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L'analyse comparative indique des vulnérabilités courantes en travers des coronaviruses

Trois syndromes respiratoires humains mortels liés aux infections de coronavirus (CoV) ont apparu pendant les dernières deux décennies. Ils sont syndrôme respiratoire aigu sévère (SARS) en 2002, syndrome respiratoire de Moyen-Orient (MERS) en 2012, et maladie 2019 (COVID-19) de coronavirus en 2019.

Le coronavirus 2 (SARS-CoV-2), l'agent causal de syndrôme respiratoire aigu sévère de COVID-19, est étroitement lié aux coronaviruses de SARS-CoV-1 et de MERS, qui étaient plus mortels mais moins transmissibles que SARS-CoV-2.

Micrographe électronique de lecture de Colorized de particules de coronavirus de MERS du bourgeonnement de particules de virus de MERS (jaune) et fixé sur la surface des cellules infectées de VERO E6 (bleues). L
Micrographe électronique de lecture de Colorized de particules de coronavirus de MERS du bourgeonnement de particules de virus de MERS (jaune) et fixé sur la surface des cellules infectées de VERO E6 (bleues). Image saisie et couleur-améliorée à l'installation intégrée par NIAID de recherches dans le fort Detrick, le Maryland. Crédit : NIAID

La pandémie COVID-19 actuelle a affecté plus de 39,8 millions de durées mondial et a entraîné plus de 1,11 millions de morts jusqu'ici. La pandémie a déclenché des répercussions socio-économiques de paralysie dans beaucoup de pays en travers du globe. Les sympt40mes COVID-19 varient largement basé sur plusieurs facteurs et peuvent mener à prolongé et maladie grave dans quelques patients. Quelques études proposent que les sympt40mes puissent persister même après la guérison et les résultats de test en temps réel négatifs d'amplification en chaîne par polymérase (RT-PCR).

Ce défi sans précédent lancé par COVID-19 a incité de vastes efforts pour développer un vaccin et repurposed la thérapeutique antivirale qui pourrait offrir des demandes de règlement potentielles avec des profils de sécurité connus et des chronologies plus courtes pour le développement. Repurposing de Remdesivir, l'analogue antiviral de nucléoside, et la dexaméthasone stéroïde anti-inflammatoire ont l'espoir donné que les composés existants peuvent être essentiels dans le combat contre la pandémie COVID-19. En dépit de ceci, il ne reste aucune demande de règlement approuvée pour COVID-19, et les efforts pour trouver un vaccin ou un médicament pourraient être compliqués par l'évolution de SARS-CoV-2 et de résistance au médicament potentielle qu'elle peut réaliser pendant l'évolution.

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Micrographe électronique nouveau de lecture du coronavirus SARS-CoV-2 Colorized d'une cellule d'apoptotique (rose) fortement infectée avec des particules du virus SARS-COV-2 (vert), d'isolement dans un échantillon patient. Image saisie à l'installation intégrée par NIAID de recherches (IRF) dans le fort Detrick, le Maryland. Crédit : NIAID

Comparer des interactions de protéines virales et humaines des trois coronaviruses

Une grande équipe de recherche des universités variées et des instituts en travers des Etats-Unis et de l'Europe a effectué une analyse comparative de l'interaction entre les protéines virales et humaines et la localisation de la protéine virale pour chacun des trois virus. Leur étude est publiée en revue scientifique, le tourillon scolaire prestigieux de l'association américaine pour la science de avancement.

Les chercheurs ont conduit le dépistage génétique fonctionnel et ont recensé les facteurs d'hôte qui interrompent fonctionellement la prolifération du coronavirus. Ces facteurs ont compris une protéine mitochondriale Tom70 de chaperon qui agit l'un sur l'autre avec SARS-CoV-1 et SARS-CoV-2 Orf9b. Cette interaction a été structurellement caractérisée avec l'aide de la microscopie électronique de cryo.

L'approche de rayure d'interaction différentielle a recensé le virus-détail et a partagé des interactions.

Les chercheurs se sont développés et les trois plans différents comparés d'interaction protéine-protéine de coronavirus-hôte pour recenser et étudier des mécanismes moléculaires de carter-coronavirus. Ils avaient l'habitude l'approche de rayure d'interaction différentielle (DIS) quantitative pour recenser le virus-détail et ont mis en commun des interactions entre différents coronaviruses. Ils également ont systématiquement exécuté l'analyse sous-cellulaire de localisation avec des protéines virales et les anticorps étiquetés visez dont les protéines spécifiques
SARS-CoV-2.

Les chercheurs ont recensé les mécanismes moléculaires principaux et les demandes de règlement thérapeutiques potentielles en combinant des facteurs génétiquement validés d'hôte avec des caractéristiques génétiques des patients COVID-19 et des dossiers médicaux. Leurs résultats ont prouvé que la localisation de protéine pourrait différer quand les protéines virales individuellement exprimées sont avec la localisation de cette même protéine pendant l'infection. Ceci peut être dû à beaucoup de facteurs, y compris le coup-emplacement motivé par étiqueter, les modifications de localisation dues aux associés d'interaction, ou les compartiments cellulaires spécifiques à l'infection.

La « réplication dans d'autres cohortes patientes et fonctionnent davantage sera nécessaire pour voir s'il y a valeur thérapeutique dans ces liens, mais pour le moins nous avons expliqué une stratégie où des analyses réseau de protéine peuvent être employées pour effectuer des prévisions testables à partir de l'information du monde réel et clinique. »

Ces différences sont des oppositions essentielles des études hôte-virales d'interaction réalisées utilisant les protéines exprimées étiquetées. Cependant, ces travail et études précédentes montrent comment ces observations sont critiques pour recenser des procédés visés par hôte et s'approprient des objectifs de médicament. Les auteurs estiment que leurs résultats sont assez significatifs pour mériter davantage de moléculaire et des études cliniques.

Une approche intégratrice pour analyser et comprendre l'infection de coronavirus

De façon générale, les chercheurs ont décrit un de collaboration et l'approche intégratrice pour étudier et interpréter l'infection de coronavirus et à la recenser a visé les mécanismes qui peuvent être d'importance élevée pour d'autres virus de famille de coronavirus. Ils avaient l'habitude des techniques variées des protéomiques, de la virologie, de la biologie cellulaire, de la génétique, des biochimies, de la biologie structurelle, et de l'information clinique et génomique pour offrir une vue holistique des interactions de SARS-CoV-2 et d'autres coronaviruses avec les cellules hôte infectées. Les chercheurs recommandent vivement d'employer une approche si intégratrice pour étudier d'autres agents infectieux et d'autres endroits de la maladie.

« Bien qu'une analyse attentive du parent bénéficie et des risques des antipsychotiques particuliers devraient être entrepris avant de considérer des études prospectives ou des interventions, ces caractéristiques et analyse expliquent comment l'information moléculaire peut être traduite en implications du monde réel pour la demande de règlement de COVID-19, une approche qui peut éventuel être appliquée à d'autres maladies à l'avenir. »

Journal reference:
Susha Cheriyedath

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Susha Cheriyedath

Susha has a Bachelor of Science (B.Sc.) degree in Chemistry and Master of Science (M.Sc) degree in Biochemistry from the University of Calicut, India. She always had a keen interest in medical and health science. As part of her masters degree, she specialized in Biochemistry, with an emphasis on Microbiology, Physiology, Biotechnology, and Nutrition. In her spare time, she loves to cook up a storm in the kitchen with her super-messy baking experiments.

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