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L'étude peut aider à développer des traitements efficaces contre COVID-19

Les scientifiques à l'université de Cambridge, en collaboration avec l'université de Justus-Liebig, l'Allemagne, ont découvert comment le génome de SARS-CoV-2 - le coronavirus qui entraîne COVID-19 - origami de génome d'utilisations pour infecter et reproduire avec succès les cellules hôte intérieures.

Ceci pourrait aviser le développement des traitements efficaces qui visent les parties spécifiques du génome viral, dans le combat contre COVID-19.

SARS-CoV-2 est l'un de beaucoup de coronaviruses. Tous partagent la caractéristique de avoir le plus grand génome monocatenaire d'ARN en nature.

Ce génome contient tout le code génétique que le virus doit produire des protéines, éluder le système immunitaire et la réplique à l'intérieur du corps humain. Beaucoup de cette information est contenue dans la structure 3D adoptée par ce génome d'ARN quand il infecte des cellules.

Les chercheurs disent que la plupart de travail actuel trouver des médicaments et des vaccins pour COVID-19 est concentrée sur viser les protéines du virus. Puisque la forme de la molécule d'ARN est critique à son fonctionnement, la désignation d'objectifs de l'ARN directement avec des médicaments pour perturber sa structure bloquerait le cycle de vie et arrêterait le virus reproduisant.

Dans aujourd'hui publié d'étude dans la cellule moléculaire de tourillon, l'équipe a découvert la structure entière du génome SARS-CoV-2 à l'intérieur de la cellule hôte, indiquant un réseau des interactions de RNA-RNA enjambant les parties très longues du génome.

Différentes parties fonctionnelles le long de la nécessité de génome de fonctionner ensemble en dépit de la distance grande entre elles, et les expositions structurelles neuves de caractéristiques comment ceci est accompli pour activer la maladie de durée et de cause de vie utile de coronavirus.

Le génome d'ARN des coronaviruses est environ trois fois plus grand qu'un génome moyen d'ARN viral - il est énorme. »

M. Omer Ziv, auteur important d'étude, confiance de Wellcome/institut BRITANNIQUE Gurdon de cancérologie, université de Cambridge

Il a ajouté : Les « chercheurs précédemment proposés qui les interactions interurbaines le long des génomes de coronavirus sont critiques pour leur réplication et pour produire les protéines virales, mais jusque récemment nous n'avons pas eu les outils droits pour tracer ces interactions entièrement. Maintenant que nous comprenons ce réseau de connectivité, nous pouvons commencer à concevoir des voies de le viser effectivement avec la thérapeutique. »

En toutes les cellules le génome retient l'indicatif pour la production des protéines spécifiques, qui sont effectuées quand une machine moléculaire appelée un ribosome fonctionne le long de l'ARN indiquant l'indicatif jusqu'à ce qu'un « signe d'arrêt » l'indique mettre fin.

Dans les coronaviruses, il y a un endroit spécial où le ribosome arrête seulement 50% des temps devant le signe d'arrêt. Dans l'autre 50% de cas, une seule forme d'ARN effectue le ribosome sauter par-dessus le signe d'arrêt et produire les protéines virales complémentaires.

Par la cartographie cette l'ARN structure et les interactions à longue portée impliquées, la recherche neuve découvre les stratégies par lesquelles les coronaviruses produisent leurs protéines pour manipuler nos cellules.

« Nous prouvons que les interactions se produisent entre les parties de l'ARN SARS-CoV-2 qui sont très des longues distances à part, et nous pouvons surveiller ces interactions car elles se produisent pendant la réplication SARS-CoV-2 tôt, » avons dit M. Lyudmila Shalamova, un chercheur de Co-fil à l'université de Justus-Liebig, Allemagne.

M. Jon Price, un associé post-doctoral à l'institut de Gurdon et au Co-fil de cette étude, a développé un libre, hébergement de sites web interactif d'ouvert-accès la structure entière d'ARN de SARS-CoV-2. Ceci permettra à des chercheurs dans le monde entier d'employer les caractéristiques neuves dans le développement des médicaments pour viser des régions spécifiques du génome de l'ARN du virus.

Le génome de la plupart des virus humains est fait d'ARN plutôt que l'ADN. Ziv a développé des méthodes pour vérifier de telles interactions à longue portée en travers des génomes d'ARN viral à l'intérieur des cellules hôte, dans le travail pour comprendre le génome viral de Zika. Ceci a prouvé une base méthodologique précieuse pour comprendre SARS-CoV-2.

Source:
Journal reference:

Ziv, O., et al. (2020) The short- and long-range RNA-RNA Interactome of SARS-CoV-2. Molecular Cell. doi.org/10.1016/j.molcel.2020.11.004.