Advertencia: Esta página es una traducción de esta página originalmente en inglés. Tenga en cuenta ya que las traducciones son generadas por máquinas, no que todos traducción será perfecto. Este sitio Web y sus páginas están destinadas a leerse en inglés. Cualquier traducción de este sitio Web y su páginas Web puede ser imprecisa e inexacta en su totalidad o en parte. Esta traducción se proporciona como una conveniencia.

Mutación de D614G ahora la variante dominante en el pandémico global COVID-19

Los estudios múltiples muestran el acontecimiento de las diversas mutaciones que definen diversos clades del coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática. Es esencial vigilar sobre las mutaciones nuevamente emergentes y la aptitud física de las nuevas deformaciones para mantener una reacción efectiva al pandémico. Ahora, un nuevo estudio de los investigadores en la universidad de Hong Kong y publicada en el medRxiv* del servidor de la prueba preliminar muestra en septiembre de 2020 que una variante importante caracterizada por la mutación de D614G tiene contagiosidad más alta, que puede explicar su subida rápida a la posición dominante en todas las regiones donde ha emergido.

La mutación de D614G es una donde el residuo del ácido aspártico en la posición 614 es reemplazado por la glicocola. Esto está en el final carboxitrminal del dominio S1 de la proteína del pico SARS-CoV-2. Este mutante ocupa una proporción cada vez mayor de variantes descubiertas desde finales de febrero de 2020, que le ha hecho la variante lo más común posible actualmente determinada de muchas partes del mundo. Esto ha llevado muchos investigadores a presumir que es capaz de una extensión más rápida o más fácil comparada al virus D614 del wildtype, quizás debido a un incremento más rápido o a una réplica viral más rápida, o un número más importante de la reproducción.

Filogenia global de SARS-CoV-2. El árbol de la toda probabilidad fue deducido de la alineación de 26.244 series mundiales del genoma SARS-CoV-2 con alto abrigo de secuencia, usando modelo de la substitución de GTR+CAT en el programa de FastTree. Se destacan los clades múltiples, y sus mutaciones asociadas se indican dentro de paréntesis. Los extremos del árbol correspondiente a las series virales de diversos continentes se anotan en diversos colores tal y como se muestra en de la caja de la leyenda del color.
Filogenia global de SARS-CoV-2. El árbol de la toda probabilidad fue deducido de la alineación de 26.244 series mundiales del genoma SARS-CoV-2 con alto abrigo de secuencia, usando modelo de la substitución de GTR+CAT en el programa de FastTree. Se destacan los clades múltiples, y sus mutaciones asociadas se indican dentro de paréntesis. Los extremos del árbol correspondiente a las series virales de diversos continentes se anotan en diversos colores tal y como se muestra en de la caja de la leyenda del color.

Muchos estudios in vitro confirman la contagiosidad creciente de este modelo. Los análisis filogenéticos también muestran un fenómeno llamado diversificación de la selección en la posición 614, sugiriendo otra vez que D614G es más infeccioso. El estudio actual apunta fijar su aptitud física epidemiológica de esta variante en términos cuantitativos, usando los datos detectados de la vigilancia COVID-19 y del ARN que ordenan datos para conseguir una idea de cómo es infeccioso está en relación a otras deformaciones.

D614 y G614 en la Co-Circulación

El trazado filogenético global del lazo muestra que la mutación G614 está encontrada en el clade con el número más grande de deformaciones. Los investigadores hicieron una suposición crucial que ésta es la única mutación en este clade que se asocie a regímenes de transmisión virales más altos.

Sobre esta base, analizaban sobre 35.000 series virales a partir del período entre el 24 de diciembre de 2019 y el 8 de junio de 2020, que incluyeron la posición del interés en el gen de la codificación del pico. Determinaron los atados filogenéticos de la transmisión local sobre una base país-sabia usando las configuraciones de secuencia virales globales.

Definieron los atados que comenzaron con una o una pequeña cantidad de introducciones virales, con por lo menos dos series ajustando las consideraciones del estudio. En algunos países, ambas las variantes circulaban juntas en los atados locales por dos semanas o más. Esto incluiría por lo menos dos generaciones del virus si la época de generación se lleva de ser 5-7 días por término medio.

Todos los diez países incluidos en este análisis tenían cientos series de circulación por lo menos durante este período en que dos o más deformaciones consistían en la circulación al mismo tiempo en un atado. Este análisis, por lo tanto, incluyó ~500 atados D614 y ~1.400 atados G614 entre ~11.000 series.

Los investigadores encontraron que la índice de la deformación G614 a la deformación D614 aumentó en un cierto plazo para convertirse en la deformación dominante en cada país.

Aptitud física de la transmisión G614

Los investigadores también compararon el número básico de la reproducción y la época de generación media de ambas deformaciones. Dado la suposición que la deformación D614 tiene un rato de generación medio de ~5 días, los investigadores calculaban que la deformación G614 tiene tiempos del número un 31% de la reproducción más arriba que la deformación D614.

El presupuesto arriba se basa en el número de casos confirmados, pero si las muertes se utilizan en lugar de otro, el resultado sería un número el 23% más alto de la reproducción.

El tiempo de generación medio básico es similar para ambas deformaciones, sin embargo, en términos de casos confirmados y muertes confirmadas. Esto ajusta la hipótesis perfectamente y está de acuerdo con las observaciones recolectadas referentes a la proporción de los aislantes G614 sobre todos los países en el estudio.

Los investigadores también observaban diferencias en número de la reproducción por situaciones geográficas. Encontraron que los presupuestos eran 1,13 para los E.E.U.U., 1,53 para el Reino Unido, y 1,30 para otras situaciones.

Entonces ajustaron su análisis para ignorar las series importadas que no causaron infecciones secundarias importantes. El árbol filogenético global muestra que es posible que un gran número de cajas importadas G614 durante el período del estudio llegaron de los países adonde el brote había ido sobre todo desapercibido, pero ésta era la deformación dominante.

Así, los investigadores después integraron las cajas importadas G614 en su análisis de la aptitud física en la suposición que todas las importaciones consistieron solamente en G614. Entonces estimaban la fuerza importada de la infección G614 en términos de su índice a la incidencia local de COVID-19 - que estaba abajo de 0,0012 en el Reino Unido.

La significación de esto es su sugerencia que el aumento en proporción a G614 no era debido a las cajas importadas en el Reino Unido. Si es así el presupuesto total de 0,0172 para los diez países indica que el aumento en gran número y la talla de los atados G614 eran debido a la réplica y a la extensión más eficientes de esta deformación D614 en relación con. Esto estaba así que incluso después ajustar según talla del atado o la definición exacta usada para trazar filogenia.

Cómo la aptitud física G614 afecta a la transmisión SARS-CoV-2

Las apreciaciones antedichas indican que el umbral para la inmunidad de la manada sería más alto para G614 D614 en relación con, puesto que, en la índice básica del número de la reproducción de 1,31 levantaría a partir la 50% al 62% para un R0 de 2, y a partir la 67% al 75% para el R0 de 3. Si se explican la movilidad, la susceptibilidad, y la contagiosidad, ésta dará lugar a un presupuesto más exacto del umbral de la inmunidad de la manada.

En fin, la contagiosidad creciente de la deformación G614 es solamente responsable de su régimen de transmisión más alto.

Estudios anteriores muestran que la deformación G614 entró en países europeos anterior en relación con Australia o los E.E.U.U., y compusieron a partir la ~20% al 75% de todas las infecciones a principios de marzo. Una vez más Nueva York tenía una importación anterior de esta deformación comparada al estado de Washington. Si se asume que el mismo tiempo de generación, esto indica que el número básico de la reproducción era el 25% más arriba para el estado de Washington. Sin embargo, la falta de co-circulación no permitió la apreciación de la aptitud física G614 para el Estado de Nueva York.

El estudio sugiere así que la deformación G614 tenga un régimen de transmisión alrededor de un tercer más alto que la deformación D614, que ha impulsado su dominación en cada país que ha alcanzado hasta ahora. De hecho, se convirtió en la deformación predominante SARS-CoV-2 en Europa en el plazo de dos meses de su introducción.

La tasa de crecimiento de G614 es el 21% más rápido que el de D614, y ésta también iguala el índice de resurgimiento del virus de G614-dominant en Pekín en relación con la extensión del virus original de D614-dominated en la primera onda, en 325 comparado con 156 cajas locales para la segunda onda comparada a la primera onda, dentro del mismo número de días, y a pesar de la contención apretada mide el prevalecer en la ciudad.

Sin embargo, hay una posibilidad que un número más importante de casos suaves fue escogido encima la segunda vez alrededor debido a del índice más alto de comunidad que probaba a partir de junio adelante. No hay pruebas de una virulencia más alta, sin embargo, y de hecho, los análisis crudos muestran un porcentaje más alto de casos asintomáticos, suaves, o moderados en la segunda onda.

Implicaciones

El número más alto de la contagiosidad y de la reproducción significa que las dimensiones preventivas contra la deformación D614 serán los solamente 70% como eficientes contra la deformación G614. Esto significa que el abrigo vaccíneo y el umbral de la inmunidad de la manada subirán importante con la deformación G614.

Por supuesto, podría ser que el R0 seguía siendo lo mismo, pero la deformación G614 tiene un rato que duplica más corto por el cerca de 20%, requiriendo un trazado y un mando más rápidos del contacto del 20% prevenir los brotes futuros. Esto no cambiará el abrigo vaccíneo requerido para parar el pandémico, sin embargo, debido al R0 sin cambios.

Más investigación será requerida entender cómo otras mutaciones en deformaciones con la mutación de D614G afectan a tiempo de la transmisibilidad y de generación. Los presupuestos de la aptitud física se aplican solamente con la co-circulación de ambas estas deformaciones y no si está emergiendo solamente una nueva deformación o es ya la deformación dominante, ni si tres o más deformaciones están circulando simultáneamente.

Los científicos concluyen, “la mutación G614 consultan una ventaja de la transmisión sobre el wildtype D614. Nuestro método puede ser fácilmente integrado en el sistema de vigilancia actual COVID-19, ofrecer la evaluación epidemiológica eficiente del potencial de la transmisión de los mutantes emergentes para la alarma temprana.”

Advertencia *Important

el medRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

Fuente

Journal reference:
Dr. Liji Thomas

Written by

Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Thomas, Liji. (2020, September 25). Mutación de D614G ahora la variante dominante en el pandémico global COVID-19. News-Medical. Retrieved on November 28, 2020 from https://www.news-medical.net/news/20200925/D614G-mutation-now-the-dominant-variant-in-the-global-COVID-19-pandemic.aspx.

  • MLA

    Thomas, Liji. "Mutación de D614G ahora la variante dominante en el pandémico global COVID-19". News-Medical. 28 November 2020. <https://www.news-medical.net/news/20200925/D614G-mutation-now-the-dominant-variant-in-the-global-COVID-19-pandemic.aspx>.

  • Chicago

    Thomas, Liji. "Mutación de D614G ahora la variante dominante en el pandémico global COVID-19". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20200925/D614G-mutation-now-the-dominant-variant-in-the-global-COVID-19-pandemic.aspx. (accessed November 28, 2020).

  • Harvard

    Thomas, Liji. 2020. Mutación de D614G ahora la variante dominante en el pandémico global COVID-19. News-Medical, viewed 28 November 2020, https://www.news-medical.net/news/20200925/D614G-mutation-now-the-dominant-variant-in-the-global-COVID-19-pandemic.aspx.