Les chercheurs à l'université de Wisconsin-Madison ont conduit une apparence d'étude cette infection avec le coronavirus de syndrôme respiratoire aigu sévère 2 réactions immunitaires robustes des déclencheurs (SARS-C0V-2) aux épitopes en travers du plein protéome viral.
SARS-CoV-2 est l'agent responsable de la pandémie actuelle de la maladie 2019 de coronavirus (COVID-19) qui continue à exercer un effet dévastateur sur la santé publique globale et l'économie.
L'ONG d'Irène et les collègues disent que les découvertes d'étude proposent que la protéine virale de la membrane (m), en particulier l'épitope 1-M-24, ainsi que d'autres épitopes hautement réactifs devraient être étudiés davantage en tant qu'objectifs potentiels dans le développement de la diagnose, des vaccins, et des traitements pour SARS-CoV-2.
Ces épitopes pourraient également être utiles pour développer la diagnose, vaccins, et des traitements pour d'autres coronaviruses dangereux qui peuvent apparaître à l'avenir, ils ajoutent.
Une version de prétirage du papier est procurable dans le bioRxiv* de serveur, alors que l'article subit l'inspection professionnelle.
Les sérums de contrôle montrent la réactivité fréquemment à CCCoVs et rarement à Radars à ouverture synthétique-CoV, à MERS-CoV, et à SARS-CoV-2. On a analysé des sérums de 20 sujets témoins rassemblés avant 2019 pour l'IgG grippant aux pleins protéomes de 9 CoVs sur une puce ADN de peptide. Des protéines virales sont montrées alignées sur le protéome SARS-CoV-2 avec chaque virus ayant une Commission individuelle ; La position des acides aminés SARS-CoV-2 (aa) est représentée sur l'axe des abscisses. Gripper a été mesuré comme réactivité qui était les écarts-type >3 au-dessus du moyen pour les caractéristiques de choix normalisées par log2-quantile.
« les options basées sur anticorps peuvent avoir besoin augmenter »
Tous les coronaviruses ont quatre protéines de structure principales (pointe [S], enveloppe [E], membrane [M] et nucleocapsid [N]), ainsi que nombreuses protéines non-structurelles et protéines annexes.
Dans le cas de SARS-CoV-2, les anticorps contre S et le N ont jusqu'ici suscité la plupart d'attention.
Cependant, pas toutes les personnes infectées produisent des niveaux détectables des anticorps contre ces protéines, proposant que des options basées sur anticorps puissent devoir être augmentées.
Beaucoup moins est compris au sujet des réactions des anticorps à d'autres protéines SARS-CoV-2, bien que les caractéristiques des études d'autres coronaviruses proposent que ces protéines puissent être importantes. Par exemple, quelques vaccins expérimentaux pour SARS-CoV-1 et le syndrome respiratoire de Moyen-Orient (MERS-CoV) déclenchent le rétablissement des anticorps contre la protéine annexe orf8.
En outre, les études précédentes ont prouvé que l'activité hétérospécifique humorale se produit entre les coronaviruses, qui pourraient être protecteurs. Cependant, l'activité hétérospécifique de plein-protéome n'a pas été encore vérifiée.
Que l'étude actuelle a-t-elle concerné ?
Maintenant, l'ONG et les collègues ont employé une puce ADN de peptide qu'elles ont conçu pour évaluer le protéome de SARS-CoV-2 et d'autres coronaviruses humains et animaux pour déterminer la spécificité et l'activité hétérospécifique d'anticorps entre les virus.
La puce ADN a été employée pour profiler des anticorps (IgG) d'immunoglobuline G parmi 40 patients qui avaient récupéré de COVID-19 et de 20 contrôles de SARS-CoV-2-naive.
« Nous avons visé à tracer la pleine ampleur de gripper des anticorps induits par l'infection SARS-CoV-2 et pour classer les épitopes recensés en termes de probabilité d'importance et d'immunodominance, » écrit l'équipe.
Les chercheurs ont recensé 79 épitopes de cellules de B en travers des protéines de structure S, M, N, le polyprotein orf1ab, et les protéines annexes orf3a, orf6, et orf8.
Le plus haut épitope était 1-M-24, qui est trouvé dans les N-terminus du M.
Les sérums patients ont expliqué la réactivité de haut-grandeur entre d'autres épitopes dans la réactivité de S, de M, de N, et d'orf3a et d'inférieur-grandeur parmi des épitopes en d'autres protéines.
Des épitopes avec la réactivité la plus élevée dans S ont été trouvés dans le peptide de fusion, alors que des épitopes moins réactifs étaient trouvés dans le domaine récepteur-grippant.
Quatre des épitopes montrent l'activité de neutralisation efficace
Quatre des épitopes trouvés ont précédemment expliqué l'activité de neutralisation efficace, et toute la ces derniers classés dans les 10 épitopes principaux en cela l'étude.
L'équipe a également constaté que les anticorps anti-SARS-CoV-2 croix-ont réagi avec des épitopes homologues en travers des protéomes d'autres coronaviruses humains et animaux.
Les chercheurs précisent que des « centaines de CoVs [les coronaviruses] ont été découvertes dans "bat" et toute autre substance, rendant de futurs débordements inévitables. »
Le nombre le plus élevé (70) d'épitopes croix-réactifs ont été trouvés dans le betacoronavirus de "bat" RaTG13, qui est le virus le plus étroitement lié à SARS-CoV-2 (identité de nucléotide de 96%). Ceci a été suivi du coronavirus de pangolin (51 épitopes) et de SARS-CoV-1 (40 épitopes).
Une région correspondant SARS-CoV-2 à l'épitope 807-S-26 était croix-réactive en travers de tous les coronaviruses, et une région correspondant SARS-CoV-2 à l'épitope 1140-S-25, était croix-réactive en travers de tous les betacoronaviruses.
Quelles sont les implications de l'étude ?
Les chercheurs disent que les résultats proposent que la protéine de structure M - en particulier l'épitope 1-M-24 - et les autres épitopes neufs recensés ici devrait être explorée en tant qu'objectifs importants pour développer la diagnose améliorée, les vaccins, et les traitements pour SARS-CoV-2 et d'autres coronaviruses dangereux qui peuvent apparaître à l'avenir.
En outre, « l'activité hétérospécifique grande que nous avons observée dans quelques séquences homologues de peptide peut aider à guider le développement des vaccins de carter-CoV, particulièrement donné que des anticorps grippant à 807-S-26 et à 1140-S-25, les motifs d'épitope croix-réactifs en travers de tout le CoVs et tous les β-CoVs, respectivement, sont connus neutraliser efficace, » dit l'équipe.
Avis *Important
le bioRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.