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Los científicos utilizan la nueva aproximación para trazar la extensión de las bacterias drogorresistentes del hospital

Los científicos han utilizado el genoma que ordenaba para revelar el fragmento al cual una bacteria gastrointestinal drogorresistente puede extenderse dentro de un hospital, destacando la cara de los hospitales del reto en infecciones que controlaban.

El faecium del enterococo es una bacteria encontrada común en el aparato gastrointestinal, donde reside generalmente sin causar los problemas del ordenador principal. Sin embargo, en pacientes immunocompromised, puede llevar a la infección potencialmente peligrosa para la vida.

Durante las tres décadas pasadas, las deformaciones han emergido que son resistentes a los antibióticos de la frente incluyendo la ampicilina y la vancomicina, limitando opciones del tratamiento - y preocupándose determinado, estas deformaciones son a menudo ésas encontradas en infecciones hospital-detectadas del faecium del E.

Las personas de científicos en la universidad de Cambridge y de la escuela de Londres de la higiene y el remedio tropical han promovido una aproximación combinando la información epidemiológica y genomic para trazar la extensión de bacterias dentro de fijaciones de la atención sanitaria. Esto ha ayudado a hospitales para determinar fuentes de la infección y para informar a medidas de control de la infección.

En un estudio publicado hoy en microbiología de la naturaleza, las personas han aplicado esta técnica a la extensión del faecium drogorresistente del E. en una fijación del hospital.

“Hemos sabido por más de dos décadas que los pacientes en hospital pueden coger y extender faecium drogorresistente del E. La prevención de su extensión nos requiere entender donde viven las bacterias - sus “depósitos” - y cómo se transmite.

La mayoría de los estudios hasta la fecha han confiado en cultivar las bacterias de muestras. Pero como hemos mostrado, la secuencia entera del genoma - observando la DNA de las bacterias - combinada con el paciente detallado y el muestreo ambiental puede ser una herramienta potente para ayudarnos a trazar su extensión y a informar a maneras de prevenir otros brotes.”

El Dr. Theodore Gouliouris, autor de la junta del estudio primer, departamento del remedio, universidad de Cambridge

Las personas siguieron a 149 pacientes de la hematología admitidos al hospital de Addenbrooke, confianza del asiento de NHS de los hospitales de la Universidad de Cambridge, durante un semestre. Recogieron muestras de taburete de los pacientes y de los lampazos del ambiente del hospital y los cultivaron para el faecium del E.

El análisis Genomic de las bacterias era mucho más efectivo en determinar faecium hospital-detectado del E.: los pacientes que podrían ser seguidos, análisis genomic de 101 determinaron que dos tercios de pacientes detectaron el faecium del E., comparado menos a que medio usando métodos de la cultura solamente.

Apenas bajo mitad (el 48%) de los lampazos tomados del ambiente del hospital eran positivo para el faecium vancomicina-resistente del E. Esto incluyó el 36% de aparatos médicos, el 76% de áreas del no-tacto tales como salidas de aire, el 41% de espacios de la base y el 68% de cuartos de baño comunales probados.

Los investigadores mostraron que incluso la limpieza profunda no podría suprimir las bacterias. El hospital emprendió la limpieza profunda en una sala durante un período de tres días durante el estudio, cuando movieron a los pacientes a otra parte; sin embargo, cuando las personas muestrearon situaciones antes de los pacientes que volvían a la sala, encontraron que el 9% de muestras todavía probaron el positivo para las bacterias. En el plazo de tres días de pacientes la vuelta a la sala, alrededor de la mitad de los sitios muestreados probó el positivo.

Tres cuartos (el 74%) de los pacientes (111/149) era ondas portadoras A1 del clade - una deformación resistente de la multi-droga del faecium del E. común - visto en hospitales que es resistente a la ampicilina antibiótico y que detecta con frecuencia resistencia a la vancomicina. De estos 111 pacientes, 67 tenían eslabones epidemiológicos y genomic fuertes con por lo menos otro paciente y/o su ambiente directo.

“El hecho de que estos casos fueran todos conectó a otro paciente o a su ambiente sugiere fuertemente que hubieran tomado las bacterias resistentes de la multi-droga mientras que en el hospital,” dijo al Dr. Francesc Coll de la escuela de Londres de la higiene y del remedio tropical, primer autor de la junta.

El análisis genomic adicional mostró que dentro de esta multi-droga la deformación resistente era varios subtipos (definidos por cómo es genético-similar eran). Sin embargo, no era infrecuente que un paciente lleve más de un subtipo, que - sin análisis genomic detallado - podría confundir tentativas de determinar la ruta de la transmisión de una infección.

Notablemente, a pesar de la circulación de tanto como 115 subtipos, los 28% de adquisiciones del faecium del E. fueron causados por apenas dos subtipos superspreading. Los autores no encontraron ninguna prueba de la resistencia o de la tolerancia a los desinfectantes comunes para explicar el éxito de estos subtipos.

Seis pacientes del estudio contrataron una “infección invasor”, significando que habían estado llevando faecium del E. asintomáticamente en su tripa, pero desarrollaron posteriormente una infección sintomática. Comparar los genomas de la infección y de la tripa se esfuerza a los autores determinados que las infecciones invasores del faecium del E. originaron de la propia tripa de los pacientes.

“Nuestros emplear del estudio observaciones anteriores que las deformaciones drogorresistentes del faecium del E. pueden persistir en el ambiente a pesar de la limpieza estándar - nosotros del hospital todavía fueron sorprendidos encontrar cómo es corto era el efecto de la limpieza profunda,” el Dr. adicional Gouliouris.

“Encontramos niveles del faecium hospital-adaptado del E. a pesar del uso de los productos y de los procedimientos de limpieza que han probado efectivo contra el fallo de funcionamiento. Destaca cómo desafiarlo puede ser abordar brotes en hospitales.”

Profesor mayor Sharon Peacock del autor del departamento del remedio en la universidad de Cambridge agregó: “Las altas tasas de la infección con faecium drogorresistente del E. en grupos pacientes vulnerables específicos y su capacidad de evadir dimensiones de limpieza plantean un reto importante al mando de la infección.”

Los “procedimientos perfeccionados y más frecuentes de la investigación paciente, de la disposición adecuada de las instalaciones de retrete del aislamiento y del ensuite, de limpieza, y prácticas más estrictas de la higiene del trabajador de la atención sanitaria todos serán necesarios acortar esta epidemia global.

“Solamente éste es también un signo de cómo necesitamos urgente abordar el uso inadecuado de antibióticos por todo el mundo, que se reconoce extensamente como planteamiento de una amenaza catastrófica para nuestra salud y nuestra capacidad de controlar infecciones.”

Source:
Journal reference:

Gouliouris, T., et al. (2020) Quantifying acquisition and transmission of Enterococcus faecium using genomic surveillance. Nature Microbiology. doi.org/10.1038/s41564-020-00806-7.