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Les chercheurs emploient la technologie de ordonnancement unicellulaire pour caractériser le système immunitaire des patients COVID-19

Dans cette étude, qui était publiée dans les frontières de tourillon en immunologie le 30 septembre, les chercheurs ont employé l'ordonnancement pour caractériser le système immunitaire des patients qui survivent de l'infection COVID-19 du début de sympt40me par la guérison.

D'une manière primordiale, ils ont également recensé un biomarqueur efficace pour la progression de la maladie de prévision. Les études complémentaires complémentaires pourraient mener au développement d'une demande de règlement pour COVID-19 qui est inspiré par notre propre système immunitaire.

L'étude a été aboutie par Ling Chen et Nanshan Zhong du Centre de Recherches Cliniques national pour la maladie respiratoire en Chine et Jian Han, chercheur de corps enseignant à l'alpha institut du Hudson en Alabama et fondateur d'iRepertoire.

Zhong est l'un des médecins que le premier a diagnostiqué le radar à ouverture synthétique et était instrumental en traitant et en réglant la maladie. Han a été précédemment identifié pour son travail pendant la manifestation de radar à ouverture synthétique, gagnant une récompense d'innovation technologique de Wall Street Journal.

Maintenant, Han, Zhong, et collaborateurs ont pris des analyses de leur expérience avec le radar à ouverture synthétique et les ont employées pour adopter une approche sans précédent à étudier COVID-19. Pour les virus apparaissants sans le vaccin, notre seulement défense est notre système immunitaire.

Cette étude fournit un niveau sans précédent d'analyse dans les cellules immunitaires de 23 patients COVID-19 plus de trois étapes différentes de la maladie.

Pour que notre système immunitaire combatte hors circuit une maladie infectieuse neuve, elle d'abord doit apprendre à l'identifier. Cette reconnaissance est coordonnée par une famille des récepteurs appelés de protéines qui vivent sur la surface des cellules de T et des cellules de B.

Il y a sept types des protéines réceptrices de cellule T et de B de récepteur cellulaire, les réseaux appelés, deux dont cartel pour former les récepteurs sur la surface de chaque B ou de cellule T. Chaque réseau individuel se compose de différents segments multiples, activant des millions de différentes seules cellules de B et de T chez chaque personne.

Quand une infection neuve est introduite, les cellules immunitaires qui identifient le virus de envahissement se multiplient rapidement, entraînant une commande des vitesses dans la diversité de B et ou des cellules de T. En étudiant l'empreinte digital infectée du système immunitaire d'une personne, connue sous le nom de répertoire immunisé, nous pouvons gagner des analyses dans ce qu'un peu les cellules immunitaires seront efficaces à combattre hors circuit le virus.

Cette étude a capté, pour la première fois, l'extension et la contraction de chacun des sept réseaux dans le répertoire immunisé. Ils ont découvert que tôt dans l'infection COVID-19, la découverte à cellule T est sensiblement épuisée. Les cellules de T récupérées comme patients se sont améliorées, proposant que le répertoire à cellule T pourrait être une borne importante pour la progression de la maladie de prévision.

Pour des cellules de B, la composition à chaînes des récepteurs peut indiquer si la cellule de B est devenue « activée » par une infection. Les cellules de B activées commutent leur type à chaînes (de D/M à l'A/M, ou de G/M) et commencez à produire des anticorps.

La détermination quels réseaux spécifiques sont activés pourrait aider à recenser quels anticorps seront efficaces en traitant l'infection.

Chen et collègues ont découvert que les patients infectés avec COVID-19 montrent une extension importante de leurs réseaux de m et de G-type, suivie d'un passage postérieur aux réseaux d'A.

La prochaine opération est d'isoler les différentes cellules de B qui montrent le changement à chaînes afin de recenser les anticorps produits par les patients qui récupèrent de l'infection. Nous continuons ce travail à l'iRepertoire en effectuant l'analyse réseau sur les caractéristiques de lymphocyte B de ces patients et en recensant les clones de réponse.

Nous participons également à une étude locale pour employer notre technologie de ordonnancement unicellulaire sur des échantillons provenant des patients infectés en recensant directement des lymphocytes B de Sars-Cov-2-specific. Les deux méthodes peuvent indiquer l'identité des anticorps de neutralisation de la valeur thérapeutique. »

Jian Han, chercheur de corps enseignant, institut du Hudson alpha et fondateur d'iRepertoire

« Ce qui effectue réellement cette étude intéressante, est que nous avons profilé chacun des sept réseaux du répertoire immunisé en même temps, » a dit Miranda Byrne-Steele, directeur de recherche et développement à l'iRepertoire et à un auteur sur le papier. « La plupart des études regardent un ou deux réseaux à la fois. En profilant chacun des sept réseaux, nous avons recensé les configurations que vous n'auriez pas remarquées dans une étude à chaîne unique. »

Ces configurations ont la signification clinique potentielle. Pour des lymphocytes T, la signature observée dans les patients qui récupèrent contre ceux qui progressent, pourrait faciliter le développement des tests pronostiques. De tels tests pourraient aider à recenser quels patients sont susceptibles d'avoir besoin ou tirer bénéfice des demandes de règlement particulières.

Pour des lymphocytes B, ceux qui prolifèrent pourraient indiquer les anticorps qui peuvent eux-mêmes servir de demandes de règlement potentielles aux gens qui sont déjà infectés, mais la récupération.

Source:
Journal reference:

Niu, X., et al. (2020) Longitudinal Analysis of T and B Cell Receptor Repertoire Transcripts Reveal Dynamic Immune Response in COVID-19 Patients. Frontiers in Immunology. doi.org/10.3389/fimmu.2020.582010.