS-CoV), et SARS-CoV-2 pendant les deux dernières décennies.

La preuve actuelle propose qu'assimilé à SARS-CoV-1 et à MERS-CoV, SARS-CoV-2 provenu probablement de "bat" avant d'évoluer dans des hôtes d'intermédiaire et puis sauter aux êtres humains.

Le coronavirus RaTG13, qui a été trouvé dans "bat" en fer à cheval, a été recensé en tant que partage de l'identité de séquence la plus significative (96,2%) avec SARS-CoV-2, indiquant de ce fait l'origine susceptible de SARS-CoV-2 dans "bat".

Un autre coronavirus malais de pangolin (PCoV) recensé dans Guangxi de la Chine (GX) est également étroitement lié à SARS-CoV-2. Le séquençage du génome de ce virus, PCoV_GX, a également indiqué un haut niveau de l'identité partagée de séquence (85,5%) avec SARS-CoV-2.

Au-dessus de toutes les structures du RaTG13 et du PCoV_G 553 X clouez les glycoprotéines. (a) Les structures générales de RaTG13 et de PCoV_GX clouent des glycoprotéines montrées dans la vue de côté (Commission supérieure) et la première vue (Commission inférieure). Trois monomères de la pointe RaTG13 sont magenta, rouges, et bleus colorés, respectivement ; trois monomères de la pointe de PCoV_GX sont des roses indien colorées, vert et bleu-vert, respectivement. Les plans cryo-FIN DE SUPPORT sont montrés comme surface semi-transparente. Les haches trigones sont montrées en tant que lignes tirées noires. Des segments visibles de chaque monomère sont marqués en conséquence. Les pièces de capuchon et de filature sont divisées par les lignes tirées grises. (b) Représentation schématique des domaines structurels de monomère de la pointe RaTG13. Les domaines de RaTG13 sont montrés comme cadres avec la largeur liée à la longueur de la séquence des acides aminés. Les 562 les acides aminés de début et d
Au-dessus de toutes les structures du RaTG13 et du PCoV_G 553 X clouez les glycoprotéines. (a) Les structures générales de RaTG13 et de PCoV_GX clouent des glycoprotéines montrées dans la vue de côté (Commission supérieure) et la première vue (Commission inférieure). Trois monomères de la pointe RaTG13 sont magenta, rouges, et bleus colorés, respectivement ; trois monomères de la pointe de PCoV_GX sont des roses indien colorées, vert et bleu-vert, respectivement. Les plans cryo-FIN DE SUPPORT sont montrés comme surface semi-transparente. Les haches trigones sont montrées en tant que lignes tirées noires. Des segments visibles de chaque monomère sont marqués en conséquence. Les pièces de capuchon et de filature sont divisées par les lignes tirées grises. (b) Représentation schématique des domaines structurels de monomère de la pointe RaTG13. Les domaines de RaTG13 sont montrés comme cadres avec la largeur liée à la longueur de la séquence des acides aminés. Les 562 les acides aminés de début et d'extrémité de chaque segment sont marqués. La position des' sites du clivage S1/S2 et S2 sont indiquées par des ciseaux. NTD, domaine de N-terminal ; CTD, domaine de C-terminal ; SD1, sous-domaine 1 ; SD2, sous-domaine 2 ; UH, helice en amont ; Point de gel, peptide de fusion ; CR, région de raccordement ; HR1, répétition 1 de heptad ; Ch, helice centrale ; Le BH, β-épingle à cheveux ; SD3, représentation schématique du sous-domaine 3. (c) des domaines structurels de monomère de pointe de PCoV_GX. Les abréviations des éléments sont les mêmes que dans des tableaux de bande dessinée de B. (d) dépeignant trois orientations du monomère de pointe coloré comme à B et à C. Car les monomères de la pointe de RaTG13 et de PCoV_GX ont les structures extrêmement assimilées, ainsi seulement le monomère de la pointe RaTG13 a été employé pour montrer l'architecture détaillée.

Le rôle que le trimère de pointe joue par transmission hétérospécifique

Comme structure virale principale permettant à des coronaviruses d'infecter des cellules hôte, le rôle que la protéine de trimère de pointe joue par transmission hétérospécifique et l'infection est d'intérêt principal aux chercheurs.

« Les glycoprotéines de pointe de coronavirus identifient leur récepteur cellulaire d'hôte et fusion médiate de membrane pour l'entrée, fonctionnant de ce fait comme protéine de coronavirus la plus critique en déterminant l'évolution virale et la boîte de vitesses hétérospécifique, » dites Wang et collègues.

Les études cryogéniques de la microscopie électronique (cryo-FIN DE SUPPORT) ont précédemment prouvé qu'assimilé au trimère de pointe de SARS-CoV-1, le trimère de la pointe SARS-CoV-2 doit avoir au moins un RBD dans « vers le haut » de la conformation afin de gripper hACE2.

« Par conséquent, un trimère de pointe avec le down de chacun des trois RBDs est dans une condition inactive récepteur-grippante, et la modification conformationnelle au moins d'un RBD « de vers le bas » à « vers le haut des » contacts le trimère de pointe à une condition active récepteur-grippante, » expliquent les chercheurs.

Que l'étude actuelle a-t-elle concerné ?

Maintenant, Wang et collègues ont déterminé les structures cryo-FIN DE SUPPORT des protéines de pointe à partir des pointes de RaTG13 et de PCoV_GX et de comparé elles à la pointe de SARS-CoV-2.

L'analyse a indiqué que le RBDs des pointes de RaTG13 et de PCoV_GX ressemble attentivement à cela de la pointe SARS-CoV-2.

Chacun des trois RBDs des trimères de RaTG13 et de PCoV_GX de pointe était dans « vers le bas » la conformation, proposant que ces RBDs tendent à adopter la condition inactive récepteur-grippante.

Cependant, sur exécuter la résonance extérieure de plasmon expérimente, les chercheurs ont constaté que la pointe RBD de PCoV_GX a montré une affinité obligatoire assimilée pour hACE2 à celle SARS-CoV-2 de la pointe RBD. En même temps, le RaTG13 RBD a expliqué un grippement bien plus faible hACE2.

Les variations aux résidus de RBD ont représenté la variation

Ensuite, l'équipe a recensé des variations à six résidus dans le RBD qui a semblé représenter ces différences dans hACE2 grippant entre les trois virus.

Les résidus Y449, Q493, Q498, N501, et Y505 étaient particulièrement importants puisqu'ils ont groupé ensemble pour former une correction sur le SARS-CoV-2 RBD qui a fortement agi l'un sur l'autre avec hACE2.

L'acide aminé également indiqué exactement de chercheurs change à deux positions (Y449 et Y505) qui se sont seulement produites dans RaTG13 la pointe RBD et pas la pointe RBD, que de PCoV_GX les chercheurs disent peut représenter le grippement plus faible de hACE2 par RaTG13.

« Nous proposons en outre que la correction contenant les jeux Y449, Q493, Q498, N501, et Y505 un rôle critique dans l'évolution du SARS-CoV-2 RBD, introduisant particulièrement le grippement serré à hACE2 et influençant les affinités variables observées entre les orthologs RBD et ACE2 chez les animaux sauvages et domestiques, » écrivent Wang et collègues.

L'équipe a également recensé trois sites de glycosylation N-joints dans la pointe RBD de RaTG13 et PCoV_GX, l'un d'entre eux (N370) n'est pas un site de glycosylation dans la pointe RBD de SARS-CoV-2.

« L'absence des glycans liés à N370 peut contribuer au RBDs plus flexible de la pointe SARS-CoV-2, » proposez les chercheurs.

Ils disent que cette hypothèse est supportée par une autre apparence d'étude que la mutation de N165 dans SARS-CoV-2 a provoqué une augmentation de « vers le haut » de la conformation de RBDs, proposant que les glycans servent d'élément de contrôle conformationnel du RBD.

Que les auteurs ont-ils conclu ?

« A basé sur tous ces résultats, nous proposons que le grippement RBD-hACE2 serré que nous avons observé soit le facteur le plus critique en déterminant le rendement divers de cellule-entrée parmi RaTG13, PCoV_GX, et SARS-COV-2, » dites les chercheurs.

« Ceci et le down de RBD à « vers le haut » de la modification conformationnelle les deux sont exigés pour l'évolution de SARS-CoV-2 pour gagner la capacité très efficace de boîte de vitesses, » conclut l'équipe.

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Source

Les structures de glycoprotéine de pointe de coronavirus de "bat" et de pangolin de Wang X et autres fournissent des analyses dans l'évolution SARS-CoV-2. bioRxiv, 2020. doi : https://doi.org/10.1101/2020.09.21.307439

Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally first developed an interest in medical communications when she took on the role of Journal Development Editor for BioMed Central (BMC), after having graduated with a degree in biomedical science from Greenwich University.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Robertson, Sally. (2020, September 23). La structure de coronavirus de "bat" et de pangolin jette la lumière sur l'évolution SARS-CoV-2. News-Medical. Retrieved on November 30, 2021 from https://www.news-medical.net/news/20200923/Bat-and-pangolin-coronavirus-structure-sheds-light-on-SARS-CoV-2-evolution.aspx.

  • MLA

    Robertson, Sally. "La structure de coronavirus de "bat" et de pangolin jette la lumière sur l'évolution SARS-CoV-2". News-Medical. 30 November 2021. <https://www.news-medical.net/news/20200923/Bat-and-pangolin-coronavirus-structure-sheds-light-on-SARS-CoV-2-evolution.aspx>.

  • Chicago

    Robertson, Sally. "La structure de coronavirus de "bat" et de pangolin jette la lumière sur l'évolution SARS-CoV-2". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20200923/Bat-and-pangolin-coronavirus-structure-sheds-light-on-SARS-CoV-2-evolution.aspx. (accessed November 30, 2021).

  • Harvard

    Robertson, Sally. 2020. La structure de coronavirus de "bat" et de pangolin jette la lumière sur l'évolution SARS-CoV-2. News-Medical, viewed 30 November 2021, https://www.news-medical.net/news/20200923/Bat-and-pangolin-coronavirus-structure-sheds-light-on-SARS-CoV-2-evolution.aspx.