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El nuevo método podía ayudar a determinar el tratamiento más apropiado para los pacientes de VIH

Las personas co-llevadas por un científico en la Universidad de California, orilla, han desarrollado un método para estudiar cómo el VIH se transforma para escape el sistema inmune en los individuos múltiples, que podrían informar a diseño vaccíneo del VIH.

El VIH, que puede llevar al SIDA, se desarrolla rápidamente y ataca el sistema inmune de la carrocería. Las mutaciones genéticas en el virus pueden evitar que sea eliminado por el sistema inmune. Mientras que no hay vulcanización efectiva para el virus actualmente disponible, puede ser controlado con la medicación.

La “comprensión de los impulsores genéticos de la enfermedad es importante en las ciencias biomédicas,” dijo a Juan P. Barton, profesor adjunto de la física y astronomía en UCR, que co-llevó el estudio con Matthew R. McKay, profesor de electrónico y ingeniería informática e ingeniería química y biológica en la universidad de ciencia y tecnología de Hong Kong. El “poder determinar los cambios genomic es dominante a entender cómo ocurren las enfermedades y cómo tratarlos.”

Barton explicó que los ejemplos notables de impulsores genéticos de la enfermedad incluyen las mutaciones que permiten que los virus escape de mando inmune, mientras que consultan otras resistencia a los medicamentos a las bacterias.

“Puede ser difícil, sin embargo, distinguir entre real, mutaciones adaptantes y variación genética al azar,” él agregó. “El nuevo método que desarrollamos permite que determinemos tales mutaciones en poblaciones de desarrollo complejas.”

Historia evolutiva, él agregó, contiene la información sobre la cual las mutaciones afectan a supervivencia y la cual refleje simple la variación al azar.

“Sin embargo, es de cómputo difícil extraer esta información de datos,” él dijo. “Utilizamos métodos de la física estadística para vencer este reto de cómputo. Nuestro método se puede aplicar generalmente a las poblaciones de desarrollo y no se limita al VIH.”

McKay explicó el nuevo método ofrece medios de deducir eficientemente la selección de observaciones de historias evolutivas complejas.

Nos permite arreglar que los cambios genéticos ofrezcan una ventaja evolutiva de los que no ofrezcan ninguna ventaja ni tengan un efecto perjudicial,” que él dijo. “El método es muy general y se podría potencialmente utilizar para estudiar procesos evolutivos diversos, tales como la evolución de la resistencia a los medicamentos de patógeno y la evolución de cánceres. La exactitud y la eficacia alta de nuestra aproximación habilitan el análisis de la selección en los sistemas evolutivos complejos que estaban fuera del alcance de métodos existentes.”

Matthew R. McKay, profesor de electrónico y ingeniería informática e ingeniería química y biológica, universidad de ciencia y tecnología de Hong Kong

Algunas enfermedades bien conocidas que han conocido causas genéticas son fibrosis quística, anemia de la célula falciforme, distrofia muscular de Duchenne, colorblindness, y la enfermedad de Huntington.

“En el caso del VIH, una comprensión de las mutaciones genéticas que llevan a la resistencia del VIH podría ayudar a investigadores a determinar el tratamiento más apropiado para los pacientes,” Barton dijo. “Nuestra aproximación no se limita al VIH, pero hay algunas razones por las que nos centramos en el VIH como sistema de prueba. El VIH es altamente mutable y genético diverso. También se transforma dentro de seres humanos para escape del sistema inmune. La comprensión de los detalles de cómo el VIH se desarrolla podría por lo tanto ayudar a desarrollar mejores tratamientos contra el virus.”

Source:
Journal reference:

Sohail, M. S., et al. (2020) MPL resolves genetic linkage in fitness inference from complex evolutionary histories. Nature Biotechnology. doi.org/10.1038/s41587-020-0737-3.