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O estudo pode ajudar a desenvolver drogas eficazes contra COVID-19

Os cientistas na universidade de Cambridge, em colaboração com a universidade de Justus-Liebig, Alemanha, descobriram como o genoma de SARS-CoV-2 - o coronavirus que causa COVID-19 - origâmi do genoma dos usos para contaminar com sucesso e replicate pilhas de anfitrião internas.

Isto podia informar a revelação de drogas eficazes que as peças específicas do alvo do genoma do vírus, na luta contra COVID-19.

SARS-CoV-2 é um de muitos coronaviruses. Todos compartilham da característica de ter o genoma único-encalhado o maior do RNA na natureza.

Este genoma contem todo o código que genético o vírus precisa de produzir proteínas, para iludir o sistema imunitário e o replicate dentro do corpo humano. Muita dessa informação está contida na estrutura 3D adotada por este genoma do RNA quando contamina pilhas.

Os pesquisadores dizem que a maioria de trabalho actual encontrar drogas e vacinas para COVID-19 está centrado sobre a escolha de objectivos das proteínas do vírus. Porque a forma da molécula do RNA é crítica a sua função, visar o RNA directamente com drogas para interromper sua estrutura obstruiria o ciclo de vida e pararia o vírus que replicating.

Em um estudo publicado hoje na pilha molecular do jornal, a equipe descobriu a estrutura inteira do genoma SARS-CoV-2 dentro da pilha de anfitrião, revelando uma rede das interacções de RNA-RNA que medem secções muito longas do genoma.

Partes funcionais diferentes ao longo da necessidade do genoma de trabalhar junto apesar da grande distância entre elas, e as mostras estruturais novas dos dados como isto é realizado para permitir a doença do ciclo e da causa de vida do coronavirus.

O genoma do RNA dos coronaviruses é aproximadamente três vezes mais grande do que um genoma viral médio do RNA - é enorme.”

Dr. Omer Ziv, autor principal do estudo, confiança de Wellcome/instituto BRITÂNICO Gurdon da investigação do cancro, universidade de Cambridge

Adicionou: Os “pesquisadores propor previamente que as interacções interurbanas ao longo dos genomas do coronavirus fossem críticas para sua réplica e para produzir as proteínas virais, mas até recentemente nós não tivemos as ferramentas direitas para traçar completamente estas interacções. Agora que nós compreendemos esta rede da conectividade, nós podemos começar projetar maneiras de visá-la eficazmente com terapêutica.”

Em todas as pilhas o genoma guardara o código para a produção de proteínas específicas, que estão feitas quando uma máquina molecular chamou um ribosome é executado ao longo do RNA que lê o código até que da “um sinal parada” o diga para terminar.

Nos coronaviruses, há um ponto especial onde o ribosome pare somente 50% dos tempos na frente do sinal da parada. No outro 50% dos casos, uma forma original do RNA faz o ribosome saltar sobre o sinal da parada e produzir proteínas virais adicionais.

Traçando esta estrutura do RNA e as interacções de longo alcance envolvidas, a pesquisa nova descobre as estratégias por que os coronaviruses produzem suas proteínas para manipular nossas pilhas.

“Nós mostramos que as interacções ocorrem entre as secções do RNA SARS-CoV-2 que estão a umas distâncias muito longas distante, e nós podemos monitorar estas interacções como ocorrem durante a réplica SARS-CoV-2 adiantada,” dissemos o Dr. Lyudmila Shalamova, um investigador do co-chumbo na universidade de Justus-Liebig, Alemanha.

O Dr. Jon Preço, um associado pos-doctoral no instituto de Gurdon e no co-chumbo deste estudo, desenvolveu um livre, Web site interactivo do aberto-acesso hospedando a estrutura inteira do RNA de SARS-CoV-2. Isto permitirá pesquisadores no mundo inteiro de usar os dados novos na revelação das drogas para visar regiões específicas do genoma do RNA do vírus.

O genoma da maioria de vírus humanos é feito do RNA um pouco do que o ADN. Ziv desenvolveu métodos para investigar tais interacções de longo alcance através dos genomas virais do RNA dentro das pilhas de anfitrião, no trabalho para compreender o genoma do vírus de Zika. Isto provou uma base metodológica valiosa para compreender SARS-CoV-2.

Source:
Journal reference:

Ziv, O., et al. (2020) The short- and long-range RNA-RNA Interactome of SARS-CoV-2. Molecular Cell. doi.org/10.1016/j.molcel.2020.11.004.