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La méthode iscan d'expositions d'étude a pu être efficace pour le contrôle COVID-19 rapide

Un kit d'essai COVID-19 simple combine l'amplification de virus avec un système de CRISPR-CAS pour le dépistage SARS-CoV-2 efficace. Le nécessaire, iSCAN appelé, emploie les réactifs qui peuvent être localement fabriqués.

Notre procédure entière d'iSCAN peut être remplie en moins d'une heure et peut être facilement adoptée comme système de dépistage de remarque-de-soins aux aéroports et aux bordures. »

Ahmed Mahas, stagiaire de PhD, le Roi Abdullah University de la Science et de la technologie

L'étalon-or actuel dans le contrôle SARS-CoV-2 est le test d'ACP, dans lequel les amorces d'ADN identifient les séquences d'ARN spécifiques dans le génome viral qui sont alors copiées utilisant une enzyme spécifique.

Ce procédé de « amplification » le facilite pour trouver initialement les petites quantités d'ARN viral actuel dans les écouvillons nasopharyngaux pris des patients.

Ce test peut sûrement trouver si une personne a réellement le virus sans fournir trop de faux positif ou de résultats négatifs. Mais il a besoin de personnel hautement qualifié pour effectuer le test, qui est fait dans des opérations multiples dans les laboratoires centraux avec le matériel sophistiqué.

l'iSCAN, développé par une équipe aboutie par le bioengineer Magdy Mahfouz de KAUST surmonte plusieurs des désavantages du test d'ACP tout en fournissant des résultats relativement dignes de confiance.

De manière significative, les réactifs du test étaient manufacturés à KAUST. Ceci comprend les enzymes requises pour une amplification et une enzyme différente qui trouve particulièrement des séquences virales dans le matériau copié. La disponibilité des réactifs et du matériel a été un obstacle énorme depuis le début de la pandémie COVID-19.

Pour employer l'iSCAN, les teneurs de l'échantillon d'un patient, rassemblé avec un écouvillon nasopharyngal, sont mis dans une petite éprouvette contenant les amorces et les enzymes d'ADN qui peuvent amplifier le matériel génétique SARS-CoV-2. Les teneurs sont incubés à une température de 62 degrés Celsius pour une demi-heure. Ce procédé désigné sous le nom de RT-LAMP.

Une fois qu'assez d'ARN viral est amplifié, une gouttelette contenant l'enzyme Cas12 est ajoutée au mélange et est partie pendant encore 15 mn. Cette enzyme identifie seulement l'ARN viral appartenant à SARS-CoV-2, surmontant une édition avec RT-LAMP, où l'amplification et la contamination transversale trompeuses peuvent être un problème.

En conclusion, une de deux méthodes peut être employée pour concevoir le résultat. On concerne le rayonnement ultraviolet brillant sur l'échantillon, d'un détecteur analysant la lumière sortant de lui pour enregistrer la quantité d'ARN viral.

L'autre approche concerne insérer les filets particulièrement conçus dans les tubes, assimilés à ceux utilisés dans des tests de grossesse. Les deux approches fonctionnent bien, bien que la méthode de rayonnement ultraviolet ait fourni plus de résultats exacts.

Les scientifiques ont vérifié leur nécessaire sur l'ARN viral synthétisé et sur les échantillons patients réels. « Nous sommes maintenant s'améliorants et simplifiant notre système pour des usagers afin de commercialiser notre nécessaire de dépistage d'iSCAN, » dit le scientifique Zahir Ali de recherches de KAUST.

Source:
Journal reference:

Ali, Z., et al. (2020) iSCAN: An RT-LAMP-coupled CRISPR-Cas12 module for rapid, sensitive detection of SARS-CoV-2. Virus Research. doi.org/10.1016/j.virusres.2020.198129.