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Um estudo que contradiz o relacionamento fenotípico entre plasmablasts e que desenvolve neutrófilo

Uma equipe dos cientistas de Austrália desafia os resultados de um estudo recente por Wilk e outros que demonstra esse transdifferentiate dos plasmablasts em neutrófilo tornando-se na doença severa 2019 do coronavirus (COVID-19). O estudo australiano está actualmente disponível no server da pré-impressão do bioRxiv*.    

No estudo por pesquisadores no instituto de Garvan da investigação médica e do centro de Garvan-Weizmann para a genómica celular, o estado transcricional de pilhas mononuclear do sangue periférico isoladas dos pacientes COVID-19 hospitalizados foi determinado. Seus resultados revelaram que os neutrófilo se tornando são fenotìpica similares aos plasmablasts, e que desenvolvendo o transdifferentiate dos neutrófilo dos plasmablasts em resposta à síndrome de aflição respiratória aguda severa de COVID-19-related.  

a Re-análise de dados scRNA-segs.s dos neutrófilo tornando-se da mostra de Wilk e outros não faz transdifferentiate dos plasmablasts. a. Reconstrução do UMAP que encaixa da figura 1c de Wilk e outros B. UMAP que encaixa mostrando o efeito de retroceder para fora genes mitocondriais. c. UMAP que encaixa mostrando o efeito de retroceder para fora genes mitocondriais e genes ribosomal. encaixotamento do D. UMAP dos neutrófilo, de neutrófilo tornando-se, de pilhas de B e de pilhas de plasma.
a Re-análise de dados scRNA-segs.s dos neutrófilo tornando-se da mostra de Wilk e outros não faz transdifferentiate dos plasmablasts. a. Reconstrução do UMAP que encaixa da figura 1c de Wilk e outros B. UMAP que encaixa mostrando o efeito de retroceder para fora genes mitocondriais. c. UMAP que encaixa mostrando o efeito de retroceder para fora genes mitocondriais e genes ribosomal. encaixotamento do D. UMAP dos neutrófilo, de neutrófilo tornando-se, de pilhas de B e de pilhas de plasma.

Proliferando as pilhas de plasma que são derivadas das pilhas de B lymphoid da linhagem são chamados plasmablasts. Ao contrário, os neutrófilo são derivados das pilhas mielóides da linhagem e envolvidos activamente na fagocitose dos micróbios patogénicos de invasão. Devido à variação em linhagens da pilha, a remodelação extensiva é exigida a níveis genéticos e moleculars para converter plasmablasts em neutrófilo tornando-se. Embora os estudos mostrem que os ancestral da pilha de B e as pilhas de B do naïve podem ser transdifferentiated em macrófagos exògena expressando factores específicos da transcrição, uma evidência completamente pesquisada é exigida estabelecer o transdifferentiation espontâneo das pilhas de plasma que são diferenciadas terminal.

No estudo actual, os cientistas reanalyzed os dados RNA-arranjando em seqüência da único-pilha gerados RNA-arranjar em seqüência da Único-pilha de Wilk são usados e outros para avaliar o estado transcricional de uma grande variedade de pilhas, e a proximidade de dois tipos diferentes da pilha representa similaridades transcricionais destas pilhas. Para uma análise exacta dos dados, é vital remover o ruído técnico sem interferir com a variabilidade biológica.

Ao analisar os dados de Wilk, os cientistas observaram que os autores retrocederam para fora um número de molecular original identificam (UMIs) e expressaram genes de seus dados da expressão genética, além do que retroceder para fora o RNA e genes ribosomal e genes mitocondriais. Contudo, retroceder para fora UMIs não é recomendado, porque pode conduzir aos dados que overfitting.

Para reexaminar completamente a encenação inteira, os cientistas actuais do estudo analisaram os dados de Wilk separada retrocedendo para fora genes mitocondriais, retrocedendo para fora genes mitocondriais e ribosomal, ou sem retroceder para fora nenhuns covariates. Os cientistas observaram que o relacionamento entre plasmablasts e neutrófilo se tornando já não existe quando o ruído técnico é removido apropriadamente sem os covariates de alteração.        

Além disso, os dados de Wilk mostraram que ambos os neutrófilo e plasmablasts se tornando ocupam um espaço múltiplo similar, em que os plasmablasts parecem ser associados distante com as pilhas de B. Além disso, a análise executada por Wilk faz e outros uma hipótese teórica que há um relacionamento desenvolvente entre toda a pilha dactilografa estudado e que uma árvore da linhagem da pilha os conecta. Contudo, tal hipótese pode ser feita somente ao analisar pilhas diferenciadas com um antepassado comum in vitro. Tal hipótese não é aplicável às pilhas mononuclear do sangue periférico porque contêm diversos tipos de pilhas derivadas dos tipos diferentes de pilhas do ancestral.

No estudo actual, os cientistas promovem similaridades possíveis exploradas entre pilhas de B, plasmablasts, neutrófilo, e neutrófilo tornando-se. Surpreendentemente, observaram que os neutrófilo e as pilhas de B não estão relacionados aos neutrófilo e aos plasmablasts se tornando, respectivamente. Isto indica que os plasmablasts e os neutrófilo se tornando estão activados em resposta a COVID-19 severo e compartilham possivelmente da expressão de um número de genes, que podem ter enganado em Wilk e outros para os classificar como tipos relacionados da pilha. Uma expressão tão compartilhada dos genes pode ser um resultado do overactivation de SARS-CoV-2-induced do sistema imunitário.

Devido ao alto densidade, os neutrófilo não podem geralmente ser capturados na preparação do sangue usada para isolar pilhas mononuclear do sangue periférico. De acordo com os cientistas actuais do estudo, é provável que os neutrófilo se tornando são similares aos neutrófilo proinflammatory de baixa densidade, que contêm neutrófilo imaturos hyposegmented. Conseqüentemente, é mais provável que os neutrófilo se tornando estão derivados dos precursores mielóides da medula em resposta à infecção SARS-CoV-2 severa.

Observação *Important

o bioRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Journal references:
Dr. Sanchari Sinha Dutta

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Dr. Sanchari Sinha Dutta

Dr. Sanchari Sinha Dutta is a science communicator who believes in spreading the power of science in every corner of the world. She has a Bachelor of Science (B.Sc.) degree and a Master's of Science (M.Sc.) in biology and human physiology. Following her Master's degree, Sanchari went on to study a Ph.D. in human physiology. She has authored more than 10 original research articles, all of which have been published in world renowned international journals.

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