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Marrowquant peut mesurer les composantes multiples d'os dans des images histologiques

La moelle osseuse est le tissu mou à l'intérieur de nos os. Son rôle principal est de produire les cellules souche qui continueront pour devenir les cellules variées du sang, y compris les globules blancs qui combattent les infections, les hématies qui transportent l'oxygène dans tout le fuselage, et les plaquettes qui règlent la purge.

Mais la moelle osseuse contient également des cellules graisseuses, les adipocytes, lesquels ont été considérés pendant longtemps en tant que « remplissages passifs » de la cavité de moelle /courgette. Ces dernières années, cependant, des adipocytes de moelle osseuse ont été montrés pour jouer bien plus de rôle majeur dans le micro-environnement de la moelle osseuse qu'ont au commencement pensé.

Le rapport aux cellules de sang-formation (couleur rouge) des adipocytes (couleur jaune) n'est pas continuel. Il change avec l'âge, entre différentes pièces du squelette, et dans conditions variées ou traitements contre le cancer de la maladie comme le chimio et la radiothérapie, qui entraînent à une condition la « aplasie médullaire » appelée. Les changements du rapport des cellules produisent de soi-disant variations « jaune-à-rouges » et « rouge-à-jaunes » dans la couleur de la moelle osseuse, qui est employée pour surveiller son état.

Cette surveillance cependant n'est pas entièrement normalisée, mais compte sur des évaluations par des pathologistes des images histologiques. Dans la recherche, la santé relative des échantillons de moelle osseuse est également évaluée qualitativement, par des images histologiques. Cette subjectivité, bien que grand compensé, peut encore entraîner des limitations de diagnose et de recherches.

Publiant en endocrinologie de frontières, les scientifiques aboutis par Olaia Naveiras à EPFL, introduisent MarrowQuant, un logiciel digital neuf de pathologie qui peut des images histologiques « affichées » de moelle osseuse et « les décrire » quantitativement, établissant des plans basés sur des valeurs pour compléter les images. Les applications possibles de cette approche peuvent révolutionner l'histologie digitale.

Son indicatif déjà téléchargé sur GitHub, MarrowQuant est décrit comme « algorithme convivial pour la quantification des biopsies de tissu de moelle osseuse de H&E dans des images de guide entières. »

Dans le papier, les chercheurs emploient MarrowQuant pour établir le plan quantitatif tout premier de l'hétérogénéité de la moelle osseuse dans tout le squelette des souris souffrant de l'aplasie âge-induite et induite par la radiation.

Le travail était grâce possible massive d'un effort seulement à la longue et fructueuse collaboration avec BioImaging d'EPFL et plate-forme de bloc optique [BIOP]. »

Naveiras, président, société internationale d'adiposité de moelle osseuse (BMAS)

MarrowQuant, utilisations le logiciel open source QuPath, et peut systématiquement mesurer les composantes multiples d'os dans des images histologiques sans prévention. Il fait ceci en discernant et en mesurant les endroits occupés par les parties variées de la moelle osseuse - comprenant le réseau vasculaire et l'os lui-même.

Une des utilisations potentielles de MarrowQuant sera de réexaminer les collections historiques témoin d'échantillons et même de caractéristiques d'os provenant de vieux tests cliniques.

« MarrowQuant a déjà été extrêmement bien reçu par la communauté digitale de pathologie, » dit Naveiras. « D'ailleurs, le moyen très sélecteur de base de données images (IDR) a sélecté l'ensemble de données associé pour la publication, qui comprend plus de 300 images annotées. »

Source:
Journal reference:

Tratwal J, et al. (2020) MarrowQuant in Aging and Aplasia: A Digital Pathology Workflow for Quantification of Bone Marrow Compartments in Histological Sections. Frontiers Endocrinology. doi.org/10.3389/fendo.2020.00480.