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Les chercheurs découvrent la cause de l'épidémie de choléra de l'Argentine des années 1990

L'évolution des tensions épidémiques et endémiques des cholerae choléra-entraînants de vibrio de bactérie en Argentine a été tracée en détail par des chercheurs à l'institut de Wellcome Sanger, à l'école de Londres de l'hygiène et du médicament tropical, à l'université de Cambridge et à l'INEI-ANLIS « M. Carlos G. Malbrán », l'Argentine. Les équipes avaient l'habitude le séquençage du génome entier pour étudier les bactéries diffusant pendant la manifestation 1991-1998 de choléra dans le pays.

Les caractéristiques ont influencé la politique sanitaire en Argentine, où le système de surveillance vigilant national emploie maintenant l'entier-génome ordonnançant pour distinguer les lignées universelles et non-universelles des bactéries de cholerae de V. L'étude est publiée dans des transmissions de nature aujourd'hui (1er octobre).

Le choléra, provoqué par des tensions des bactéries de cholerae de V., affecte actuel 47 pays dans le monde entier et prétend les durées de presque 100.000 personnes par année. Depuis les 1800s, il y a eu sept pandémies de choléra dans le monde entier, entraînant des millions des morts. La pandémie actuelle, qui a commencé pendant les années 1960, est provoquée par une lignée unique des cholerae de V., 7PET appelé. Tandis que les sud et l'Amérique latine centrale ont en grande partie récupéré des manifestations qui ont commencé en le Haïti en 2010, la lignée continue à diffuser le globe et est la cause de la plus grande épidémie du choléra du monde, en cours au Yémen, où les centaines de milliers ont été infectées.

Dans une étude neuve, l'équipe a ordonnancé les génomes d'un seul ensemble d'échantillons historiques de cholerae de V., retenu à INEI-ANLIS « M. Carlos G. Malbrán », le laboratoire de référence national de l'Argentine. En réanalysant le passé, l'espoir international d'équipe de recherche de comprendre mieux les futures configurations de la maladie, et d'activer des alertes rapides pour les introductions neuves des lignées universelles.

Utilisant l'analyse phylogénétique, elles ont confirmé que la manifestation 1992 de choléra en Argentine a été provoquée par une introduction des bactéries de cholerae de 7PET V., initialement introduite en le Pérou. Les bactéries alors ont évolué très peu pendant les six années de l'épidémie. Ce contrastait avec les diverses, multiples tensions endémiques des cholerae de V. diffusant en même temps. Les anciens travaux à côté de l'équipe ont prouvé que tandis que les tensions endémiques peuvent effectuer la défectuosité de gens, elles semblent manquer du potentiel d'écarter rapidement et d'entraîner une épidémie.

Quand une tension 7PET universelle entre en l'Amérique latine d'ailleurs, elle peut entraîner des épidémies massives, comme ceux vus au Pérou pendant les années 1990 et le Haïti en 2010. Si nous devons régler des épidémies de choléra efficacement, il est indispensable que nous puissions discerner et comprendre les différences entre les cholerae locaux et endémiques de V. qui coexistent à côté de 7PET pendant une épidémie de choléra. Notre étude a élaboré l'histoire évolutionnaire génomique de ces deux types ensemble dans un pays unique, pendant une décennie où il y avait des manifestations importantes de choléra dans cette région. »

Matthew Dorman, premier auteur sur l'étude de l'institut de Wellcome Sanger

Les découvertes ont été employées par les autorités de la santé publiques en Argentine, où le système d'alerte national a été maintenant changé pour distinguer la lignée 7PET universelle et les lignées locales de cholerae de V. utilisant l'ordonnancement d'entier-génome.

Grâce à un contrôle et à un système de compte rendu complets, le laboratoire de référence en Argentine contient un instantané d'une épidémie entière. Ceci nous a donné une opportunité unique de comprendre l'évolution détaillée des bactéries de cholerae de V. dans notre pays. Nous pourrons employer ces caractéristiques et cette expérience pour aviser comment nous surveillons et répondons à toutes les futures manifestations de choléra - les bactéries qui entraînent à pose d'épidémies un risque très différent à ceux qui ne font pas ; c'est l'information simple qui est critique pour la lutte contre la maladie. Nous sommes le premier système de compte rendu national dans le monde pour employer des caractéristiques génomiques pour surveiller le choléra comme ceci. »

M. Josefina Campos, auteur supérieur d'INEI-ANLIS « M. Carlos G. Malbrán », Buenos Aires, Argentine

Professeur Nick Thomson, auteur supérieur de l'institut de Wellcome Sanger et de l'école de Londres de l'hygiène et du médicament tropical a dit : « A détaillé des études comme ceci contribuent à notre compréhension croissante de la façon dont le choléra déménage en travers du globe : preuve d'aviser des stratégies améliorées de contrôle ainsi que de recenser des endroits pour davantage de recherche. Notre défi est de comprendre mieux pourquoi une bactérie si simple continue à constituer un tel danger à la santé des personnes, avec cette étude que nous sommes une petite opération plus proche. »

Source:
Journal reference:

Dorman, M.J., et al. (2020) Genomics of the Argentinian cholera epidemic elucidate the contrasting dynamics of epidemic and endemic Vibrio cholerae. Nature Communications. doi.org/10.1038/s41467-020-18647-7.