Avertissement : Cette page est une traduction automatique de cette page à l'origine en anglais. Veuillez noter puisque les traductions sont générées par des machines, pas tous les traduction sera parfaite. Ce site Web et ses pages Web sont destinés à être lus en anglais. Toute traduction de ce site et de ses pages Web peut être imprécis et inexacte, en tout ou en partie. Cette traduction est fournie dans une pratique.

Le meilleur de l'ARN SARS-CoV-2 préservé en eaux usées sous la congélation révise

Le contrôle d'eaux usées a été rapporté pour être un faisable et un moyen efficace pour surveiller la prévalence du coronavirus 2 (SARS-CoV-2) de syndrôme respiratoire aigu sévère dans la pandémie du courant COVID-19. Une étude récente appelle l'attention sur la nécessité de geler des échantillons d'eaux usées si l'analyse est effectuée plus tard plutôt qu'immédiatement.

L'analyse d'eaux usées est non seulement un outil de surveillance utile pour que la prévalence actuelle mais les aides prévoient de futures manifestations tôt par une augmentation d'avertissement des comptes d'eaux usées du virus. Une telle analyse a également mené au traçage du virus à sa apparition dans plusieurs des villes du monde. En fait, beaucoup d'états ont déjà tracé SARS-CoV-2 dans beaucoup d'emplacement mondial avant les premiers états de Wuhan, Chine.

Ceci mène aux tentatives intensives de recenser l'emplacement où le virus a effectué sa apparition. Actuellement, des échantillons enregistrés peuvent s'analyser en tant que moyens de contrôle d'eaux usées deviennent plus facilement disponibles. Cependant, onde actuelle de la pandémie la deuxième peut rendre nécessaire d'autres restrictions, qui pourraient de nouveau retarder l'analyse d'échantillon.

Le choc des conditions de stockage sur les résultats du contrôle est un paramètre important que les aides déterminent la fiabilité de tests. Dorénavant, l'information directe sur la persistance du virus dans les échantillons enregistrés d'eaux usées est procurable seulement pour les températures entre 4°C et les études 37°C. sur d'autres coronaviruses ont ajouté l'information relative.

L'étude actuelle, publiée dans le medRxiv* de serveur de prétirage en novembre 2020, présente une solution au retard fréquent à traiter des parties aliquotes d'eaux usées pendant le COVID-19. Les raisons d'un tel délai sont conduite, s'échelonnant du manque du personnel, de la fermeture des laboratoires, du manque de réactifs et de labware, et d'une compréhension faible des meilleures techniques. Pour cette raison, il a souvent été nécessaire d'enregistrer les échantillons pour l'analyse postérieure.

Cette étude est la première étude finlandaise conçue pour trouver SARS-CoV-2 en eaux usées municipales. Son objectif était de découvrir la stabilité de l'ARN SARS-CoV-2 dans les températures plus froides. Ceci aiderait à évaluer l'exactitude des résultats dans beaucoup d'études d'eaux usées déjà publiées.

Les chercheurs avaient l'habitude une analyse de qPCR d'E-Sarbeco droite pour mesurer le titre du gène d'enveloppe de radar à ouverture synthétique, et l'analyse de N2 pour le gène du nucleocapsid SARS-CoV-2 au fil du temps. Les échantillons d'eaux usées examinés avaient été enregistrés à 4ᴼC, à -20ᴼC, et à -75ᴼC.

La centrale de traitement des eaux résiduaires échantillonnée était la centrale de Viikinmaki qui sert 860.000 personnes dans huit municipalités. Des échantillons affluants ont été prélevés avant n'importe quelle demande de règlement, dans un récipient de 20 litres, étant pris des eaux à traiter composées rassemblées plus de 24 heures. L'échantillon de 20 litres a été enregistré à 6°C, et aux autres échantillons de 5 et 2 litres à deux remarques différentes de temps, pour atteindre le laboratoire dans un délai de 26 heures. Les petits échantillons ont été alors divisés en parties aliquotes de 30 ml et maintenus à 4°C, à -20°C, et à -75°C jusqu'à ce qu'ils aient été vérifiés.

Pendant les 28 premiers jours, le numéro de copie d'ARN a disparu en raison immesuré d'un manque de la méthodologie exigée pour l'analyse. La quantité a été prise pour être assimilée à la mesure assurée le premier mois du stockage dans le rhume, dans un autre échantillon rassemblé après 5 semaines.

La courbure de délabrement de la pointe SARS-CoV-2 (log10 copie 100 ml-1) dans des eaux à traiter d
La courbure de délabrement de la pointe SARS-CoV-2 (log10 copie 100 ml-1) dans des eaux à traiter d'eaux usées à 4°C, -20°C, et - 75°C, énuméré avec des analyses d'E-Sarbeco et de N2 Droite-qPCR.

Entre 29 et 84 jours, les chercheurs ont constaté que dans toutes ces conditions, l'ARN viral est resté presque stable. Ce contrastait avec la 1 réduction de log en ARN du norovirus GII au cours de cette période. Ceci prouve que les virus non-enveloppés ne persistent pas toujours pendant de plus longues durées dans le rhume, comme a été précédemment pensé.

Utilisant l'analyse d'E-Sarbeco, les chercheurs ont observé les montants assimilés d'ARN indépendamment de la température de stockage, avec une tendance vers le dépistage des quantités plus élevées d'ARN viral aux températures de congélation. À 4°C, il y avait un délabrement linéaire dans le numéro de copie d'ARN pour les objectifs de gène trouvés par les deux analyses plus de 21 jours.

L'analyse de N2 a montré un délabrement sensiblement plus grand à 4°C. Ceci propose que les gènes de nucleocapsid et d'enveloppe aient des régimes différentiels du délabrement. Cependant, davantage d'étude est requise comprendre la stabilité de différents gènes de borne exigés pour le contrôle SARS-CoV-2 en eaux usées.

Aux températures de congélation, -20°C et -75°C, l'ARN compte dans les eaux usées affluantes est resté intact plus de 58 jours. Les résultats ont été validés en ajoutant un échantillon nasopharyngal d'écouvillon d'un patient COVID-19, dans la dilution, aux eaux à traiter d'eaux usées. L'échantillon de SARS-CoV-2-spiked a contenu le teneur stable d'ARN plus de 28 et 58 jours, le premier dans réfrigéré et le deuxième dans des conditions de congélation.

Tandis que la cause déterminante principale de l'inactivation virale est la température de stockage, d'autres facteurs qui peuvent faire comprendre un impact important la présence et la quantité de question organique et si d'autres microbes sont présents.

Il y a également un besoin de trouver des titres inférieurs d'ARN viral dans les eaux usées, qui exigent l'échantillonnage de haute qualité et efficace, préservant, et traitant des procédures. C'est particulièrement essentiel étant donné que les virus précédemment examinés en eaux usées ont été les virus non-enveloppés, alors que SARS-CoV-2 est enveloppé.

De nouveau, la fraction de l'échantillon auquel le virus est associé devrait être définitivement recensée par plus de recherche, si dans les boulettes dans l'ultrafiltrat d'eaux usées avant centrifugation ou eau question question particulaire fractionnez. L'étude actuelle a trouvé des quantités d'ARN viral légèrement plus élevées dans l'ancien, peut-être à cause de l'enveloppe virale. De la recherche récente, en effet, propose l'utilisation de la boue d'eaux usées pour la détection du virus.

Cette étude est importante dans la fourniture des caractéristiques qui peuvent développer des protocoles fiables pour le contrôle d'eaux usées en épidémiologie COVID-19.

Les chercheurs concluent, « L'ARN SARS-CoV-2 ont semblé étonnant stables dans ces températures de stockage froides plus de 29, 64, et 84 jours, » à 4°C, à -20°C, et à -75°C. Ainsi, si l'analyse immédiate est impossible, ces températures devraient être préférées pour le stockage.

Avis *Important

le medRxiv publie les états scientifiques préliminaires qui pair-ne sont pas observés et ne devraient pas, en conséquence, être considérés comme concluants, guident la pratique clinique/comportement relatif à la santé, ou traité en tant qu'information déterminée.

Journal reference:
Dr. Liji Thomas

Written by

Dr. Liji Thomas

Dr. Liji Thomas is an OB-GYN, who graduated from the Government Medical College, University of Calicut, Kerala, in 2001. Liji practiced as a full-time consultant in obstetrics/gynecology in a private hospital for a few years following her graduation. She has counseled hundreds of patients facing issues from pregnancy-related problems and infertility, and has been in charge of over 2,000 deliveries, striving always to achieve a normal delivery rather than operative.

Citations

Please use one of the following formats to cite this article in your essay, paper or report:

  • APA

    Thomas, Liji. (2020, November 24). Le meilleur de l'ARN SARS-CoV-2 préservé en eaux usées sous la congélation révise. News-Medical. Retrieved on May 10, 2021 from https://www.news-medical.net/news/20201124/SARS-CoV-2-RNA-best-preserved-in-wastewater-under-freezing-conditions.aspx.

  • MLA

    Thomas, Liji. "Le meilleur de l'ARN SARS-CoV-2 préservé en eaux usées sous la congélation révise". News-Medical. 10 May 2021. <https://www.news-medical.net/news/20201124/SARS-CoV-2-RNA-best-preserved-in-wastewater-under-freezing-conditions.aspx>.

  • Chicago

    Thomas, Liji. "Le meilleur de l'ARN SARS-CoV-2 préservé en eaux usées sous la congélation révise". News-Medical. https://www.news-medical.net/news/20201124/SARS-CoV-2-RNA-best-preserved-in-wastewater-under-freezing-conditions.aspx. (accessed May 10, 2021).

  • Harvard

    Thomas, Liji. 2020. Le meilleur de l'ARN SARS-CoV-2 préservé en eaux usées sous la congélation révise. News-Medical, viewed 10 May 2021, https://www.news-medical.net/news/20201124/SARS-CoV-2-RNA-best-preserved-in-wastewater-under-freezing-conditions.aspx.