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Les aides mendéliennes de randomisation évaluent le choc des protéines de diffusion dans COVID-19

Depuis son émergence en décembre 2019, à Wuhan, la Chine, la maladie 2019 (COVID-19) de coronavirus, causée par une infection avec le coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère, a mené à plus de 1 million de morts mondiales.

COVID-19 est une pandémie faisante rage qui a affecté toutes les conditions sociales la vie humaine. Cependant, jusqu'à présent, il n'y a aucun détail et traitement efficace qui peuvent réduire la morbidité et la mortalité de cette infection SARS-CoV-2.

Tandis que les vaccins sont sur leur chemin, les objectifs validés sont nécessaires pour explorer les solutions thérapeutiques pour COVID-19 plus plus loin. Un tel objectif validé est les protéines de diffusion.

Combinant l'information de la génétique humaine et des milliers de protéines de diffusion, la probabilité d'une arène accélérée des traitements COVID-19 s'améliore de manière significative.

Sirui Zhou et autres, dans un papier récent de prétirage de medRxiv*, recensent les protéines de diffusion influençant la susceptibilité COVID-19 et la gravité en utilisant une étude mendélienne de randomisation de deux-échantillon (MR) de grande puissance. C'est un défi pour démêler la relation de cause à effet entre les protéines de diffusion et la susceptibilité COVID-19 ou la gravité.

Résumé de la preuve supportant un rôle pour OAS1 dans les résultats COVID-19
Résumé de la preuve supportant un rôle pour OAS1 dans les résultats COVID-19

Ce modèle d'étude balaye rapidement des centaines de protéines de diffusion et réduit n'importe quelle polarisation qui peut surgir en raison de la causalité confondante et inverse.

Les variables de confusion gênent effet réel de ` le' d'une exposition sur des résultats. La confusion se produit quand la protéine de diffusion et COVID-19 partagent une cause classique. La causalité inverse est quand le rapport d'exposition-résultats est dû décentré à d'autres facteurs environnementaux, menant à un résultat inattendu qui s'y mêle ou masque le résultat réel. Ici, la causalité inverse se produit quand COVID-19 lui-même influence le niveau d'une protéine de diffusion.

Pour adresser de telles limitations, les chercheurs emploient la randomisation mendélienne (MR) - une méthode génétique d'épidémiologie qui emploie des variants génétiques en tant que variables instrumentales, pour vérifier l'effet d'une exposition (taux de protéine dans cette étude) sur des résultats (ici résultats COVID-19). Pendant que les génotypes sont fait au hasard affectés à la conception et avant le début de la maladie, M. études ne sont pas affectés par la causalité inverse.

Cependant, M. méthode a trois suppositions de faisceau : 1) les variants génétiques doivent être associés à l'exposition d'intérêt, 2) eux n'affectent pas les résultats, à moins que par l'exposition d'intérêt (c.-à-d., un manque de pleiotropy horizontal), et 3) eux ne vous associiez pas aux confounders de la relation d'exposition-résultats.

Les chercheurs ont recensé les déterminants génétiques des taux de protéine de diffusion dans le taux de protéine de grande puissance GWASs (études de la taille du génome d'association). Ils ont alors sélecté les SNP (polymorphismes uniques de nucléotide) liés aux protéines de diffusion, qui étaient proximales à leurs gènes codés (cis-pQTLs).

Ils ont évalué si ces gènes étaient associés aux résultats COVID-19 dans les résultats COVID-19 GWASs initiatiques de génétique d'hôte d'ICDA (https://www.covid19hg.org/results/), et a alors entrepris M. analyses pour estimer l'effet du taux de protéine de diffusion des résultats COVID-19.

Dans cette étude, des analyses de sensibilité multiples ont été conduites pour sonder M. suppositions. Les résultats obtenus étaient cohérents partout. L'étude a évalué 955 protéines pour trois résultats COVID-19 dans ~17.600 cas et 1,3 millions de contrôles.

La preuve montrée a augmenté des niveaux d'OAS1 et de l'IL 10RB fortement liés à la susceptibilité COVID-19 réduite et aux résultats sévères. Dans ce contexte, les chercheurs précisent que des traitements activant OAS1 peuvent être considérés comme pour repositionners vers de meilleures demandes de règlement COVID-19.

Tandis que le développement de novo de médicament prendra du temps, la compréhension des protéines de diffusion activera de meilleurs traitements patients.

L'étude entreprise de l'étiologie des protéines de diffusion dans l'infection COVID-19 est un objectif provocant parce que, en pareil cas, l'infection elle-même entraîne des changements des protéines de diffusion.

En conclusion, les chercheurs ont trouvé la preuve significative qu'OAS1 exerce une action protectrice sur la susceptibilité COVID-19 et la gravité. Basé sur ce résultat, les chercheurs proposent d'explorer les inhibiteurs beta-1b et PDE12 d'interféron, qui sont connus pour augmenter les niveaux OAS1 et pour comprendre davantage le rôle dans les résultats COVID-19.

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
  • Circulating Proteins Influencing COVID-19 Susceptibility and Severity: a Mendelian Randomization Study, Sirui Zhou, Guillaume Butler-Laporte, Tomoko Nakanishi, David Morrison, Jonathan Afilalo, Marc Afilalo, Nofar Kimchi, Zaman Afrasiabi, Nardin Rezk, Meriem Bouab, Charlotte Guzman, Louis Petitjean, Xioaqing Xue, Christos Tselios, Branka Vulesevic, Yiheng Chen, Vincent Mooser, Vincenzo Forgetta, Daniel Kaufmann, Brent Richards, medRxiv 2020.10.13.20212092; doi: https://doi.org/10.1101/2020.10.13.20212092, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.10.13.20212092v1  
Dr. Ramya Dwivedi

Written by

Dr. Ramya Dwivedi

Ramya has a Ph.D. in Biotechnology from the National Chemical Laboratories (CSIR-NCL), in Pune. Her work consisted of functionalizing nanoparticles with different molecules of biological interest, studying the reaction system and establishing useful applications.

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