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L'étude examine la tige entre la charge SARS-CoV-2 génomique et les résultats du patient COVID-19

Une étude neuve publiée en ligne dans les annales de la société thoracique américaine examine si la quantité d'ARN ou de charge génomique, de SARS-CoV-2, trouvée dans des tests d'écouvillon des patients étant admis à l'hôpital avec la pneumonie virale est associée à un COVID-19 plus sévère.

SARS-CoV-2 est un virus qui entraîne COVID-19. Les études précédentes sur cette question ont eu des résultats contradictoires.

Dans la « association de la charge SARS-CoV-2 génomique avec les résultats COVID-19 patients, » Ioannis M. Zacharioudakis, DM, spécialiste des maladies infectieuses au service de médecine à l'École de Médecine de Grossman d'université de New York, et co-auteurs ont regardé les dossiers médicaux de 314 patients qui sont venus au service des urgences de santé de NYU Langone entre le 31 mars et au 10 avril 2020, diagnostiqués avec COVID-19 sur un test diagnostique moléculaire (de RT-PCR) qui a également eu la pneumonie virale assez sérieuse pour exiger l'hospitalisation.

Cette recherche a été conduite comme étude de cohorte rétrospective ; un qui suit les anciens patients qui ont eu des caractéristiques courantes.

« Nous avons expliqué que pour des patients admis à l'hôpital avec la pneumonie COVID-19, la charge SARS-CoV-2, comme réfléchie par la valeur de seuil de cycle (Ct) de l'ACP, devrait être regardée en tant que facteur prédictif des effets nuisibles, » avons dit M. Zacharioudakis.

« La charge virale élevée s'est avérée un facteur prédictif des résultats faibles bien au-delà d'âge, toute autre problèmes médicaux et gravité de la maladie sur l'exposé, témoin qu'elle peut être employée risque-pour stratifier, ou sélection, patients. »

Les tests inverses en temps réel de réaction en chaîne de transcriptase-polymérase (RT-PCR) pour SARS-CoV-2 sont la classe la plus précise d'aujourd'hui procurable de tests de COVID, et ils peuvent échantillonner et analyser la quantité la plus grande de matériel génétique, même aux étapes presymptomatic de la maladie.

Dans cette étude, des échantillons respiratoires qui se sont analysés par technologie de RT-PCR ont été recueillis des patients à l'aide des écouvillons nasopharyngaux, les longs écouvillons qui sont très utilisés dans des réglages de santé ainsi qu'aux sites de contrôle publics.

Une valeur de seuil de cycle est l'un des résultats que la technique d'ACP donne et peut être employée en tant que substitut de la quantité de virus qui est trouvé sur les écouvillons nasopharyngaux. Puisque la valeur de Ct est obtenue sur la plupart de RT-PCR commercial vérifiant des plates-formes, elle peut s'avérer un outil facilement disponible au fournisseur aider risque-à stratifier et aux patients de sélection admis à l'hôpital avec la pneumonie COVID-19.

Les chercheurs ont déterminé que les points finaux d'étude comprendraient si une ventilation artificielle exigée patiente ou une oxygénation extracorporelle de membrane (ECMO) et si le patient est mort tandis que dans l'hôpital ou a été rebuté à l'hospice.

Des calculs statistiques ont été faits pour déterminer comment fréquemment les points finaux ont été atteints par les patients qui ont eu le haut contre la charge virale inférieure après réglage aux conditions de Co-occurrence des patients (comorbidités) utilisant l'index de comorbidité de Charlson et la façon dont sévère la pneumonie était au moment d'exposé, suivant les indications de l'index de gravité de pneumonie.

Nous savons que le virus se multiplie rapidement pendant les phases symptomatiques asymptomatiques et tôt de COVID-19. Notre étude est en accord avec cette conclusion, comme indiqué par notre conclusion d'une charge virale plus élevée dans les patients qui se sont présentés plus tôt dans la maladie. »

Ioannis M. Zacharioudakis, DM, spécialiste des maladies infectieuses, service de médecine, École de Médecine de Grossman d'université de New York

Il a ajouté : « L'étude a également constaté que les patients qui ont eu multiple comorbid révise, comme la cardiopathie, le diabète et le cancer ; ou qui étaient immunodéprimé dû à la greffe d'organe solide ; étaient pour avoir une charge SARS-CoV-2 plus élevée à l'admission au hôpital et comme résultat un risque accru pour des résultats faibles. »

Une caractéristique importante de cette étude était qu'elle s'est concentrée sur les patients qui ont eu besoin de l'admission à l'hôpital pour la pneumonie COVID-19, un groupe qui est au haut risque pour la maladie grave ou la mort.

Le fait que l'association de la charge virale élevée avec des résultats patients faibles est demeurée après compte tenu des conditions étant à la base des patients, combien de temps ils étaient en difficulté avant de venir à l'hôpital et comment le malade ils étaient alors eux a présenté ajoute la preuve précieuse qui explique la capacité de la charge virale SARS-CoV-2 de prévoir des résultats de COVID.

Les auteurs notent que, parmi des patients présentant une présentation clinique sévère, ceux avec une charge virale du haut SARS-CoV-2 étaient presque deux fois aussi pour obtenir intubated ou mourir.

M. Zacharioudakis ajouté, « notre étude fournit une justification pour l'usage de la charge du SARS-CoV-2 des patients au moment de l'admission au hôpital pour évaluer leur risque d'effets nuisibles. Dans une ère quand la disponibilité d'efficace prouvé de traitements antiviraux contre COVID pourrait être limitée et la capacité pour la surveillance intensive est finie, il est de l'importance extrême à pouvoir donner la priorité aux patients qui bénéficieront les la plupart du traitement précoce ou un de plus haut niveau des soins. D'autres études sont nécessaires pour évaluer si une diminution de la charge virale des patients hospitalisés avec COVID-19, qui peut ou ne peut être traité avec des traitements antiviraux tels que Remdesivir, la corrélation avec une amélioration d'état clinique. »

Source:
Journal reference:

Zacharioudakis, I. M., et al. (2020) Association of SARS-CoV-2 Genomic Load with COVID-19 Patient Outcomes. Annals of the American Thoracic Society. doi.org/10.1513/AnnalsATS.202008-931RL.