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Una sottospecie del mutante SARS-CoV-2 dai visoni può eludere la rilevazione dell'anticorpo

Nella ricerca recente una lettera ha pubblicato sul " server " della pubblicazione preliminare del bioRxiv*, gli scienziati dal Giappone hanno scoperto che la mutazione della glicoproteina della punta nel coronavirus 2 (SARS-CoV-2) di sindrome respiratorio acuto severo derivato dai visoni coltivati può anche essere trovata nel gruppo di persone con la malattia di coronavirus (COVID-19) e successivamente eludere la rilevazione dal nostro sistema immunitario.

Ora siamo informato buono che i visoni ed i furetti possono essere infettati facilmente con SARS-CoV-2 e che tenere i visoni coltivati in un ambiente ad alta densità può richiedere la proliferazione SARS-CoV-2. Ciò può conseguentemente selezionare i mutanti virali con la tendenza a compromettere l'efficacia delle droghe potenziali e dei candidati vaccino contro COVID-19.

Tale selezione naturale “adattamento„ in SARS-CoV-2 può sorgere durante l'amplificazione di coronavirus in visoni coltivati introducendo le mutazioni non specifiche per il ciclo virale in esseri umani. Ancora, l'infezione con uno sforzo mutante specifico di SARS-CoV-2 dai visoni coltivati - conosciuti come Y453F - può ampiamente essere sparso fra gli esseri umani.

Più specificamente, questo sforzo harbors la mutazione Y453F dell'amminoacido nella sequenza che codifica la glicoproteina della punta ed è stata trovata in circa 300 sequenze virali isolate dagli esseri umani nei Paesi Bassi ed intorno ad Europa, ma anche in visoni.

Ecco perché un gruppo di ricerca piombo da Dott. Takuma Hayashi dal centro medico di Kyoto di organizzazione dell'ospedale e dall'agenzia nazionali di scienza e tecnologia del Giappone a Tokyo, decisiva per studiare le caratteristiche virologic del mutante suddetto SARS-CoV-2 con l'uso di analisi strutturale della proteina tridimensionale.

L'uso del complesso che modella i programmi

Una grande quantità di dati per quanto riguarda la struttura tridimensionale del dominio dell'ricevitore-associazione (RBD) della glicoproteina della punta SARS-CoV-2 è stata utilizzata nel loro approccio della ricerca. Ciò è stata accoppiata con i dati sulla struttura tridimensionale di sei anticorpi di neutralizzazione conosciuti per legare alla glicoproteina della punta del virus.

La struttura del mutante è stata preveduta con l'uso del programma della chiave. In breve, la chiave utilizza i frammenti strutturali per generare un modello ibrido interrogando un database dei frammenti strutturali (soprattutto che contano sulla geometria dei punti finali dello spazio).

Per concludere, i ricercatori hanno valutato le caratteristiche obbligatorie del mutante virale della glicoproteina Y453F della punta all'enzima di conversione dell'angiotensina umano 2 (ACE2) ed hanno valutato la sua affinità a sei anticorpi monoclonali di neutralizzazione che impiegano il MOE che modella il visualizzatore macromolecolare della struttura di Cn3D e di programma.

Interazioni fra il mutante di RBD e di RBD Y453F nella glicoproteina della punta di SARS-CoV-2 ed in catena pesante di neutralizzazione dell
Interazioni fra il mutante di RBD e di RBD Y453F nella glicoproteina della punta di SARS-CoV-2 ed in catena pesante di neutralizzazione dell'anticorpo monoclonale (CC12.2). (A) L'interazione fra l'enzima di conversione dell'angiotensina 2 (ACE2) (verde) ed i residui del dominio convenzionale dell'ricevitore-associazione (RBD) o di mutante di RBD Y453F (porpora) è indicata facendo uso del modello di struttura tridimensionale. È speculato che il residuo dell'amminoacido Y453 del RBD convenzionale è idrogeno-tenuto da adesivo al residuo dell'amminoacido H34 di ACE2 umano. Tuttavia, l'associazione fra il residuo dell'amminoacido F453 del RBD mutante ed il residuo dell'amminoacido H34 di ACE2 umano è presunta per essere leggermente debole. Da questi risultati, l'affinità fra la glicoproteina della punta del RBD ACE2 mutante ed umano di Y453F è presunta per essere leggermente debole rispetto al RBD convenzionale. (B) l'interazione fra la catena pesante (porpora) e la catena leggera (marrone) di neutralizzazione l'anticorpo monoclonale CC12.1 e dei residui del mutante convenzionale di RBD o di RBD Y453F (verde) è indicata facendo uso del modello di struttura tridimensionale. È speculato che il residuo dell'amminoacido Y453 del RBD convenzionale è idrogeno-tenuto da adesivo al residuo dell'amminoacido D92 del residuo dell'amminoacido D97 e della catena leggera della catena pesante di neutralizzazione dell'anticorpo monoclonale CC12.1. Tuttavia, l'associazione fra il residuo dell'amminoacido F453 del RBD mutante ed i residui dell'amminoacido D92 e D97 di neutralizzazione dell'anticorpo monoclonale CC12.1 è presunta per essere debole. Da questi risultati, l'affinità fra la glicoproteina della punta del mutante di RBD Y453F e l'anticorpo monoclonale di neutralizzazione CC12.1 è presunta in basso per essere paragonata al RBD convenzionale. I modelli di struttura tridimensionali sono indicati dal visualizzatore macromolecolare della struttura di Cn3D.

Rilevazione d'evasione dell'anticorpo

In breve, la mutazione di Y453F non ha avuta un impatto sulla struttura tridimensionale delle glicoproteine convenzionali della punta SARS-CoV-2. Inoltre, lo studio ha indicato che l'associazione mutante della glicoproteina Y453F della punta a ACE2 umano era piuttosto più debole rispetto alla glicoproteina convenzionale della punta SARS-CoV-2.

Inoltre, questo studio ha dimostrato che l'affinità fra il mutante della glicoproteina Y453F della punta ed i quattro dei sei anticorpi monoclonali provati era chiaramente debole una volta confrontata alla glicoproteina convenzionale della punta SARS-CoV-2, suggerente che questa mutazione potesse essere usata per sfuggire alla rilevazione dagli anticorpi di neutralizzazione.

Di conseguenza, è pensato che l'affinità fra i residui corrispondenti dell'amminoacido nella regione variabile dell'anticorpo e la glicoproteina della punta del mutante di Y453F SARS-CoV-2 abbia fatto diminuire dovuto il riconoscimento insufficiente dell'anticorpo monoclonale alle glicoproteine della punta.

Visoni come causa potenziale di nuova onda contagiosa

Catturando questi risultati in considerazione, dobbiamo considerare che i dati su tutti i mutanti SARS-CoV-2 finora non sono stati pubblicati. Quindi, è ancora un puzzle se i mutanti SARS-CoV-2 nella gente che lavora alle aziende agricole del visone realmente provengono dai visoni coltivati.

Tuttavia, in questo studio, le sottospeci di SARS-CoV2 che è stato derivato dai visoni coltivati realmente sono state individuate nel gruppo di persone infettate, rinforzante l'ipotesi implicanti questa via della trasmissione.

“Le mutazioni in SARS-CoV-2 che piombo alla generazione di sottospecie SARS-CoV-2 hanno reso gli esseri umani e gli animali suscettibili dell'infezione con la propagazione facile nel host, quindi rendente la difficile identificare gli effetti degli agenti o dei vaccini terapeutici per COVID-19„, accentuano gli autori di studio in questo documento del bioRxiv.

Comunque, le varianti SARS-CoV-2 in milioni di visone coltivato infettato sono basicamente incontrollate, che è una ragione valida per preoccupazione che l'infezione con i mutanti SARS-CoV-2 può causare i sintomi seri in esseri umani e suscitare un'altra onda della pandemia COVID-19 se non siamo attenti e vigilanti.

Avviso *Important

il bioRxiv pubblica i rapporti scientifici preliminari che pari-non sono esaminati e, pertanto, non dovrebbero essere considerati conclusivi, guida la pratica clinica/comportamento correlato con la salute, o trattato come informazioni stabilite.

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Dr. Tomislav Meštrović

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Dr. Tomislav Meštrović

Dr. Tomislav Meštrović is a medical doctor (MD) with a Ph.D. in biomedical and health sciences, specialist in the field of clinical microbiology, and an Assistant Professor at Croatia's youngest university - University North. In addition to his interest in clinical, research and lecturing activities, his immense passion for medical writing and scientific communication goes back to his student days. He enjoys contributing back to the community. In his spare time, Tomislav is a movie buff and an avid traveler.

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