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Las ayudas mendelianas de la distribución aleatoria evalúan el impacto de proteínas de circulación en COVID-19

Desde su aparición en diciembre de 2019, en Wuhan, China, la enfermedad 2019 (COVID-19) del coronavirus, causada por la infección con el coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de la neumonía asiática, ha llevado a más de 1 millón de muertes por todo el mundo.

COVID-19 es un pandémico que rabia que ha afectado a todos los paseos de la vida humana. Con todo, hasta la fecha, hay las terapias no específicas y efectivas que pueden reducir la morbosidad y la mortalidad de esta infección SARS-CoV-2.

Mientras que las vacunas están en su manera, los objetivos validados son necesarios explorar las soluciones terapéuticas para COVID-19 más lejos. Un tal objetivo validado es las proteínas de circulación.

Combinando la información de la genética humana y de los millares de proteínas de circulación, la probabilidad de una arena acelerada de las terapias COVID-19 perfecciona importante.

Sirui Zhou y otros, en un papel reciente de la prueba preliminar del medRxiv*, determina las proteínas de circulación que influencian la susceptibilidad COVID-19 y la severidad empleando un estudio mendeliano de la distribución aleatoria de la dos-muestra (MR) en grande. Es un reto para desenredar el lazo causal entre las proteínas de circulación y la susceptibilidad COVID-19 o la severidad.

Resumen de las pruebas que soporta un papel de OAS1 en los resultados COVID-19
Resumen de las pruebas que soporta un papel de OAS1 en los resultados COVID-19

Este diseño del estudio explora rápidamente centenares de proteínas de circulación y reduce cualquier polarización negativa que pueda presentarse debido a la causalidad de confusión y reversa.

Las variables de la confusión obscurecen efecto real del ` el' de una exposición sobre resultado. La confusión suceso cuando la proteína de circulación y COVID-19 comparten una causa común. La causalidad reversa es cuando la relación del exposición-resultado es en polarización negativa debido a otros factores ambientales, llevando a un resultado inesperado que interfiera o encubra el resultado real. Aquí, la causalidad reversa ocurre cuando COVID-19 sí mismo influencia el nivel de una proteína de circulación.

Para dirigir tales limitaciones, los investigadores utilizan la distribución aleatoria mendeliana (MR) - un método genético de la epidemiología que utilice variantes genéticas como variables instrumentales, para probar el efecto de una exposición (la proteína nivela en este estudio) sobre un resultado (aquí resultados COVID-19). Mientras que los genotipos se destinan aleatoriamente en el concepto y antes del inicio de la enfermedad, la causalidad reversa no afecta a SR. estudios.

Sin embargo, SR. método tiene tres suposiciones de la base: 1) las variantes genéticas se deben asociar a la exposición del interés, 2) ellas no afectan al resultado, a menos que con la exposición del interés (es decir, una falta de pleiotropy horizontal), y 3) ellas no se asocie a los factores de confusión del lazo del exposición-resultado.

Los investigadores determinaron los determinantes genéticos de los niveles de circulación de la proteína en el nivel en grande GWASs (estudios genoma-anchos de la proteína de la asociación). Entonces seleccionaron el SNPs (únicos polimorfismos del nucleótido) asociado a las proteínas de circulación, que estaban próximas a sus genes codificados (cis-pQTLs).

Fijaron si estos genes fueron asociados a los resultados COVID-19 en los resultados preliminares COVID-19 GWASs de la genética del ordenador principal de ICDA (https://www.covid19hg.org/results/), y entonces emprendió a SR. análisis para estimar el efecto del nivel de circulación de la proteína de los resultados COVID-19.

En este estudio, los análisis de sensibilidad múltiples conducto para sondar a SR. suposiciones. Los resultados obtenidos eran constantes en todas partes. El estudio fijó 955 proteínas para tres resultados COVID-19 en ~17.600 casos y 1,3 millones de mandos.

Las pruebas mostradas aumentaron los niveles de OAS1 y de IL 10RB asociados fuertemente a la susceptibilidad reducida COVID-19 y a los resultados severos. En este contexto, los investigadores señalan que las terapias que activan OAS1 se pueden considerar para colocar de nuevo hacia mejores tratamientos COVID-19.

Mientras que el revelado de la droga de novo tomará tiempo, la comprensión de las proteínas de circulación habilitará mejores terapias pacientes.

El estudio emprendido de la etiología de proteínas de circulación en la infección COVID-19 es una meta desafiadora porque, en estos casos, la infección sí mismo causa cambios en las proteínas de circulación.

En conclusión, los investigadores encontraron pruebas importantes que OAS1 tiene un efecto protector sobre la susceptibilidad COVID-19 y la severidad. De acuerdo con este resultado, los investigadores sugieren el explorar de los inhibidores beta-1b y PDE12 del interferón, que se saben para aumentar los niveles OAS1 y para entender más lejos el papel en los resultados COVID-19.

Advertencia *Important

el medRxiv publica los partes científicos preliminares que par-no se revisan y, por lo tanto, no se deben mirar como concluyentes, conduce práctica clínica/comportamiento relativo a la salud, o tratado como información establecida.

Journal reference:
  • Circulating Proteins Influencing COVID-19 Susceptibility and Severity: a Mendelian Randomization Study, Sirui Zhou, Guillaume Butler-Laporte, Tomoko Nakanishi, David Morrison, Jonathan Afilalo, Marc Afilalo, Nofar Kimchi, Zaman Afrasiabi, Nardin Rezk, Meriem Bouab, Charlotte Guzman, Louis Petitjean, Xioaqing Xue, Christos Tselios, Branka Vulesevic, Yiheng Chen, Vincent Mooser, Vincenzo Forgetta, Daniel Kaufmann, Brent Richards, medRxiv 2020.10.13.20212092; doi: https://doi.org/10.1101/2020.10.13.20212092, https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.10.13.20212092v1  
Dr. Ramya Dwivedi

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Dr. Ramya Dwivedi

Ramya has a Ph.D. in Biotechnology from the National Chemical Laboratories (CSIR-NCL), in Pune. Her work consisted of functionalizing nanoparticles with different molecules of biological interest, studying the reaction system and establishing useful applications.

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