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Une étude contredisant la relation phénotypique entre les plasmablasts et développant les neutrophiles

Une équipe des scientifiques d'Australie conteste les découvertes d'une étude récente par Wilk et autres expliquant ce transdifferentiate de plasmablasts dans les neutrophiles se développantes dans la maladie sévère 2019 (COVID-19) de coronavirus. L'étude australienne est actuellement disponible sur le serveur de prétirage de bioRxiv*.    

Dans l'étude par des chercheurs à l'institut de Garvan de la recherche médicale et du centre de Garvan-Weizmann pour la génomique cellulaire, la condition transcriptionnelle des cellules mononucléaires périphériques de sang d'isolement à partir des patients COVID-19 hospitalisés a été déterminée. Leurs découvertes ont indiqué que les neutrophiles se développantes sont phénotypique assimilées aux plasmablasts, et que développant le transdifferentiate de neutrophiles des plasmablasts en réponse au syndrome de détresse respiratoire aigu sévère de COVID-19-related.  

L
L'analyse des caractéristiques scRNA-seq des neutrophiles se développantes d'exposition de Wilk et autres ne font pas transdifferentiate des plasmablasts. a. Reconstruction de l'UMAP encastrant du chiffre 1c de Wilk et autres B. UMAP encastrant montrant l'effet de la régression à l'extérieur gènes mitochondriaux. c. UMAP encastrant montrant l'effet de la régression à l'extérieur gènes mitochondriaux et gènes ribosomiques. encastrer de D. UMAP des neutrophiles, des neutrophiles se développantes, des cellules de B et des cellules de plasma.

Les cellules de plasma de prolifération qui sont dérivées des cellules de B lymphoïdes de lignée sont les plasmablasts appelés. En revanche, des neutrophiles sont dérivées des cellules myéloïdes de lignée et sont activement impliquées dans la phagocytose des agents pathogènes de envahissement. À cause de la variation des lignées de cellules, la retouche considérable est exigée au génétique et aux niveaux moléculaires pour convertir des plasmablasts en neutrophiles se développantes. Bien que les études aient prouvé que des ancêtres de cellules de B et les cellules de B de naïve peuvent transdifferentiated dans des macrophages en exprimant exogènement des facteurs spécifiques de transcription, une preuve complètement recherchée est exigée de déterminer le transdifferentiation spontané des cellules de plasma qui sont terminalement différenciées.

Dans l'étude actuelle, les scientifiques ont réanalysé les caractéristiques de ARN-ordonnancement unicellulaires produites par Wilk et autres l'ARN-ordonnancement qu'unicellulaire est employé pour évaluer la condition transcriptionnelle d'une grande variété de cellules, et la proximité de deux types différents de cellules représente des similitudes transcriptionnelles de ces cellules. Pour une analyse précise des caractéristiques, il est indispensable d'enlever le bruit technique sans nuire la variabilité biologique.

Tout en analysant les caractéristiques de Wilk, les scientifiques ont observé que les auteurs ont régressé à l'extérieur un certain nombre de seul moléculaire recense (UMIs) et des gènes exprimés de leurs caractéristiques d'expression du gène, en plus de la régression à l'extérieur ARN ribosomique et gènes et gènes mitochondriaux. Cependant, la régression à l'extérieur UMIs n'est pas recommandée, car elle peut mener aux caractéristiques overfitting.

Pour réexaminer complètement le scénario entier, les scientifiques actuels d'étude ont analysé les caractéristiques de Wilk en régressant séparé à l'extérieur les gènes mitochondriaux, régressant à l'extérieur les gènes mitochondriaux et ribosomiques, ou sans régresser à l'extérieur tous les covariates. Les scientifiques ont observé que la relation entre les plasmablasts et les neutrophiles se développantes n'existe plus quand le bruit technique est enlevé convenablement sans covariates déplaçants.        

En outre, les caractéristiques de Wilk ont prouvé que les deux neutrophiles et plasmablasts se développants occupent un espace divers assimilé, dans lequel des plasmablasts semblent être lointainement associés aux cellules de B. D'ailleurs, l'analyse exécutée par Wilk effectue et autres une hypothèse théorique qu'il y a une relation de développement entre toute la cellule tape étudié et qu'un arbre de lignée de cellules les branche. Cependant, une telle hypothèse peut être effectuée seulement en analysant les cellules différenciées avec un ancêtre courant in vitro. Une telle hypothèse ne s'applique pas aux cellules mononucléaires périphériques car elles contiennent plusieurs types de cellules dérivées de différents types de cellules d'ancêtre.

Dans l'étude actuelle, les scientifiques encore des similitudes possibles explorées entre les cellules de B, les plasmablasts, les neutrophiles, et les neutrophiles se développantes. Étonnant, ils ont observé que des neutrophiles et les cellules de B ne sont pas liées aux neutrophiles et aux plasmablasts se développants, respectivement. Ceci indique que des plasmablasts et les neutrophiles se développantes sont activés en réponse à COVID-19 sévère et partagent probablement l'expression d'un certain nombre de gènes, qui ont pu avoir trompé Wilk et autres pour les classifier en tant que types relatifs de cellules. Une expression si partagée des gènes peut être des résultats de l'overactivation de SARS-CoV-2-induced du système immunitaire.

À cause de la haute densité, des neutrophiles ne peuvent pas être généralement captées dans la préparation de sang employée pour isoler les cellules mononucléaires périphériques de sang. Selon les scientifiques actuels d'étude, il est susceptible que les neutrophiles se développantes soient assimilées aux neutrophiles proinflammatory à basse densité, qui contiennent les neutrophiles immatures hyposegmented. Par conséquent, il est plus susceptible que des neutrophiles se développantes soient dérivées des précurseurs myéloïdes de moelle osseuse en réponse à l'infection SARS-CoV-2 sévère.

Avis *Important

le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal references:
Dr. Sanchari Sinha Dutta

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Dr. Sanchari Sinha Dutta

Dr. Sanchari Sinha Dutta is a science communicator who believes in spreading the power of science in every corner of the world. She has a Bachelor of Science (B.Sc.) degree and a Master's of Science (M.Sc.) in biology and human physiology. Following her Master's degree, Sanchari went on to study a Ph.D. in human physiology. She has authored more than 10 original research articles, all of which have been published in world renowned international journals.

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