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La clínica de Cleveland ensambla el nuevo centro para la investigación multimodal y de la Multi-Escala integrada de Nucleome

La clínica de Cleveland se ha nombrado una institución participante para el centro nuevamente establecido para la investigación multimodal y de la Multi-Escala integrada de Nucleome, hecho posible por un de cinco años recientemente concedida, concesión del consorcio $6,5 millones de los institutos nacionales del fondo común de la salud (NIH). Ming Hu, doctorado, estado mayor auxiliar en el departamento de las ciencias cuantitativas de la salud, es co-investigador en la concesión y llevará los esfuerzos multi-omics del análisis de los datos del centro.

Esta concesión grande es una del más última que se financiarán como parte del programa del 4D Nucleome de NIH, que intenta entender mejor cómo el material genético se ordena dentro de nuestras células y cómo la organización espacial de la cromatina (el material dentro de los cromosomas que contienen la DNA y las proteínas) contribuye a la salud humana y a la enfermedad. La mayoría de la DNA humana se contiene en una división celular muy pequeña llamada el núcleo. A pesar de su talla minúscula, las casas del núcleo sobre seis pies de DNA.

Considerando que tanto el material genético importante está cargado en un tan pequeño espacio, su orden y organización espacial deben estar apretado y regularon exacto. La pedido de la DNA nuclear ayuda a controlar se expresan qué genes--es decir, "ON" o "OFF" girado en un tipo específico de la célula--y la organización anormal de la DNA se asocia a un ordenador principal de enfermedades, incluyendo cáncer, enfermedades autoinmunes, desordenes de desarrollo, desordenes neuropsiquiátricos y muchas condiciones relativas a la edad.

Como otros proyectos financiados con el programa de 4D Nucleome, el centro para la investigación multimodal y de la Multi-Escala integrada de Nucleome, que será llevada por Bing Ren, doctorado, Universidad de California, San Diego (UCSD), intenta entender cómo los cambios en la organización nuclear de la DNA pueden contribuir en un cierto plazo al inicio y a la progresión de diversas enfermedades. La adquisición de una comprensión más completa de éstos cambia en un cierto plazo--consideraba la cuarta dimensión--habilitará la identificación de los nuevos objetivos para tratar un alcance de enfermedades.

Más concretamente, con esta nueva recompensa, las personas de investigadores trabajarán para desarrollar mapas navegables de la referencia de la configuración de la cromatina a través de los tipos múltiples de la célula encontrados en los cerebros de seres humanos y de varios tipos de modelos preclínicos.

El Dr. Hu llevará análisis de datos integrantes múltiples para entender mejor: cómo las acciones recíprocas entre los promotores y los reforzadores (series reguladoras del gen de la DNA) afectan a la expresión génica en la resolución unicelular; cómo los reguladores de la transcripción del gen, incluyendo reforzadores y promotores, controlan la expresión génica de una manera célula-tipo-específica; y cómo dar prioridad a genes del riesgo de la enfermedad en tipos enfermedad-relevantes de la célula. El Dr. Hu hará uso de varios tipos de datos, incluyendo multi-omics unicelular, proyección de imagen y grupos de datos genoma-anchos de la asociación.

Además de la clínica de Cleveland y del UCSD, otras instituciones participantes incluyen: Universidad de Harvard; Instituto del cerebro de Allen; Di Napoli “Frederico II” de Universita, Italia; Centro máximo de Delbrück para el remedio molecular, Berlín, Alemania; Instituto de Salk; y universidad de Washington, St. Louis.

De acuerdo con patrones de programa de 4D Nucleome, todos los mapas de las referencias del resultado, herramientas analíticas, métodos de la visualización y modelos estructurales serán compartidos libremente con la comunidad científica más amplia para ayudar a la traslación de la investigación de la velocidad. Mientras que es financiada por el fondo común de NIH, esta concesión (UM1HG011585) se administra a través del instituto de investigación nacional del genoma humano.