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La méthode neuve a pu aider à déterminer la plupart de traitement adapté pour des patients de VIH

Une équipe dirigée par Co par un scientifique à l'Université de Californie, rive, a développé une méthode pour étudier comment le VIH subit une mutation pour échapper au système immunitaire dans les personnes multiples, qui pourraient aviser le modèle vaccinique de VIH.

Le VIH, qui peut mener au SIDA, évolue rapidement et attaque le système immunitaire de l'organisme. Les mutations génétiques dans le virus peuvent l'empêcher d'être éliminée par le système immunitaire. Tandis qu'il n'y a aucun traitement efficace pour le virus actuellement disponible, il peut être réglé avec le médicament.

La « compréhension des gestionnaires génétiques de la maladie est importante en sciences biomédicales, » a dit John P. Barton, un professeur adjoint de la physique et l'astronomie à UCR, qui dirigé par Co l'étude avec Matthew R. McKay, un professeur d'électronique et ingénierie informatique et bureau d'études chimique et biologique à l'Université Polytechnique de Hong Kong. « Pouvoir recenser les réarrangements génomiques est principal à comprendre comment les maladies se produisent et comment les traiter. »

Barton a expliqué que les exemples notables des gestionnaires génétiques de la maladie comprennent les mutations qui permettent à des virus de s'échapper du contrôle immunisé, alors que d'autres s'entretiennent résistance au médicament aux bactéries.

« Il peut être difficile, cependant, pour différencier entre réel, mutations adaptatives et variation génétique faite au hasard, » il a ajouté. « La méthode neuve que nous avons développée nous permet de recenser de telles mutations dans les populations en évolution complexes. »

Histoire évolutionnaire, il a ajouté, contient l'information au sujet dont les mutations affectent la survie et de laquelle réfléchissez simplement la variation faite au hasard.

« Cependant, il est de calcul difficile d'extraire cette information des caractéristiques, » il a dit. « Nous avions l'habitude des méthodes de la physique statistique pour surmonter ce défi de calcul. Notre méthode peut être appliquée généralement aux populations en évolution et n'est pas limitée au VIH. »

McKay a expliqué la méthode neuve fournit des moyens d'impliquer efficacement le choix des observations des histoires évolutionnaires complexes.

Il nous permet de trier que les altérations génétiques fournissent un avantage évolutionnaire de ceux qui n'offrent aucun avantage ou ont un effet délétère, » qu'il a dit. « La méthode est tout à fait générale et pourrait être potentiellement employée pour étudier de divers processus évolutifs, tels que l'évolution de la résistance au médicament des agents pathogènes et l'évolution des cancers. L'exactitude et la haute performance de notre approche activent l'analyse du choix dans les systèmes évolutionnaires complexes qui étaient hors d'atteinte des méthodes existantes. »

Matthew R. McKay, professeur d'électronique et ingénierie informatique et bureau d'études chimique et biologique, Université Polytechnique de Hong Kong

Quelques maladies réputées qui ont connu des origines génétiques sont mucoviscidose, drépanocytose, dystrophie musculaire de Duchenne, colorblindness, et maladie de Huntington.

« Dans le cas du VIH, une compréhension des mutations génétiques qui mènent à la résistance de VIH pourrait aider des chercheurs à déterminer la plupart de traitement adapté pour des patients, » Barton a dit. « Notre approche n'est pas limitée au VIH, mais il y a quelques raisons pour lesquelles nous nous sommes concentrés sur le VIH comme système de test. Le VIH est hautement mutable et génétiquement divers. Il subit une mutation également chez des êtres humains pour s'échapper du système immunitaire. La compréhension des détails de la façon dont le VIH évolue pourrait pour cette raison aider à développer de meilleures demandes de règlement contre le virus. »

Source:
Journal reference:

Sohail, M. S., et al. (2020) MPL resolves genetic linkage in fitness inference from complex evolutionary histories. Nature Biotechnology. doi.org/10.1038/s41587-020-0737-3.