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O resumo “megapools” podia ajudar a determinar jogos de célula T da imunidade do papel em COVID-19

Os pesquisadores nos Estados Unidos e na Austrália conduziram uma análise detalhada dos testes padrões do reconhecimento do resumo associados com a infecção do coronavirus 2 da Síndrome Respiratória Aguda Grave (SARS-CoV-2) nos seres humanos.

O vírus SARS-CoV-2 é responsável para a pandemia da doença 2019 do coronavirus (COVID-19) que tem actualmente cientistas competir para desenvolver vacinas eficazes e terapias antivirosas.

A equipe - do instituto de La Jolla para a imunologia (LJI) em Califórnia, na Universidade da California San Diego (UCSD), e na universidade de Murdoch, Perth - centenas identificadas de antígeno humano da leucócito (HLA) classifica I e resumos Ii-restritos da classe SARS-CoV-2-derived de HLA. O estudo revelou os testes padrões distintos do immunodominance SARS-CoV-2 que diferiram entre pilhas de T de CD4+, pilhas de T de CD8+, e anticorpos.

Alessandro Sette e colegas diz que a seu conhecimento, nenhum estudo até agora descreveu o repertório dos resumos SARS-CoV-2 de célula T de CD4+ e de CD8+ com um nível comparável de granulosidade ou de largura.

A equipe combinou estes resumos para criar o resumo novo “megapools” que pode ser usado para medir respostas de célula T vírus-específicas de CD4+ e de CD8+ e poderia facilitar a pesquisa no papel que a imunidade de célula T joga na infecção SARS-CoV-2 e no COVID-19.

Uma versão da pré-impressão do papel está disponível no server do bioRxiv*, quando o artigo se submeter à revisão paritária.

As respostas de célula T parecem modular a severidade COVID-19

O curso da doença que segue a infecção SARS-CoV-2 é altamente variável, variando de suave ou mesmo assintomático, à pneumonia viral severa, a aflição e o multi-órgão respiratórios danificam.

Um corpo crescente da evidência aponta às respostas de célula T de SARS-CoV-2-specific como os moduladores chaves desta severidade da doença. COVID-19 suave estêve associado com o anticorpo coordenado, o t cell de CD4+ e as respostas de célula T de CD8+, quando os casos severos forem associados com uma falta da coordenação em respostas celulares e do anticorpo.

Até agora, a maioria de estudos que apontam traçar o papel que o jogo de célula T das respostas usou associam-se dos peptides previstos ou de sobreposições que medem a seqüência dos antígenos SARS-CoV-2 diferentes. Contudo, os resumos de célula T exactos e as regiões immunodominant do antígeno envolvidos não foram determinados inteiramente.

“Definir um conjunto abrangente de especificidades do resumo é importante por vários motivos,” escreve os pesquisadores.

Por exemplo, a capacidade para determinar se determinadas regiões dentro dos antígenos SARS-CoV-2 diferentes são immunodominant seria chave a assegurar construções vacinais não somente para incluir as regiões visadas neutralizando anticorpos, mas igualmente àqueles capazes de entregar suficientes respostas de célula T.

Além disso, uma avaliação detalhada dos resumos de SARS-CoV-2-derived restringidos por um grupo de HLAs diferente que são diversos através da população geral ajudaria a assegurar-se de que resultados do estudo fosse que se pode generalizar às afiliações étnicas diferentes.

Que os pesquisadores fizeram?

Para identificar o teste padrão do immunodominance através dos vários antígenos SARS-CoV-2 e determinar respostas de célula T de CD4+ e de CD8+ ao vírus, a equipe estudou respostas de célula T resumo-específicas usando as amostras mononuclear da pilha do sangue (PBMC) periférico tomadas de 99 doadores COVID-19 convalescentes adultos.

O proteome SARS-CoV-2 foi sondado usando 1.925 peptides de sobreposição diferentes que mediram o genoma viral inteiro, para assegurar a cobertura imparcial dos alelos diferentes da classe II de HLA expressados através da coorte do estudo.

Para a classe de HLA eu, a equipe seleccionei as 5.600 pastas previstas adicionais para a classe proeminente de 28 HLA mim alelos, representando 98,8% da classe de HLA mim cobertura no mundo inteiro.

“Nós não estamos cientes de nenhum estudo que descrever o repertório dos resumos de célula T de CD4+ e de CD8+ reconhecidos na infecção SARS-CoV-2 com um nível comparável de granulosidade ou de largura,” escrevemos a equipe.

Que encontraram?

Os pesquisadores identificaram várias centenas resumos HLA-restritos de SARS-CoV-2-derived. Observaram os testes padrões claros do immunodominance que diferiram entre pilhas de T de CD4+, pilhas de T de CD8+, e anticorpos.

Um número limitado de antígenos esclarecido em torno de 80% da resposta e do macacão totais, os mesmos antígenos era dominante para respostas de CD4+ e de CD8+.

Contudo, a capacidade de ligação de HLA era uma causa determinante principal da imunogenicidade para pilhas de T de CD4+.

“Ligar às variações allelic múltiplas de HLA é um mecanismo importante para amplificar a imunogenicidade potencial de resumos do peptide e regiões específicas dentro de um antígeno,” diz Sette e colegas.

Em seguida, a equipe projectou as regiões dominantes de célula T de CD4+ em estruturas conhecidas ou previstas da proteína SARS-CoV-2. Isto revelou que as regiões dominantes do resumo são diferentes para pilhas de B e de T.

“Isto é da importância para a revelação vacinal, como a inclusão das subregiões do antígeno selecionadas com base no domínio para a reactividade do anticorpo pôde conduzir a um imunogénio desprovido da suficiente actividade de célula T de CD4+,” escreve a equipe.

Ao contrário das regiões dominantes claramente distintas observadas para respostas do t cell e do anticorpo de CD4+, os resumos de célula T de CD8+ foram distribuídos uniformemente durante todo os vários antígenos, sugerindo pouco efeito posicional na distribuição de célula T do resumo de CD8+.

“No caso das respostas de célula T de CD8+, nossos dados destacam diferenças específicas do HLA-alelo na freqüência e o valor das respostas,” escreve a equipe. “Nosso estudo fornece um mapa rodoviário para a inclusão de regiões específicas ou de resumos discretos, para permitir a representação de célula T do resumo de CD8+ através de uma variedade de HLAs diferente.”

Combinando os resumos em megapools

Totais, estas experiências identificaram um total de 280 CD4+ e de 454 resumos de célula T de CD8+, que os pesquisadores combinaram em megapools novos do resumo para facilitar a identificação e a quantificação de pilhas de SARS-CoV-2-specific CD4+ e de T de CD8+.

Nós planeamos fazer estas associações do resumo disponíveis à comunidade científica at large, e esperamos que facilitarão a posterior investigação do papel da imunidade de célula T na infecção SARS-CoV-2 e no COVID-19,” dizemos Sette e colegas.

Os pesquisadores antecipam que os resultados do estudo serão do valor significativo para que ajudar compreenda respostas imunes à infecção SARS-CoV-2 e para desenvolver diagnósticos T-pilha-baseados.

“Além, os resultados derramam a luz nos mecanismos do immunodominance de SARS-CoV-2, que têm implicações para interacções compreensivas do anfitrião-vírus, assim como para o projecto vacinal,” concluem.

Observação *Important

o bioRxiv publica os relatórios científicos preliminares que par-não são revistos e, não devem conseqüentemente ser considerados como conclusivos, guia a prática clínica/comportamento saúde-relacionado, ou tratado como a informação estabelecida.

Journal reference:
Sally Robertson

Written by

Sally Robertson

Sally first developed an interest in medical communications when she took on the role of Journal Development Editor for BioMed Central (BMC), after having graduated with a degree in biomedical science from Greenwich University.

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