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Un estudio que contradice el lazo fenotípico entre los plasmablasts y que desarrolla los neutrófilos

Las personas de científicos de Australia desafían las conclusión de un estudio reciente por Wilk y otros que demuestra ese transdifferentiate de los plasmablasts en neutrófilos que se convierten en la enfermedad severa 2019 (COVID-19) del coronavirus. El estudio australiano está actualmente disponible en el servidor de la prueba preliminar del bioRxiv*.    

En el estudio de los investigadores en el instituto de Garvan de la investigación médica y del centro de Garvan-Weizmann para la genómica celular, el estado transcriptivo de las células mononucleares de la sangre periférica aisladas de los pacientes hospitalizados COVID-19 se ha determinado. Sus conclusión han revelado que los neutrófilos que se convierten son fenotípicamente similares a los plasmablasts, y que desarrollando el transdifferentiate de los neutrófilos de plasmablasts en respuesta a síndrome de señal de socorro respiratoria agudo severo de COVID-19-related.  

El nuevo análisis de datos scRNA-seq de neutrófilos que se convierten de la demostración de Wilk y otros no hace transdifferentiate de plasmablasts. a. Reconstrucción del UMAP que embute de la figura 1c de Wilk y otros B. UMAP que embute mostrando el efecto de la regresión fuera genes mitocondriales. c. UMAP que embute mostrando el efecto de la regresión fuera genes mitocondriales y genes ribosomal. el embutir de la D. UMAP de neutrófilos, de neutrófilos que se convierten, de células de B y de células de plasma.
El nuevo análisis de datos scRNA-seq de neutrófilos que se convierten de la demostración de Wilk y otros no hace transdifferentiate de plasmablasts. a. Reconstrucción del UMAP que embute de la figura 1c de Wilk y otros B. UMAP que embute mostrando el efecto de la regresión fuera genes mitocondriales. c. UMAP que embute mostrando el efecto de la regresión fuera genes mitocondriales y genes ribosomal. el embutir de la D. UMAP de neutrófilos, de neutrófilos que se convierten, de células de B y de células de plasma.

Las células de plasma de la proliferación que se derivan de las células de B linfoides del linaje se llaman los plasmablasts. En cambio, los neutrófilos se derivan de las células mieloides del linaje y están implicados activamente en la fagocitosis de patógeno invasores. Debido a la variación en linajes de la célula, el remodelado extenso se requiere en los niveles genéticos y moleculares para convertir plasmablasts en neutrófilos que se convierten. Aunque los estudios hayan mostrado que los progenitores del linfocito B y las células de B del naïve pueden transdifferentiated en macrófagos exógeno expresando factores específicos de la transcripción, las pruebas a conciencia investigadas se requieren establecer el transdifferentiation espontáneo de las células de plasma que terminal se distinguen.

En el estudio actual, los científicos reanalizaron los datos de ARN-secuencia unicelulares generados por Wilk y otros que la ARN-secuencia unicelular se utiliza para fijar el estado transcriptivo de una amplia variedad de células, y la proximidad de dos diversos tipos de la célula representa semejanzas transcriptivas de estas células. Para un análisis exacto de los datos, es vital quitar ruido técnico sin la interferencia con la variabilidad biológica.

Mientras que analizaban los datos de Wilk, los científicos observaron que han regresado los autores fuera vario molecular único determinan (UMIs) y expresaron genes de sus datos de la expresión génica, además de la regresión fuera ARN y los genes ribosomal y los genes mitocondriales. Sin embargo, la regresión fuera UMIs no se recomienda, pues puede llevar a los datos overfitting.

Para reexaminar a conciencia el decorado entero, los científicos actuales del estudio analizaban los datos de Wilk por separado regresando fuera los genes mitocondriales, regresando fuera los genes mitocondriales y ribosomal, o sin la regresión fuera cualquier covariates. Los científicos observaron que existe el lazo entre los plasmablasts y los neutrófilos que se convierten no más cuando el ruido técnico se quita apropiadamente sin covariates que tratan de forzar.        

Además, los datos de Wilk han mostrado que ambos neutrófilos y plasmablasts que se convierten ocupan un espacio multíple similar, en el cual los plasmablasts parecen ser asociados distante a las células de B. Por otra parte, el análisis realizado por Wilk y otros hace una hipótesis teórica que hay un lazo de desarrollo entre toda la célula pulsa estudiado y que un árbol del linaje de la célula los conecta. Sin embargo, tal hipótesis puede ser hecha solamente al analizar las células distinguidas con un antepasado común in vitro. Tal hipótesis no es aplicable a las células mononucleares de la sangre periférica pues contienen varios tipos de células derivadas de diversos tipos de células del progenitor.

En el estudio actual, los científicos fomentan semejanzas posibles exploradas entre las células de B, los plasmablasts, los neutrófilos, y los neutrófilos que se convierten. Asombrosamente, observaron que los neutrófilos y las células de B no están relacionados con los neutrófilos y los plasmablasts que se convierten, respectivamente. Esto indica que los plasmablasts y los neutrófilos que se convierten están activados en respuesta a COVID-19 severo y comparten posiblemente la expresión de varios genes, que pudieron haber engañado Wilk y otros para clasificarlos como tipos relacionados de la célula. Una expresión tan compartida de genes puede ser un resultado del overactivation de SARS-CoV-2-induced del sistema inmune.

Debido a la alta densidad, los neutrófilos no pueden ser capturados generalmente en la preparación de la sangre usada para aislar las células mononucleares de la sangre periférica. Según los científicos actuales del estudio, es probable que los neutrófilos que se convierten sean similares a los neutrófilos proinflammatory de baja densidad, que contienen neutrófilos no maduros hyposegmented. Por lo tanto, es más probable que los neutrófilos que se convierten estén derivados de precursores mieloides de la médula en respuesta a la infección severa SARS-CoV-2.

Advertencia *Important

el bioRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

Journal references:
Dr. Sanchari Sinha Dutta

Written by

Dr. Sanchari Sinha Dutta

Dr. Sanchari Sinha Dutta is a science communicator who believes in spreading the power of science in every corner of the world. She has a Bachelor of Science (B.Sc.) degree and a Master's of Science (M.Sc.) in biology and human physiology. Following her Master's degree, Sanchari went on to study a Ph.D. in human physiology. She has authored more than 10 original research articles, all of which have been published in world renowned international journals.

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