I ricercatori all'università di Wisconsin-Madison hanno condotto una rappresentazione di studio quell'infezione con il coronavirus di sindrome respiratorio acuto severo 2 risposte immunitarie robuste di grilletti (SARS-C0V-2) agli epitopi attraverso il proteome virale completo.
SARS-CoV-2 è l'agente responsabile della pandemia corrente di malattia 2019 di coronavirus (COVID-19) che continua ad avere un effetto devastatore sulla salute pubblica globale e sull'economia.
La ONG di Irene ed i colleghi dicono che i risultati di studio suggeriscono che la proteina virale della membrana (m), specialmente l'epitopo 1-M-24 come pure altri epitopi altamente reattivi dovrebbero essere studiati più ulteriormente come obiettivi potenziali nello sviluppo dei sistemi diagnostici, dei vaccini e delle terapie per SARS-CoV-2.
Questi epitopi potrebbero anche essere utili per sviluppare i sistemi diagnostici, vaccini e terapie per altri coronaviruses pericolosi che possono emergere in futuro, aggiungono.
Una versione della pubblicazione preliminare del documento è disponibile nel bioRxiv* del " server ", mentre l'articolo subisce la revisione tra pari.
I sieri di controllo mostrano frequentemente la reattività a CCCoVs e raramente a SAR-CoV, a MERS-CoV e a SARS-CoV-2. I sieri da 20 oggetti di controllo raccolti prima del 2019 sono stati analizzati per IgG che lega ai proteomes completi di 9 CoVs su un microarray del peptide. Le proteine virali sono indicate state allineate al proteome SARS-CoV-2 rispetto ad ogni virus che ha un comitato determinato; La posizione dell'amminoacido (aa) SARS-CoV-2 è rappresentata sull'ascissa. Legare è stato misurato come reattività che era deviazioni standard >3 sopra la media per i dati di schiera normalizzati log2-quantile.
“ad opzioni basate a anticorpo possono avere bisogno di di espandersi„
Tutti i coronaviruses hanno quattro proteine strutturali principali (punta [S], busta [E], membrana [m.] e nucleocapsid [N]) come pure le numerose proteine non strutturali e proteine accessorie.
Nel caso di SARS-CoV-2, gli anticorpi contro la S e N finora hanno ricevuto la maggior parte della attenzione.
Tuttavia, non tutte le persone infettate generano i livelli rilevabili di anticorpi contro queste proteine, suggerenti che ad opzioni basate a anticorpo possano avere bisogno di di essere ampliato.
Molto di meno è capito circa le risposte dell'anticorpo ad altre proteine SARS-CoV-2, sebbene i dati dagli studi su altri coronaviruses suggeriscano che queste proteine possano essere importanti. Per esempio, alcuni vaccini sperimentali per SARS-CoV-1 e la sindrome respiratoria di Medio Oriente (MERS-CoV) avviano la generazione di anticorpi contro la proteina accessoria orf8.
Ancora, gli studi precedenti hanno indicato che la reattività crociata umorale si presenta fra i coronaviruses, in grado di essere protettivi. Tuttavia, la reattività crociata interamente-proteome ancora non è stata studiata.
Che cosa lo studio corrente ha compreso?
Ora, la ONG ed i colleghi hanno usato un microarray che del peptide hanno progettato per valutare il proteome di SARS-CoV-2 e di altri coronaviruses umani ed animali per determinare la specificità e la reattività crociata dell'anticorpo fra i virus.
Il microarray è stato usato per profilare gli anticorpi di G (IgG) dell'immunoglobulina fra 40 pazienti che avevano recuperato da COVID-19 e da 20 comandi di SARS-CoV-2-naive.
“Abbiamo mirato a mappare le dimensioni complete del legame degli anticorpi indotti tramite l'infezione SARS-CoV-2 ed allineare gli epitopi identificati in termini di probabilità di importanza e del immunodominance,„ scrive il gruppo.
I ricercatori hanno identificato 79 epitopi del linfocita B attraverso le proteine strutturali S, m., N, il poliproteico orf1ab e le proteine accessorie orf3a, orf6 e orf8.
L'epitopo più alto era 1-M-24, che è trovato nell'N-estremità del M.
I sieri pazienti hanno dimostrato la reattività di alto-grandezza tra altri epitopi nella reattività di S, di m., di N e di orf3a e di basso-grandezza fra gli epitopi in altre proteine.
Gli epitopi con il più alta reattività nella S sono stati trovati nel peptide di fusione, mentre gli epitopi meno reattivi sono stati trovati nel dominio dell'ricevitore-associazione.
Quattro degli epitopi esibiscono l'attività di neutralizzazione potente
Quattro degli epitopi individuati precedentemente hanno dimostrato l'attività di neutralizzazione potente e tutti i questi allineati all'interno dei 10 epitopi principali in questo lo studio.
Il gruppo egualmente ha trovato che gli anticorpi anti-SARS-CoV-2 inter-hanno reagito con gli epitopi omologhi attraverso i proteomes di altri coronaviruses umani ed animali.
I ricercatori precisano che “le centinaia di CoVs [coronaviruses] sono state scoperte in pipistrelli ed in altre specie, rendenti gli straripamenti futuri inevitabili.„
Il più alto numero (70) degli epitopi inter-reattivi è stato trovato nel betacoronavirus del pipistrello RaTG13, che è il virus più strettamente connesso a SARS-CoV-2 (identità del nucleotide di 96%). Ciò è stata seguita dal coronavirus del pangolino (51 epitopo) e da SARS-CoV-1 (40 epitopi).
Una regione che corrisponde SARS-CoV-2 all'epitopo 807-S-26 era inter-reattiva attraverso tutti i coronaviruses ed una regione che corrisponde SARS-CoV-2 all'epitopo 1140-S-25, era inter-reattiva attraverso tutti i betacoronaviruses.
Che cosa sono le implicazioni dello studio?
I ricercatori dicono che i risultati indicano che la proteina strutturale la m. - specialmente l'epitopo 1-M-24 - e gli altri nuovi epitopi identificati qui dovrebbe essere esplorata come obiettivi importanti nello sviluppare i sistemi diagnostici migliori, i vaccini e le terapie per SARS-CoV-2 ed altri coronaviruses pericolosi che possono emergere in futuro.
Ancora, “la vasta reattività crociata che abbiamo osservato in alcune sequenze omologhe del peptide può contribuire a guidare lo sviluppo dei vaccini pan--CoV, dato particolarmente quel gli anticorpi che legano a 807-S-26 e 1140-S-25, i motivi di epitopo inter-reattivi attraverso tutto il CoVs e tutti i β-CoVs, rispettivamente, sono conosciuti potente neutralizzare,„ dice il gruppo.
Avviso *Important
il bioRxiv pubblica i rapporti scientifici preliminari che pari-non sono esaminati e, pertanto, non dovrebbero essere considerati conclusivi, guida la pratica clinica/comportamento correlato con la salute, o trattato come informazioni stabilite.